Gen
NSD1
nuclear receptor binding SET domain protein 1
- HGNC 14234↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000165671↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 64324↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 5q35.3
- Koordinater
- Kromosom 5: 177.133.773–177.300.213 (GRCh38)
- Exoner
- 23 exoner fordelt over 166,4 kb
- Protein
- 2.696 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant
- Også kendt som
- ARA267, FLJ22263, KMT3B
- Tidligere symboler
- STO
- MANE Select-transkript
- ENST00000439151.7NM_022455.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs NSD1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Imprintingsygdomme: Prader-Willi, Silver-Russell og Beckwith-Wiedemann
- Beckwith-Wiedemann-syndrom
En overvæksttilstand forårsaget af imprintingændringer på 11p15 (og nogle gange varianter i CDKN1C), som kan give stor fødselsvægt, forstørret tunge, defekter i bugvæggen og en øget risiko for barndomstumorer såsom Wilms tumor.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Diagnosen fører til overvågning for barndomstumorer, herunder ultralyd af bughulen.
Overvækstsyndromer (Sotos, Weaver, Tatton-Brown-Rahman, Malan)
- Sotos syndromAutosomal dominant
Et overvækstsyndrom forårsaget af varianter eller deletioner i NSD1, med stort hoved, høj vækst i barndommen, karakteristiske ansigtstræk og indlæringsvanskeligheder.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 6 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Viden gør det muligt at følge op på tilhørende problemer, herunder en moderat øget risiko for visse svulster i barndommen.
Bredere grupperinger
Hypertrofisk kardiomyopati
- Autosomal dominant
Et af 62 gener, der er knyttet til det
En tilstand, hvor myokardiet er hypertrofieret uden en tydelig årsag. Hypertrofien er generelt asymmetrisk og kan være forbundet med obstruktion af ventrikulær udflydningsbane.
- 1 GenCC-indsender vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Betablokkere, ikke-dihydropyridin calciumkanalblokkere, begrænsning af fysisk aktivitet, genetisk rådgivning
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
Sådan er NSD1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 13 kb af genets 166,4 kb; 8.091 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest NSD1
364
positioner i NSD1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 166,4 kb af NSD1, inklusive introner, og ikke kun de 13 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1CDeler 2 sygdomme
- H19H19 imprinted maternally expressed transcriptDeler 2 sygdomme
- IGF2insulin like growth factor 2Deler 2 sygdomme
- NLRP5NLR family pyrin domain containing 5Deler 2 sygdomme
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainDeler 1 sygdom
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Deler 1 sygdom
- ALPK3alpha kinase 3Deler 1 sygdom
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeler 1 sygdom
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 3Deler 1 sygdom
- DHHdesert hedgehog signaling moleculeDeler 1 sygdom
- DHX37DEAH-box helicase 37Deler 1 sygdom
- DMPKDM1 protein kinaseDeler 1 sygdom
Træk knyttet til NSD1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, NSD1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Bad bite
- Big head present at birth
- Big lower jaw
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Broad nostril
- Dental crowding
Vis 46 træk mere
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Excessive wear and tear on teeth
- Eye folds
- Frontal bossing
- High forehead
- High frontal hairline
- High palate
- Long, narrow head
- Narrow eyelid opening
- Narrow face
- Narrow forehead
- Narrow jaw
- Nasal tip, upturned
- Sparse eyebrow
- Abnormally small head
- Big calvaria
- Coarse facial features
- Failure of development of between one and six teeth
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Pointed chin
- Prominent forehead
- Receding chin
- Deep bite
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- Increased head circumference
- Increased nuchal translucency
- Long face
- Round face
- Short neck
- Sparse scalp hair at front of head
- Tall chin
- Triangular face
- Wide fontanelles
- Abnormal dentition
- Cross bite
- Ectopic tooth eruption
- Enlarged cisterna magna
- Thin dental enamel
- Absence of adult teeth
- Deformity of the skull
- Delayed eruption of permanent teeth
- Early eruption of teeth
- High, narrow palate
- Narrow palate
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Brisk reflexes
- Clonus
- Cognitive impairment
- Delayed ability to walk
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
Vis 35 træk mere
- Lateral ventricle dilatation
- Myelomeningocele
- Stuttering
- Thin corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormally low-pitched voice
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Specific learning disability
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Intellectual disability, mild
- IQ between 34 and 49
- Motor delay
- Anxiety
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Cavum septum pellucidum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty making arithmetical calculations
- Focal impaired awareness seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Incoordination
- Intellectual disability, severe
- Tremor
- Astrocytoma
- Cancer of early nerve cells
- Communication delay
- Increased reflexes
- Partial agenesis of the corpus callosum
Abnormality of limbs
- Fractured carpal bone
- Large hands
- Long foot
- Single transverse palmar crease
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Increased arm span
- Pes valgus
- Broad foot
Vis 15 træk mere
Abnormality of the integument
- Blue discoloration of the skin
- Abnormal fingernails
- Deep-set nails
- Loose redundant skin
- Thin nail
- Underdeveloped toenails
- Fine hair
- Flushing
Vis 3 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). NSD1-genet: nuclear receptor binding SET domain protein 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/nsd1
Dante Labs. NSD1-genet: nuclear receptor binding SET domain protein 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/nsd1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger