Gène
NSD1
nuclear receptor binding SET domain protein 1
- HGNC 14234↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000165671↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 64324↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 5q35.3
- Coordonnées
- Chromosome 5 : 177 133 773–177 300 213 (GRCh38)
- Exons
- 23 exons sur 166,4 kb
- Protéine
- 2 696 acides aminés
- Hérédité
- Autosomique dominant
- Aussi appelé
- ARA267, FLJ22263, KMT3B
- Symboles précédents
- STO
- Transcrit MANE Select
- ENST00000439151.7NM_022455.5
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Troubles de l'empreinte parentale : Prader-Willi, Silver-Russell et Beckwith-Wiedemann
- Syndrome de Beckwith-Wiedemann
Trouble de surcroissance causé par des altérations de l'empreinte en 11p15 (et parfois par des variants de CDKN1C), pouvant entraîner une taille élevée à la naissance, une langue volumineuse, des anomalies de la paroi abdominale et un risque accru de tumeurs de l'enfance, telles que la tumeur de Wilms.
- 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Le diagnostic conduit à une surveillance tumorale pendant l'enfance, comprenant une échographie abdominale.
Syndromes de croissance excessive (Sotos, Weaver, Tatton-Brown-Rahman, Malan)
- Syndrome de SotosAutosomique dominant
Syndrome de croissance excessive causé par des variants ou des délétions de NSD1, avec une grosse tête, une haute taille pendant l'enfance, des traits faciaux caractéristiques et des difficultés d'apprentissage.
- ClinGen classe ce lien comme définitif
- 6 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
La connaissance de cette affection permet de surveiller les problèmes associés, notamment un risque légèrement accru de certaines tumeurs de l'enfance.
Regroupements plus larges
Cardiomyopathie hypertrophique
- Autosomique dominant
L'un des 62 gènes qui lui sont liés
Une affection dans laquelle le myocarde est hypertrophié sans cause évidente. L'hypertrophie est généralement asymétrique et peut être associée à une obstruction de la chambre de chasse ventriculaire.
- 1 soumetteur GenCC le classe comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Bêtabloquants, inhibiteurs calciques non-dihydropyridiniques, restriction d'activité physique, conseil génétique
Transmission
- Autosomique dominant
- Une copie modifiée, provenant de l'un ou l'autre parent, suffit. Un parent qui en porte une la transmet à chacun de ses enfants avec une probabilité de une sur deux.
Structure de NSD1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 13 kb sur les 166,4 kb du gène ; 8 091 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit NSD1
364
positions dans NSD1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 166,4 kb de NSD1, introns compris, et pas seulement les 13 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1CPartage 2 affections
- H19H19 imprinted maternally expressed transcriptPartage 2 affections
- IGF2insulin like growth factor 2Partage 2 affections
- NLRP5NLR family pyrin domain containing 5Partage 2 affections
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainPartage 1 affection
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Partage 1 affection
- ALPK3alpha kinase 3Partage 1 affection
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinasePartage 1 affection
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 3Partage 1 affection
- DHHdesert hedgehog signaling moleculePartage 1 affection
- DHX37DEAH-box helicase 37Partage 1 affection
- DMPKDM1 protein kinasePartage 1 affection
Traits associés à NSD1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que NSD1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Bad bite
- Big head present at birth
- Big lower jaw
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Broad nostril
- Dental crowding
Afficher 46 traits supplémentaires
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Excessive wear and tear on teeth
- Eye folds
- Frontal bossing
- High forehead
- High frontal hairline
- High palate
- Long, narrow head
- Narrow eyelid opening
- Narrow face
- Narrow forehead
- Narrow jaw
- Nasal tip, upturned
- Sparse eyebrow
- Abnormally small head
- Big calvaria
- Coarse facial features
- Failure of development of between one and six teeth
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Pointed chin
- Prominent forehead
- Receding chin
- Deep bite
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- Increased head circumference
- Increased nuchal translucency
- Long face
- Round face
- Short neck
- Sparse scalp hair at front of head
- Tall chin
- Triangular face
- Wide fontanelles
- Abnormal dentition
- Cross bite
- Ectopic tooth eruption
- Enlarged cisterna magna
- Thin dental enamel
- Absence of adult teeth
- Deformity of the skull
- Delayed eruption of permanent teeth
- Early eruption of teeth
- High, narrow palate
- Narrow palate
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Brisk reflexes
- Clonus
- Cognitive impairment
- Delayed ability to walk
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
Afficher 35 traits supplémentaires
- Lateral ventricle dilatation
- Myelomeningocele
- Stuttering
- Thin corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormally low-pitched voice
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Specific learning disability
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Intellectual disability, mild
- IQ between 34 and 49
- Motor delay
- Anxiety
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Cavum septum pellucidum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty making arithmetical calculations
- Focal impaired awareness seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Incoordination
- Intellectual disability, severe
- Tremor
- Astrocytoma
- Cancer of early nerve cells
- Communication delay
- Increased reflexes
- Partial agenesis of the corpus callosum
Abnormality of limbs
- Fractured carpal bone
- Large hands
- Long foot
- Single transverse palmar crease
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Increased arm span
- Pes valgus
- Broad foot
Afficher 15 traits supplémentaires
Abnormality of the musculoskeletal system
- Double-Jointed
- Low muscle tone
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Advanced bone age
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Spasticity and rigidity of muscles
- Delayed bone maturation
- Joint stiffness
Afficher 7 traits supplémentaires
Abnormality of the cardiovascular system
- Muscular ventricular septal defect
- Systolic heart murmur
- Abnormality of the heart
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Patent ductus arteriosus
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Aortic regurgitation
Afficher 4 traits supplémentaires
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Episodic vomiting
- Feeding difficulties
- Nasogastric tube feeding
- Poor suck
- Prolonged yellowing of skin in newborn
- Umbilical hernia
- Constipation
Afficher 3 traits supplémentaires
Abnormality of the integument
- Blue discoloration of the skin
- Abnormal fingernails
- Deep-set nails
- Loose redundant skin
- Thin nail
- Underdeveloped toenails
- Fine hair
- Flushing
Afficher 3 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène NSD1 : nuclear receptor binding SET domain protein 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/nsd1
Dante Labs. Gène NSD1 : nuclear receptor binding SET domain protein 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/nsd1
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