Gen
BCAP31
B cell receptor associated protein 31
- HGNC 16695↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000185825↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 10134↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xq28
- Souřadnice
- Chromozom X: 153 700 492–153 724 387 (GRCh38)
- Exony
- 8 exonů na 23,9 kb
- Protein
- 246 aminokyselin
- Další názvy
- DXS1357E, BAP31, 6C6-Ag, CDM
- Transkript MANE Select
- ENST00000345046.12NM_001256447.2
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/bcap31.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si BCAP31 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Dystonia, Myotonia, Paroxysmal Dyskinesia
- Inherited Dystonia
Umbrella term covering inherited dystonias, including DYT-TOR1A early-onset generalized dystonia, DYT-THAP1, myoclonus-dystonia (SGCE) and KMT2B-related dystonia.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 4 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je BCAP31 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,3 kb z 23,9 kb genu; 741 těchto bází kódují protein.
Sekvenování BCAP31
27Střední
Jak obtížně se BCAP31 sekvenuje krátkými čteními, ze 100Každý sloupec udává podíl exonových bází BCAP31 v dané obtížné oblasti. Skóre je váží podle toho, jak moc každá z nich ztěžuje volání krátkými čteními: 0, pokud žádná báze není v žádné takové oblasti, 100, pokud je každá báze ve všech těchto oblastech.
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.18 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, s identitou 90 % nebo vyšší. Váha 30 %.66 %
- RepeticeTandemové repetice a řetězce jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesahovat. Váha 15 %.5 %
- Obsah GCÚseky s obsahem G a C pod 25 % nebo nad 65 %, které příprava knihovny pokrývá jen slabě. Váha 10 %.6,8 %
- Pokrytí referenceMezery v okolní referenční sestavě, kam se krátké čtené úseky nemají kam zarovnat. Váha 10 %.0 %
4
pozic v BCAP31, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 4 (100 %) připadá na oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (1 místo)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (4 míst)
Celé genomové sekvenování pokrývá všech 23,9 kb genu BCAP31, včetně intronů, nejen 1,3 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACTBactin betaSdílí 1 onemocnění
- ANO3anoctamin 3Sdílí 1 onemocnění
- ARFGEF3ARFGEF family member 3Sdílí 1 onemocnění
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Sdílí 1 onemocnění
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainSdílí 1 onemocnění
- DCAF17DDB1 and CUL4 associated factor 17Sdílí 1 onemocnění
- GCH1GTP cyclohydrolase 1Sdílí 1 onemocnění
- GNALG protein subunit alpha LSdílí 1 onemocnění
- HPCAhippocalcinSdílí 1 onemocnění
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 10Sdílí 1 onemocnění
- KCTD17potassium channel tetramerization domain containing 17Sdílí 1 onemocnění
- KMT2Blysine methyltransferase 2BSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s BCAP31
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit BCAP31. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen BCAP31: B cell receptor associated protein 31. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/bcap31
Dante Labs. Gen BCAP31: B cell receptor associated protein 31 [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/bcap31
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů