Geen
L1CAM
L1 cell adhesion molecule
- HGNC 6470↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000198910↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 3897↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- Xq28
- Koordinaadid
- Kromosoom X: 153 861 516–153 886 173 (GRCh38)
- Eksonid
- 29 eksonit, ulatus 24,7 kb
- Valk
- 1257 aminohapet
- Tuntud ka kui
- CD171, NCAM-L1, CAML1
- Varasemad tähised
- HSAS1, SPG1, HSAS, MASA, MIC5, S10
- MANE Select transkript
- ENST00000370060.7NM_001278116.2
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe L1CAM ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Pärilik spastiline paraplegia
- Pärilik spastiline paraplegia (kõik tüübid)
Üks 66 sellega seotud geenist
Üldmõiste, mis hõlmab kõiki pärilikke spastilisi paraplegiaid, sealhulgas SPG4 (SPAST), mis on kõige levinum domineeriv vorm, ning SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ja SPG31.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Kuidas L1CAM on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 5,1 kb kogupikkusega 24,7 kb; neist 3774 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse L1CAM
90
kohad geenis L1CAM, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni L1CAM 24,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (5,1 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Jagab 1 haigust
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseJagab 1 haigust
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Jagab 1 haigust
- AMFRautocrine motility factor receptorJagab 1 haigust
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Jagab 1 haigust
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Jagab 1 haigust
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Jagab 1 haigust
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Jagab 1 haigust
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Jagab 1 haigust
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Jagab 1 haigust
- ATL1atlastin GTPase 1Jagab 1 haigust
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Jagab 1 haigust
Geeniga L1CAM seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida L1CAM võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormal gait
- Aqueductal stenosis
- Delayed speech and language development
Näita veel 22 tunnust
- Difficulty finding words
- Epilepsy
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- Paralysis or weakness of one side of body
- Rise in pressure inside skull
- Cognitive impairment
- Intellectual disability, mild
- IQ between 34 and 49
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Small cerebellum
- Upper motor neuron dysfunction
- Absent septum pellucidum
- Agenesis of corpus callosum
- Ataxia
- Holoprosencephaly
- Mental deterioration
- Corticospinal tract hypoplasia
- Inferior cerebellar vermis hypoplasia
- Interhemispheric cyst
- Leg paralysis
- Shuffled walk
Abnormality of limbs
- Dropped arches
- Thumb contracture
- Hand clenching
- Curvature of little finger
- Dislocated radial head
- Inward turned thumb
- Lower limb muscle weakness
- Permanent flexion of the finger
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). L1CAM geen: L1 cell adhesion molecule. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/l1cam
Dante Labs. L1CAM geen: L1 cell adhesion molecule [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/l1cam
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast