Gen
ABCD1
ATP binding cassette subfamily D member 1
- HGNC 61↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000101986↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 215↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xq28
- Souřadnice
- Chromozom X: 153 724 856–153 744 755 (GRCh38)
- Exony
- 10 exonů na 19,9 kb
- Protein
- 745 aminokyselin
- Dědičnost
- X-vázaně recesivní
- Další názvy
- AMN, ALDP, adrenoleukodystrophy
- Předchozí symboly
- ALD
- Transkript MANE Select
- ENST00000218104.6NM_000033.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si ABCD1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
X-Linked Adrenoleukodystrophy (ABCD1)
- X-linked adrenoleukodystrophy (including adrenomyeloneuropathy)X-vázaně recesivní
ABCD1 changes cause a range of presentations in males, from adrenal insufficiency and slowly progressive spinal cord disease (adrenomyeloneuropathy) to a rapidly progressive cerebral form in childhood; many female carriers develop milder spinal cord symptoms in adulthood.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Boys with an ABCD1 change are offered regular brain MRI and adrenal testing so that stem cell transplantation or gene therapy can be considered while cerebral disease is still early, and adrenal insufficiency can be treated.
Širší skupiny
Hereditary Spastic Paraplegia
- Hereditary Spastic Paraplegia (All Types)
Jeden z 66 genů spojených s touto vazbou
Umbrella term covering all hereditary spastic paraplegias, including SPG4 (SPAST), the most common dominant form, and SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 and SPG31.
- 1 zadavatel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Other Inherited Leukodystrophies
- Leukodystrophy (other and unspecified types)
Jeden z 80 genů spojených s touto vazbou
Inherited conditions that damage or prevent the normal formation of myelin, the white matter of the brain and spinal cord. Different types follow autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance depending on the gene involved.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 6 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing the specific genetic cause can end a diagnostic search, guide supportive care and surveillance, show whether a specific treatment exists, and allow testing of relatives.
Dědičnost
- X-vázaně recesivní
- Změna je na chromozomu X, takže jedna kopie ovlivní muže, kteří mají jeden chromozom X, zatímco ženy s jednou kopií bývají nositelkami. Matka nositelka ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je ABCD1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 3,7 kb z 19,9 kb genu; 2 238 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte ABCD1
400
pozic v genu ABCD1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 100 (25 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (56 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (100 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 19,9 kb genu ABCD1, včetně intronů, nikoli jen 3,7 kb exonů.
Varianty se stránkou (17)
Varianty genu ABCD1 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A95D | c.284C>A | Exon 1 | 153 725 550 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.-18_8del | Exon 1 | 153 725 248 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.1A>G | Exon 1 | 153 725 267 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.346G>C | Exon 1 | 153 725 612 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.900+2T>A | Intron 1 | 153 726 168 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.900+2T>C | Intron 1 | 153 726 168 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.900+2T>G | Intron 1 | 153 726 168 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| G116R | c.346G>A | Exon 1 | 153 725 612 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| K217E | c.649A>G | Exon 1 | 153 725 915 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| Q544R | c.1631A>G | Exon 6 | 153 740 234 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- GJC2gap junction protein gamma 2Sdílí 2 onemocnění
- HSPD1heat shock protein family D (Hsp60) member 1Sdílí 2 onemocnění
- PLP1proteolipid protein 1Sdílí 2 onemocnění
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialSdílí 1 onemocnění
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseSdílí 1 onemocnění
- ACER3alkaline ceramidase 3Sdílí 1 onemocnění
- ADARadenosine deaminase RNA specificSdílí 1 onemocnění
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Sdílí 1 onemocnění
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Sdílí 1 onemocnění
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Sdílí 1 onemocnění
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s ABCD1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit ABCD1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of peripheral nervous system electrophysiology
- Abnormality of the spinal cord
- Axonal degeneration
- CNS demyelination
- Decreased sensation in extremities
- Diffuse demyelination of the cerebral white matter
- Global developmental delay
- Mental deterioration
Zobrazit ještě 56 rysů
- Myelopathy
- Peripheral axonal degeneration
- Peripheral neuropathy
- Abnormal brainstem white matter morphology
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Atrophy/Degeneration involving the corticospinal tracts
- Babinski sign
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Cerebral dysmyelination
- Degeneration of the spinal cord
- Delayed somatosensory central conduction time
- Dorsal column degeneration
- Epilepsy
- Generalized brain degeneration
- Increased reflexes
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Peripheral axonal neuropathy
- Specific learning disability
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Apraxia
- Astereognosis
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Confusion
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty articulating speech
- Dysesthesia
- Dystonia
- Generalized hyperreflexia
- Hoffmann sign
- Impaired visuospatial constructive cognition
- Lack of coordination of movement
- Limb myoclonus
- Memory impairment
- More active than typical
- Short attention span
- Ventriculomegaly
- Visual agnosia
- Weakness of one side of body
- Inability to walk
- Vegetative state
- Attention deficit
- Dementia
- Impaired vibration sensation at ankles
- Incoordination
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Limb ataxia
- Loss of speech
- Ongoing loss of nerve cells
- Partial paralysis of legs
- Peripheral nerve disease
- Psychosis
- Slurred speech
Abnormality of the musculoskeletal system
- Progressive spastic paraparesis
- Functional motor deficit
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Spastic walk
- Back pain
- Hamstring contractures
- Lower limb spasticity
- Spastic tetraparesis
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal erection
- Abnormal libido
- Female sexual dysfunction
- Male sexual dysfunction
- Urinary bladder sphincter dysfunction
- Loss of bladder control
- Urinary retention
- Urinary urgency
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen ABCD1: ATP binding cassette subfamily D member 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/abcd1
Dante Labs. Gen ABCD1: ATP binding cassette subfamily D member 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/abcd1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů