Genas
ABCD1
ATP binding cassette subfamily D member 1
- HGNC 61↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000101986↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 215↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- Xq28
- Koordinatės
- Chromosoma X: 153 724 856–153 744 755 (GRCh38)
- Eksonai
- 10 eksonų per 19,9 kb
- Baltymas
- 745 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- X chromosomos recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- AMN, ALDP, adrenoleukodystrophy
- Ankstesni simboliai
- ALD
- MANE Select transkriptas
- ENST00000218104.6NM_000033.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite ABCD1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
X sujungtoji adrenoleukodistrofija (ABCD1)
- X sujungtoji adrenoleukodistrofija (įskaitant adrenomieloneuropatiją)X chromosomos recesyvinis
ABCD1 pokyčiai vyrams sukelia įvairių apraiškų: nuo antinksčių nepakankamumo ir lėtai progresuojančios nugaros smegenų ligos (adrenomieloneuropatijos) iki greitai progresuojančios vaikystės smegenų formos; daugelis moterų nešiotojų suaugusiems pasireiškia lengvesni nugaros smegenų simptomai.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 6 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Berniukams, turintiems ABCD1 pokytį, siūlomas reguliarus smegenų MRT tyrimas ir antinksčių tyrimai, kad, kol smegenų liga dar ankstyvoje stadijoje, būtų galima apsvarstyti kamieninių ląstelių transplantaciją ar genų terapiją, o antinksčių nepakankamumą – gydyti.
Platesnės grupės
Paveldima spastinė paraplegija
- Paveldimos spastinės paraplegijos (visi tipai)
Vienas iš 66 su juo susijusių genų
Bendras terminas, apimantis visas paveldimas spastines paraplegijas, įskaitant SPG4 (SPAST) – dažniausią dominuojančią formą – taip pat SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ir SPG31.
- 1 GenCC vertintojas įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ostatinės paveldimos leukodistrofijos
- Leukodistrofija (kiti ir nenurodyti tipai)
Vienas iš 80 su juo susijusių genų
Paveldimos ligos, kurios pažeidžia mielino apvalkalą arba trukdo jam tinkamai susidaryti – smegenų ir nugaros smegenų baltąją medžiagą. Skirtingi tipai paveldimi autosominiu recesyviniu, autosominiu dominantiniu arba X chromosomos būdu, priklausomai nuo susijusio geno.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 6 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Žinodami konkrečią genetinę priežastį, galite nutraukti diagnostinę paiešką, gauti tinkamesnę palaikomąją priežiūrą ir stebėseną, sužinoti, ar yra konkretus gydymas, ir įvertinti giminaičių tikrinimo galimybes.
Paveldėjimas
- X chromosomos recesyvinis
- Pakitimas yra X chromosomoje, todėl viena kopija paveikia vyrus, turinčius vieną X, o moterys, turinčios vieną kopiją, paprastai yra nešiotojos. Nešiotoja motina perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
Kaip išdėstytas ABCD1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3,7 kb iš 19,9 kb geno; 2 238 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito ABCD1
400
ABCD1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 100 (25 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (56 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (100 vietų)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 19,9 kb ABCD1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 3,7 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (17)
Čia pateikiami ABCD1 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A95D | c.284C>A | Eksonas 1 | 153 725 550 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.-18_8del | Eksonas 1 | 153 725 248 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1A>G | Eksonas 1 | 153 725 267 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.346G>C | Eksonas 1 | 153 725 612 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.900+2T>A | Intronas 1 | 153 726 168 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.900+2T>C | Intronas 1 | 153 726 168 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.900+2T>G | Intronas 1 | 153 726 168 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| G116R | c.346G>A | Eksonas 1 | 153 725 612 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| K217E | c.649A>G | Eksonas 1 | 153 725 915 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| Q544R | c.1631A>G | Eksonas 6 | 153 740 234 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- GJC2gap junction protein gamma 2Turi 2 bendrų būklių
- HSPD1heat shock protein family D (Hsp60) member 1Turi 2 bendrų būklių
- PLP1proteolipid protein 1Turi 2 bendrų būklių
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Turi 1 bendrą būklę
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialTuri 1 bendrą būklę
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseTuri 1 bendrą būklę
- ACER3alkaline ceramidase 3Turi 1 bendrą būklę
- ADARadenosine deaminase RNA specificTuri 1 bendrą būklę
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Turi 1 bendrą būklę
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Turi 1 bendrą būklę
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Turi 1 bendrą būklę
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su ABCD1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti ABCD1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of peripheral nervous system electrophysiology
- Abnormality of the spinal cord
- Axonal degeneration
- CNS demyelination
- Decreased sensation in extremities
- Diffuse demyelination of the cerebral white matter
- Global developmental delay
- Mental deterioration
Rodyti dar 56 savybių
- Myelopathy
- Peripheral axonal degeneration
- Peripheral neuropathy
- Abnormal brainstem white matter morphology
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Atrophy/Degeneration involving the corticospinal tracts
- Babinski sign
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Cerebral dysmyelination
- Degeneration of the spinal cord
- Delayed somatosensory central conduction time
- Dorsal column degeneration
- Epilepsy
- Generalized brain degeneration
- Increased reflexes
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Peripheral axonal neuropathy
- Specific learning disability
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Apraxia
- Astereognosis
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Confusion
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty articulating speech
- Dysesthesia
- Dystonia
- Generalized hyperreflexia
- Hoffmann sign
- Impaired visuospatial constructive cognition
- Lack of coordination of movement
- Limb myoclonus
- Memory impairment
- More active than typical
- Short attention span
- Ventriculomegaly
- Visual agnosia
- Weakness of one side of body
- Inability to walk
- Vegetative state
- Attention deficit
- Dementia
- Impaired vibration sensation at ankles
- Incoordination
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Limb ataxia
- Loss of speech
- Ongoing loss of nerve cells
- Partial paralysis of legs
- Peripheral nerve disease
- Psychosis
- Slurred speech
Abnormality of the musculoskeletal system
- Progressive spastic paraparesis
- Functional motor deficit
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Spastic walk
- Back pain
- Hamstring contractures
- Lower limb spasticity
- Spastic tetraparesis
Rodyti dar 2 savybių
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal erection
- Abnormal libido
- Female sexual dysfunction
- Male sexual dysfunction
- Urinary bladder sphincter dysfunction
- Loss of bladder control
- Urinary retention
- Urinary urgency
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). ABCD1 genas: ATP binding cassette subfamily D member 1. Pasiekta 2026 m. spalio 16 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/abcd1
Dante Labs. ABCD1 genas: ATP binding cassette subfamily D member 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 16 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/abcd1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites