Gen
ALDH7A1
aldehyde dehydrogenase 7 family member A1
- HGNC 877↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000164904↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 501↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 5q23.2
- Współrzędne
- Chromosom 5: 126 541 841–126 595 219 (GRCh38)
- Eksony
- 18 eksonów na odcinku 53,4 kb
- Białko
- 539 aminokwasów
- Znany również jako
- EPD, PDE
- Poprzednie symbole
- ATQ1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000409134.8NM_001182.5
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/aldh7a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj ALDH7A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 6 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu ALDH7A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,8 kb z 53,4 kb genu; 1620 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie ALDH7A1
1Niski
Jak trudno sekwencjonować ALDH7A1 krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych ALDH7A1 w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0,6%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.4,9%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.1,9%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
164
pozycje w ALDH7A1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
3 z nich (1,8%) przypada na regiony, które krótkie odczyty trudno odnajdują.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (3 miejsc)
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 53,4 kb ALDH7A1, łącznie z intronami, a nie tylko 4,8 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Wspólne schorzenie: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Wspólne schorzenie: 1
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 2Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem ALDH7A1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać ALDH7A1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Clonic seizure
- Epilepsy
- Grand mal seizures
- Delayed speech and language development
- EEG with burst suppression
- Early onset absence seizures
- EEG with generalized slow activity
- Focal aware motor seizure
Pokaż jeszcze 21 cech
- Irritability
- Neurodevelopmental delay
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Brain degeneration
- Delayed CNS myelination
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with generalized sharp slow waves
- Epileptic spasm
- Focal myoclonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Intellectual disability
- Multifocal epileptiform discharges
- Restlessness
- Sudden loss of muscle tone
- Ventriculomegaly
- Widened subarachnoid space
- Generalized myoclonic seizure
- Global developmental delay
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen ALDH7A1: aldehyde dehydrogenase 7 family member A1. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/aldh7a1
Dante Labs. Gen ALDH7A1: aldehyde dehydrogenase 7 family member A1 [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/aldh7a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni