Gen
NSD1
nuclear receptor binding SET domain protein 1
- HGNC 14234↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000165671↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 64324↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 5q35.3
- Coördinaten
- Chromosoom 5: 177.133.773–177.300.213 (GRCh38)
- Exons
- 23 exons over 166,4 kb
- Eiwit
- 2.696 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- ARA267, FLJ22263, KMT3B
- Eerdere symbolen
- STO
- MANE Select-transcript
- ENST00000439151.7NM_022455.5
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees NSD1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Imprintingstoornissen: Prader-Willi, Silver-Russell en Beckwith-Wiedemann
- Beckwith-Wiedemann-syndroom
Een overgroeistoornis, veroorzaakt door imprintingveranderingen op 11p15 (en soms varianten in CDKN1C), die een grote geboortemaat, een vergrote tong, defecten in de buikwand en een hoger risico op kindertumoren zoals de Wilms-tumor kan veroorzaken.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Na de diagnose volgt bewaking op kindertumoren, waaronder echografie van de buik.
Overgroeisyndromen (Sotos, Weaver, Tatton-Brown-Rahman, Malan)
- Sotos-syndroomAutosomaal dominant
Een overgroeisyndroom veroorzaakt door varianten of deleties in NSD1, met een groot hoofd, lange gestalte in de kindertijd, karakteristieke gelaatstrekken en leerproblemen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Door dit te weten kan worden gecontroleerd op bijbehorende problemen, waaronder een matig verhoogd risico op bepaalde tumoren in de kindertijd.
Bredere groeperingen
Hypertrofische cardiomyopathie
- Autosomaal dominant
Een van 62 genen die hiermee verband houden
Een aandoening waarbij de hartspier zonder duidelijke oorzaak is verdikt. De verdikking is doorgaans asymmetrisch en kan gepaard gaan met een obstructie van de uitstroombaan van de linkerkamer.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Bètablokkers, niet-dihydropyridine calciumkanaalblokkers, beperking van lichamelijke activiteit, genetische counseling
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van NSD1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 13 kb van de 166,4 kb van het gen; 8.091 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest NSD1 leest
364
posities in NSD1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 166,4 kb van NSD1, inclusief introns, en niet alleen de 13 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- CDKN1Ccyclin dependent kinase inhibitor 1CDeelt 2 aandoeningen
- H19H19 imprinted maternally expressed transcriptDeelt 2 aandoeningen
- IGF2insulin like growth factor 2Deelt 2 aandoeningen
- NLRP5NLR family pyrin domain containing 5Deelt 2 aandoeningen
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainDeelt 1 aandoening
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Deelt 1 aandoening
- ALPK3alpha kinase 3Deelt 1 aandoening
- BRAFB-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinaseDeelt 1 aandoening
- CSRP3cysteine and glycine rich protein 3Deelt 1 aandoening
- DHHdesert hedgehog signaling moleculeDeelt 1 aandoening
- DHX37DEAH-box helicase 37Deelt 1 aandoening
- DMPKDM1 protein kinaseDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan NSD1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die NSD1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Bad bite
- Big head present at birth
- Big lower jaw
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Broad nostril
- Dental crowding
Toon 46 kenmerken meer
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Excessive wear and tear on teeth
- Eye folds
- Frontal bossing
- High forehead
- High frontal hairline
- High palate
- Long, narrow head
- Narrow eyelid opening
- Narrow face
- Narrow forehead
- Narrow jaw
- Nasal tip, upturned
- Sparse eyebrow
- Abnormally small head
- Big calvaria
- Coarse facial features
- Failure of development of between one and six teeth
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Pointed chin
- Prominent forehead
- Receding chin
- Deep bite
- Deep philtrum
- Depressed nasal bridge
- Increased head circumference
- Increased nuchal translucency
- Long face
- Round face
- Short neck
- Sparse scalp hair at front of head
- Tall chin
- Triangular face
- Wide fontanelles
- Abnormal dentition
- Cross bite
- Ectopic tooth eruption
- Enlarged cisterna magna
- Thin dental enamel
- Absence of adult teeth
- Deformity of the skull
- Delayed eruption of permanent teeth
- Early eruption of teeth
- High, narrow palate
- Narrow palate
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Aggressive behavior
- Attention deficit
- Brisk reflexes
- Clonus
- Cognitive impairment
- Delayed ability to walk
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
Toon 35 kenmerken meer
- Lateral ventricle dilatation
- Myelomeningocele
- Stuttering
- Thin corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Abnormally low-pitched voice
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Specific learning disability
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Intellectual disability, mild
- IQ between 34 and 49
- Motor delay
- Anxiety
- Aplasia/Hypoplasia of the corpus callosum
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Cavum septum pellucidum
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty making arithmetical calculations
- Focal impaired awareness seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Incoordination
- Intellectual disability, severe
- Tremor
- Astrocytoma
- Cancer of early nerve cells
- Communication delay
- Increased reflexes
- Partial agenesis of the corpus callosum
Abnormality of limbs
- Fractured carpal bone
- Large hands
- Long foot
- Single transverse palmar crease
- Abnormality of the wide portion of a long bone
- Increased arm span
- Pes valgus
- Broad foot
Toon 15 kenmerken meer
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Episodic vomiting
- Feeding difficulties
- Nasogastric tube feeding
- Poor suck
- Prolonged yellowing of skin in newborn
- Umbilical hernia
- Constipation
Toon 3 kenmerken meer
Abnormality of the integument
- Blue discoloration of the skin
- Abnormal fingernails
- Deep-set nails
- Loose redundant skin
- Thin nail
- Underdeveloped toenails
- Fine hair
- Flushing
Toon 3 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). NSD1-gen: nuclear receptor binding SET domain protein 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/nsd1
Dante Labs. NSD1-gen: nuclear receptor binding SET domain protein 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/nsd1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken