Geeni
SIX3
SIX homeobox 3
- HGNC 10889↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000138083↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6496↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 2p21
- Koordinaatit
- Kromosomi 2: 44 941 702–44 946 071 (GRCh38)
- Eksonit
- 2 eksonia 4,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 332 aminohappoa
- Aiemmat symbolit
- HPE2
- MANE Select -transkripti
- ENST00000260653.5NM_005413.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SIX3 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Synnynnäinen useiden aivolisäkehormonien puutos
Synnynnäinen hypopituitarismi on ominaista useiden aivolisäkehormonien puutokselle, mukaan lukien somatotrofi-, tyreotrofi-, laktotrofi-, kortikotrofi- tai gonadotrofiasolujen toiminnan puutos. Taustalla ovat aivolisäkkeen kehitykseen osallistuvien aivolisäkkeen transkriptiotekijöiden mutaatiot.
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
SIX3-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,7 kb geenin 4,4 kb:stä; 999 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SIX3
13
SIX3-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 4,4 kb geenistä SIX3, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,7 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CDONcell adhesion associated, oncogene regulatedYhteinen sairaus: 1
- CNOT1CCR4-NOT transcription complex subunit 1Yhteinen sairaus: 1
- DISP1dispatched RND transporter family member 1Yhteinen sairaus: 1
- GLI2GLI family zinc finger 2Yhteinen sairaus: 1
- GLI3GLI family zinc finger 3Yhteinen sairaus: 1
- LHX3LIM homeobox 3Yhteinen sairaus: 1
- LHX4LIM homeobox 4Yhteinen sairaus: 1
- PLCH1phospholipase C eta 1Yhteinen sairaus: 1
- PTCH1patched 1Yhteinen sairaus: 1
- RBM28RNA binding motif protein 28Yhteinen sairaus: 1
- SHHsonic hedgehog signaling moleculeYhteinen sairaus: 1
- SMOsmoothened, frizzled class receptorYhteinen sairaus: 1
Geeniin SIX3 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SIX3 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Abnormal central motor function
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormal shape of midbrain
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Absent speech development
Näytä 33 piirrettä lisää
- Alobar holoprosencephaly
- Anxiety
- Aplasia of the falx cerebri
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Communication delay
- Depression
- Epilepsy
- Impulsivity
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lethargy
- Limb dystonia
- Neural tube defect
- Oromotor apraxia
- Poor speech
- Short attention span
- Sleep-wake cycle disturbance
- Specific learning disability
- Abnormal septum pellucidum morphology
- Agenesis of corpus callosum
- Enlarged brain
- Holoprosencephaly
- Hypoplasia of the pons
- Perisylvian polymicrogyria
- Rhombencephalosynapsis
- Semilobar holoprosencephaly
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Schizencephaly
- Small cerebellum
Abnormality of head or neck
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Midnasal stenosis
- Only one upper front tooth
- Abnormally small head
- Bifid uvula
- Both sided cleft lip
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
Näytä 20 piirrettä lisää
- Flat nose
- High palate
- Narrow nasal bridge
- Right and left cleft palate
- Short philtrum
- Tented mouth
- Absence of the intermaxillary bone
- Absence of the nasal bone
- Big calvaria
- Cleft of the mouth
- Frontoethmoidal encephalocele
- Midface retrusion
- Mono nostril
- Nasal tip, upturned
- Proboscis
- Short nose
- Absent nasal septal cartilage
- Central cleft palate
- Submucous cleft hard palate
- Zygomatic flattening
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal hypothalamus physiology
- Abnormality of the endocrine system
- Anterior hypopituitarism
- Central diabetes insipidus
- Diabetes insipidus
- Early onset of puberty
- Central hypothyroidism
- Decreased response to growth hormone stimulation test
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormal vertebral morphology
- Abnormality of the ribs
- Decreased muscle tone in infant
- Generalized decreased muscle tone
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Abnormality of the skeletal system
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
Näytä 3 piirrettä lisää
Abnormality of the digestive system
- Feeding difficulties
- Poor suck
- Acid reflux
- Constipation
- Poor swallowing
- Vomiting
- Abnormal shape of the digestive system
- Absence or narrowing of first part of small bowel
Näytä 2 piirrettä lisää
Abnormality of the eye
- Abnormally close eyes
- Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Cerebral visual impairment
- Abnormally small eyeball
- Birth defect that causes a hole in the innermost layer at the back of the eye
- Cat eye
- Cross-eyed
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SIX3-geeni: SIX homeobox 3. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/six3
Dante Labs. SIX3-geeni: SIX homeobox 3 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/six3
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa