Geen
MECP2
methyl-CpG binding protein 2
- HGNC 6990↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000169057↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 4204↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- Xq28
- Koordinaadid
- Kromosoom X: 154 021 573–154 097 717 (GRCh38)
- Eksonid
- 3 eksonit, ulatus 76,1 kb
- Valk
- 498 aminohapet
- Pärilikkus
- X-seotud dominantne X-seotud retsessiivne
- Varasemad tähised
- RTT, MRX16, MRX79
- MANE Select transkript
- ENST00000453960.7NM_001110792.2
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe MECP2 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Rettov sündroom ja MECP2-ga seotud häired
- Rettov sündroomX-seotud dominantne
MECP2 variantidest põhjustatud neuroarenguline häire, mis tekib tavaliselt de novo, millega kaasneb kõne- ja käeoskuste taandareng, stereotüüpsed käeliigutused, hingamishäired ja krambid.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Multidistsiplinaarne ravi, sealhulgas krampide, hingamise, skolioosi ja toitumise juhtimine; trofinetiid on FDA poolt Rettovi sündroomi raviks heaks kiidetud.
- MECP2 duplikatsioonisündroom (Lubsi tüüp, X-seotud intellektipuue)X-seotud retsessiivne
Peamiselt poisse mõjutav X-seotud häire, mida põhjustab MECP2 duplikatsioon. Esinevad intellektipuue, madal lihastoonus, krambid ja korduvad infektsioonid.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Krampide ja infektsioonide juhtimine ning geneetiline nõustamine emadele, kes on sageli haigusnähtudeta kandjad.
- Raske vastsündinueaga algav entsefalopaatia koos mikrotsefaaliaga (MECP2)
Poistel MECP2 variantidest põhjustatud raske varajases eas algav entsefalopaatia, millega kaasnevad väike peaümbermõõt, hingamisprobleemid ja krambid.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Epilepsia (täielik paneel)
- Epilepsia
Üks 171 sellega seotud geenist
Ajuhaigus, mida iseloomustavad ebanormaalselt suurenenud neuronite aktiivsuse episoodid, mis põhjustavad ajutisi sensoorse või motoorse neuroloogilise talitlushäire või psüühilise talitlushäire episoode. Need episoodid võivad olla seotud teadvuse kaotuse või krampidega, aga ei pruugi.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Intellektipuue
Üks 233 sellega seotud geenist
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- X-seotud dominantne
- Muutus on X-kromosoomis ja üks koopia on piisav. Muutuse kandev ema annab selle igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega; isa annab selle kõigile oma tütardele ja ühelegi pojale ei anna.
- X-seotud retsessiivne
- Muutus on X-kromosoomis, seega mõjutab üks koopia isaseid, kellel on üks X-kromosoom, samas kui ühe koopiaga emased on tavaliselt kandjad. Kandjast ema annab selle igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas MECP2 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 10,3 kb kogupikkusega 76,1 kb; neist 1497 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse MECP2
460
kohad geenis MECP2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni MECP2 76,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (10,3 kb).
Variandid, millel on leht (45)
Siin on MECP2 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A143D | c.428C>A | Ekson 3 | 154 031 436 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A291V | c.872C>T | Ekson 3 | 154 030 992 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| c.1A>T | Ekson 1 | 154 097 665 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.62+1G>A | Intron 1 | 154 097 603 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.62+2T>G | Intron 1 | 154 097 602 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.408G>T | Ekson 2 | 154 032 212 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.414-3C>G | Intron 2 | 154 031 453 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| D163G | c.488A>G | Ekson 3 | 154 031 376 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| D168G | c.503A>G | Ekson 3 | 154 031 361 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| F169I | c.505T>A | Ekson 3 | 154 031 359 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Jagab 2 haigust
- ATP6AP2ATPase H+ transporting accessory protein 2Jagab 2 haigust
- FGF13fibroblast growth factor 13Jagab 2 haigust
- GRIN1glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 1Jagab 2 haigust
- GRIN2Bglutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2BJagab 2 haigust
- NACC1nucleus accumbens associated 1Jagab 2 haigust
- NUS1NUS1 dehydrodolichyl diphosphate synthase subunitJagab 2 haigust
- OTUD6BOTU deubiquitinase 6BJagab 2 haigust
- PCDH19protocadherin 19Jagab 2 haigust
- SCN2Asodium voltage-gated channel alpha subunit 2Jagab 2 haigust
- SEMA6Bsemaphorin 6BJagab 2 haigust
- ST3GAL3ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 3Jagab 2 haigust
Geeniga MECP2 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida MECP2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Apraxia
- Brief seizures with staring spells
- Delayed ability to roll over
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Dystonia
Näita veel 95 tunnust
- Encephalopathy
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
- Intellectual disability, severe
- IQ less than 20
- Loss of developmental milestones
- Persistent head lag
- Poor eye contact
- Progressive degeneration of movement
- Repeated seizures without recovery between them
- Repetitive compulsive behavior
- Resting tremor
- Restlessness
- Severe global developmental delay
- Slow movements
- Stereotypical hand wringing
- Tonic seizure
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Agitation
- Autism spectrum disorder
- Chorea
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Involuntary movements
- Irritability
- Loss of acquired spoken language
- Loss of speech
- More active than typical
- Progressive language deterioration
- Recurrent hand flapping
- Repetitive movements
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Bipolar disorder
- Choreoathetosis
- EEG with focal slow activity
- EEG with generalized slow activity
- Focal EEG discharges with secondary generalization
- Grand mal seizures
- Hand apraxia
- Inability to coordinate movements when walking
- Inability to speak
- Inability to walk
- IQ between 34 and 49
- Limb apraxia
- Limb myoclonus
- Loss of ability to walk
- Loss of acquired purposeful hand skills
- Neonatal seizure
- Overactive lower leg reflex
- Pain insensitivity
- Poor social interactions
- Restrictive behavior
- Teeth grinding
- Tongue thrusting
- Tremor
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormal fear-induced behavior
- Can't control feelings
- Degeneration of cerebrum
- Delayed motor skills
- Depression
- Developmental stagnation
- Generalized myoclonic seizure
- Impaired pain sensation
- Inappropriate crying
- Inappropriate laughter
- Infantile spasms
- More grooves in brain
- Multifocal epileptiform discharges
- Panic attack
- Parkinsonism
- Pill-rolling tremor
- Psychosis
- Shuffled walk
- Stooped posture
- Wide based walk
- Ataxia
- Autism
- Babinski sign
- Boiling mad
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Gait apraxia
- Impaired use of nonverbal behaviors
- Increased reflexes
- Inflexible adherence to routines
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Jerking
- Lack of peer relationships
- Lack of spontaneous play
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Decreased facial muscle tone
- Drooling
- Zygomatic flattening
- Drooping lower lip
- Eye folds
- Narrow opening between the eyelids
- Progressively abnormally small cranium
Näita veel 23 tunnust
- Tented mouth
- Development of small head that was not present at birth
- Midface retrusion
- Abnormal color of the oral mucosa
- Abnormality of salivation
- Big calvaria
- Broad head shape
- High palate
- Inflammation of the lips
- Mouth sore
- Nasal tip, upturned
- Prominent nasal bridge
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Widely spaced teeth
- Small head present at birth
- Abnormal dentition
- Depressed nasal bridge
- Disturbance of facial expression
- Excessive salivation
- Little lower jaw
- Narrow mouth
- Short neck
Abnormality of the musculoskeletal system
- Decreased muscle tone in infant
- Flexed joint that cannot be straightened
- Low muscle tone
- Low muscle tone in trunk
- Scoliosis
- Spastic paraplegia
- Spastic tetraplegia
- Delayed bone maturation
Näita veel 16 tunnust
- Functional motor deficit
- Lower limb spasticity
- Abnormal muscle tone
- Arthritis
- Funnel chest
- Generalized low muscle tone in neonate
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Muscle degeneration
- Polyarticular arthritis
- Hunched back
- Joint stiffness
- Kyphoscoliosis
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Progressive spasticity
- Rigidity
- Spastic walk
Abnormality of the immune system
- Severe infection
- Antinuclear antibody positivity
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Decreased circulating complement C4 concentration
Näita veel 12 tunnust
- Malar rash
- Recurrent infections
- Recurrent respiratory infections
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Serositis
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Anorexia
- Acid reflux
- Chronic constipation
- Constipation
- Functional abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrostomy tube feeding in infancy
- Hernia of the abdominal wall
Näita veel 4 tunnust
Laboratory abnormality
- Fever
- High urine protein levels
- Blood in urine
- High urine neutrophil count
- Abnormal CSF pyruvate family amino acid concentration
- High blood ammonia levels
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased circulating pyruvate concentration
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). MECP2 geen: methyl-CpG binding protein 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/mecp2
Dante Labs. MECP2 geen: methyl-CpG binding protein 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/mecp2
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast