Geeni
PTCH1
patched 1
- HGNC 9585↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000185920↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5727↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 9q22.32
- Koordinaatit
- Kromosomi 9: 95 442 980–95 509 266 (GRCh38)
- Eksonit
- 24 eksonia 66,3 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 447 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- BCNS, SLC65B1
- Aiemmat symbolit
- NBCCS, PTCH
- MANE Select -transkripti
- ENST00000331920.11NM_000264.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PTCH1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Nevoid basaalisolusyöpäoireyhtymä (Gorlin-oireyhtymä)
- Nevoid basaalisolusyöpäoireyhtymäAutosomaalinen dominantti
PTCH1- tai SUFU-geeniin liittyvä oireyhtymä, johon kuuluvat useat basaalisolusyövät, leuan odontogeeniset keratokystat, luustomuutokset ja medulloblastooman riski.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Säännölliset iho-, hammas- ja (pienillä lapsilla) neurologiset tarkastukset, auringonsuojaus sekä sädehoidon välttäminen silloin, kun se on mahdollista.
Synnynnäinen useiden aivolisäkehormonien puutos
Synnynnäinen hypopituitarismi on ominaista useiden aivolisäkehormonien puutokselle, mukaan lukien somatotrofi-, tyreotrofi-, laktotrofi-, kortikotrofi- tai gonadotrofiasolujen toiminnan puutos. Taustalla ovat aivolisäkkeen kehitykseen osallistuvien aivolisäkkeen transkriptiotekijöiden mutaatiot.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
PTCH1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 8,7 kb geenin 66,3 kb:stä; 4 344 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PTCH1
589
PTCH1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 66,3 kb geenistä PTCH1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 8,7 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CDONcell adhesion associated, oncogene regulatedYhteinen sairaus: 1
- CNOT1CCR4-NOT transcription complex subunit 1Yhteinen sairaus: 1
- DISP1dispatched RND transporter family member 1Yhteinen sairaus: 1
- GLI2GLI family zinc finger 2Yhteinen sairaus: 1
- GLI3GLI family zinc finger 3Yhteinen sairaus: 1
- LHX3LIM homeobox 3Yhteinen sairaus: 1
- LHX4LIM homeobox 4Yhteinen sairaus: 1
- PLCH1phospholipase C eta 1Yhteinen sairaus: 1
- RBM28RNA binding motif protein 28Yhteinen sairaus: 1
- SHHsonic hedgehog signaling moleculeYhteinen sairaus: 1
- SIX3SIX homeobox 3Yhteinen sairaus: 1
- SMOsmoothened, frizzled class receptorYhteinen sairaus: 1
Geeniin PTCH1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PTCH1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Frontal bossing
- Big calvaria
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Cleft of the mouth
- Eye folds
- Metopic synostosis
- Midnasal stenosis
- Narrow mouth
Näytä 54 piirrettä lisää
- Odontogenic keratocysts of the jaw
- Only one upper front tooth
- Short neck
- Triangular head shape
- Abnormality of the neck
- Abnormally small head
- Absent nasal septal cartilage
- Bifid uvula
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
- Delayed eruption of teeth
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Flat nose
- High palate
- Long philtrum
- Narrow nasal bridge
- One sided cleft upper lip
- Short nose
- Short philtrum
- Tented mouth
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide nasal bridge
- Abnormality of head shape
- Abnormality of the sense of smell
- Big lower jaw
- Both sided cleft lip
- Bridged sella turcica
- Broad head shape
- Central cleft palate
- Cleft nasal bridge
- Coarse facial features
- Corners of eye widely separated
- Decreased depth of eye sockets
- Decreased size of nasal septum
- Dental cavities
- Depressed nasal tip
- Flat face
- Flattened bony protrusion above eyes
- Frontoethmoidal encephalocele
- Mono nostril
- Monobrow
- Nasal tip, upturned
- One sided cleft palate
- Proboscis
- Right and left cleft palate
- Broad face
- Cleft upper lip
- Cyst of eye socket
- Flat back of skull
- Flat nasal alae
- Hypoplasia of the primary palate bone
- Midface retrusion
- Midline defect of the nose
- Parietal bossing
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
- More active than typical
- Abnormal central motor function
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Abnormal shape of brainstem
Näytä 42 piirrettä lisää
- Abnormal shape of midbrain
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Absent speech development
- Alobar holoprosencephaly
- Anxiety
- Aplasia of the falx cerebri
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Chiari malformation
- Communication delay
- Depression
- Epilepsy
- Holoprosencephaly
- Impulsivity
- Inability to walk
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lethargy
- Limb dystonia
- Neural tube defect
- Oromotor apraxia
- Poor speech
- Short attention span
- Sleep-wake cycle disturbance
- Specific learning disability
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
- Abnormal septum pellucidum morphology
- Agenesis of corpus callosum
- Enlarged brain
- Fusion of the left and right thalami
- Hypoplasia of the pons
- Lobar holoprosencephaly
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Occipital meningocele
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Perisylvian polymicrogyria
- Rhombencephalosynapsis
- Small brainstem
- Motor delay
- Semilobar holoprosencephaly
- Split spine
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal deposits of calcium in the brain
- Abnormality of the ribs
- Abnormality of the vertebral column
- Calcification of falx cerebri
- Funnel chest
- Low muscle tone
- Abnormal vertebral morphology
- Advanced bone age
Näytä 24 piirrettä lisää
- Anterior rib cupping
- Cleft ribs
- Decreased muscle tone in infant
- Double-Jointed
- Generalized decreased muscle tone
- Hunched back
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Rib fusion
- Scoliosis
- Vertebral fusion
- Wedge-shaped vertebrae
- Abnormality of the skeletal system
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
- Low muscle tone in trunk
- Missing part of vertebrae
- Rhabdomyosarcoma
- Abnormality of the sternum
- Extra ribs
- High shoulder blade
- Kyphoscoliosis
- Rhabdomyoma
- Rounded shoulders
- Short ribs
Abnormality of the eye
- Abnormality of the eye
- Abnormally close eyes
- Abnormally small eyeball
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Noninflammatory retina disease
- Cerebral visual impairment
- Cat eye
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal hypothalamus physiology
- Abnormality of the endocrine system
- Anterior hypopituitarism
- Central diabetes insipidus
- Diabetes insipidus
- Early onset of puberty
- Central hypothyroidism
- Decreased response to growth hormone stimulation test
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormality of limbs
- Palmar pits
- Plantar pits
- More than five fingers or toes on hands or feet
- Short fingers or toes
- Abnormality of limbs
- Hip dislocation
- Long slender fingers
- Irregular maturation of hand bones
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PTCH1-geeni: patched 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ptch1
Dante Labs. PTCH1-geeni: patched 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ptch1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa