Gen
HSPD1
heat shock protein family D (Hsp60) member 1
- HGNC 5261↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000144381↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 3329↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 2q33.1
- Souřadnice
- Chromozom 2: 197 486 584–197 499 840 (GRCh38)
- Exony
- 12 exonů na 13,3 kb
- Protein
- 573 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní Autozomálně recesivní
- Další názvy
- GroEL, HSP60
- Předchozí symboly
- SPG13
- Transkript MANE Select
- ENST00000388968.8NM_002156.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si HSPD1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Hereditary Spastic Paraplegia
- Hereditary Spastic Paraplegia 13Autozomálně dominantní
Any hereditary spastic paraplegia in which the cause of the disease is a mutation in the HSPD1 gene.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Hereditary Spastic Paraplegia (All Types)
Jeden z 66 genů spojených s touto vazbou
Umbrella term covering all hereditary spastic paraplegias, including SPG4 (SPAST), the most common dominant form, and SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 and SPG31.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Pelizaeus-Merzbacher Disease & Hypomyelinating Leukodystrophies
- Pelizaeus-Merzbacher-like disease (GJC2 and others)Autozomálně recesivní
A condition that closely resembles Pelizaeus-Merzbacher disease, most often caused by changes in GJC2, with early nystagmus, delayed development and later spasticity.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Other Inherited Leukodystrophies
- Leukodystrophy (other and unspecified types)
Jeden z 80 genů spojených s touto vazbou
Inherited conditions that damage or prevent the normal formation of myelin, the white matter of the brain and spinal cord. Different types follow autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance depending on the gene involved.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing the specific genetic cause can end a diagnostic search, guide supportive care and surveillance, show whether a specific treatment exists, and allow testing of relatives.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je HSPD1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2,2 kb z 13,3 kb genu; 1 722 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte HSPD1
4
pozic v genu HSPD1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 1 (25 %) leží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
- Segmental duplications (1 místo)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 13,3 kb genu HSPD1, včetně intronů, nikoli jen 2,2 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- GJC2gap junction protein gamma 2Sdílí 3 onemocnění
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Sdílí 2 onemocnění
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Sdílí 2 onemocnění
- PLP1proteolipid protein 1Sdílí 2 onemocnění
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialSdílí 1 onemocnění
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseSdílí 1 onemocnění
- ACER3alkaline ceramidase 3Sdílí 1 onemocnění
- ADARadenosine deaminase RNA specificSdílí 1 onemocnění
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Sdílí 1 onemocnění
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Sdílí 1 onemocnění
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s HSPD1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit HSPD1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen HSPD1: heat shock protein family D (Hsp60) member 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/hspd1
Dante Labs. Gen HSPD1: heat shock protein family D (Hsp60) member 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/hspd1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů