Gén
ABCD1
ATP binding cassette subfamily D member 1
- HGNC 61↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000101986↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 215↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- Xq28
- Koordináták
- X. kromoszóma: 153 724 856–153 744 755 (GRCh38)
- Exonok
- 10 exon, összesen 19,9 kb
- Fehérje
- 745 aminosav
- Öröklődés
- X-kromoszómához kötött recesszív
- Más néven ismert
- AMN, ALDP, adrenoleukodystrophy
- Korábbi jelölések
- ALD
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000218104.6NM_000033.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a ABCD1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
X-Linked Adrenoleukodystrophy (ABCD1)
- X-linked adrenoleukodystrophy (including adrenomyeloneuropathy)X-kromoszómához kötött recesszív
ABCD1 changes cause a range of presentations in males, from adrenal insufficiency and slowly progressive spinal cord disease (adrenomyeloneuropathy) to a rapidly progressive cerebral form in childhood; many female carriers develop milder spinal cord symptoms in adulthood.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 6 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Boys with an ABCD1 change are offered regular brain MRI and adrenal testing so that stem cell transplantation or gene therapy can be considered while cerebral disease is still early, and adrenal insufficiency can be treated.
Átfogóbb csoportosítások
Hereditary Spastic Paraplegia
- Hereditary Spastic Paraplegia (All Types)
A 66 hozzá kapcsolódó gén egyike
Umbrella term covering all hereditary spastic paraplegias, including SPG4 (SPAST), the most common dominant form, and SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 and SPG31.
- 1 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Other Inherited Leukodystrophies
- Leukodystrophy (other and unspecified types)
A 80 hozzá kapcsolódó gén egyike
Inherited conditions that damage or prevent the normal formation of myelin, the white matter of the brain and spinal cord. Different types follow autosomal recessive, autosomal dominant or X-linked inheritance depending on the gene involved.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 6 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Knowing the specific genetic cause can end a diagnostic search, guide supportive care and surveillance, show whether a specific treatment exists, and allow testing of relatives.
Öröklődési mód
- X-kromoszómához kötött recesszív
- A változás az X kromoszómán van, ezért egy másolat a férfiakat érinti, akiknek egy X kromoszómájuk van, míg a nőknél egy másolat általában hordozóságot jelent. A hordozó anya minden gyermekének 50%-os eséllyel adja tovább.
A ABCD1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 19,9 kb-jából 3,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2238 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) ABCD1 gént
400
pozíció a(z) ABCD1 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 100 (25%) olyan régiókba esik, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
- Low mappability (56 hely)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (100 hely)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genom a ABCD1 gén mind a 19,9 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 3,7 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (17)
Az itt található, oldallal rendelkező ABCD1 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A95D | c.284C>A | 1. exon | 153 725 550 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| c.-18_8del | 1. exon | 153 725 248 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.1A>G | 1. exon | 153 725 267 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.346G>C | 1. exon | 153 725 612 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.900+2T>A | 1. intron | 153 726 168 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.900+2T>C | 1. intron | 153 726 168 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.900+2T>G | 1. intron | 153 726 168 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| G116R | c.346G>A | 1. exon | 153 725 612 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| K217E | c.649A>G | 1. exon | 153 725 915 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| Q544R | c.1631A>G | 6. exon | 153 740 234 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- GJC2gap junction protein gamma 22 betegséget oszt meg
- HSPD1heat shock protein family D (Hsp60) member 12 betegséget oszt meg
- PLP1proteolipid protein 12 betegséget oszt meg
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial1 betegséget oszt meg
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipase1 betegséget oszt meg
- ACER3alkaline ceramidase 31 betegséget oszt meg
- ADARadenosine deaminase RNA specific1 betegséget oszt meg
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 11 betegséget oszt meg
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 21 betegséget oszt meg
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A11 betegséget oszt meg
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A21 betegséget oszt meg
A(z) ABCD1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) ABCD1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of peripheral nervous system electrophysiology
- Abnormality of the spinal cord
- Axonal degeneration
- CNS demyelination
- Decreased sensation in extremities
- Diffuse demyelination of the cerebral white matter
- Global developmental delay
- Mental deterioration
Még 56 tulajdonság megjelenítése
- Myelopathy
- Peripheral axonal degeneration
- Peripheral neuropathy
- Abnormal brainstem white matter morphology
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Atrophy/Degeneration involving the corticospinal tracts
- Babinski sign
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Cerebral dysmyelination
- Degeneration of the spinal cord
- Delayed somatosensory central conduction time
- Dorsal column degeneration
- Epilepsy
- Generalized brain degeneration
- Increased reflexes
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Peripheral axonal neuropathy
- Specific learning disability
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Apraxia
- Astereognosis
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Confusion
- Degeneration of cerebellum
- Difficulty articulating speech
- Dysesthesia
- Dystonia
- Generalized hyperreflexia
- Hoffmann sign
- Impaired visuospatial constructive cognition
- Lack of coordination of movement
- Limb myoclonus
- Memory impairment
- More active than typical
- Short attention span
- Ventriculomegaly
- Visual agnosia
- Weakness of one side of body
- Inability to walk
- Vegetative state
- Attention deficit
- Dementia
- Impaired vibration sensation at ankles
- Incoordination
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Limb ataxia
- Loss of speech
- Ongoing loss of nerve cells
- Partial paralysis of legs
- Peripheral nerve disease
- Psychosis
- Slurred speech
Abnormality of the musculoskeletal system
- Progressive spastic paraparesis
- Functional motor deficit
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Spastic walk
- Back pain
- Hamstring contractures
- Lower limb spasticity
- Spastic tetraparesis
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal erection
- Abnormal libido
- Female sexual dysfunction
- Male sexual dysfunction
- Urinary bladder sphincter dysfunction
- Loss of bladder control
- Urinary retention
- Urinary urgency
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). ABCD1 gén: ATP binding cassette subfamily D member 1. Lekérve: 2026. október 16., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/abcd1
Dante Labs. ABCD1 gén: ATP binding cassette subfamily D member 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 16.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/abcd1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt