Gen
COL7A1
collagen type VII alpha 1 chain
- HGNC 2214↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000114270↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 1294↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 3p21.31
- Koordinater
- Kromosom 3: 48 564 073–48 595 329 (GRCh38)
- Eksoner
- 119 eksoner over 31,3 kb
- Protein
- 2 944 aminosyrer
- Tidligere symboler
- EBDCT, EBD1, EBR1
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000681320.1NM_000094.4
- Lokustype
- gene with protein product
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les COL7A1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Epidermolysis bullosa
- Arvelig epidermolysis bullosa
Alle arvelige former for hudskjørhet med blemmedannelse, inkludert epidermolysis bullosa simplex, junksjonell og dystrofisk epidermolysis bullosa samt Kindlers syndrom.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
Recessive dystrofiske former krever regelmessig overvåkning for hudkreft, og genbasert sårbehandling finnes nå for dystrofisk EB.
Slik er COL7A1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 9,2 kb av genets 31,3 kb, og 8 835 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test COL7A1
720
posisjoner i COL7A1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 31,3 kb av COL7A1, inkludert introner, og ikke bare de 9,2 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- CD151CD151 molecule (Raph blood group)Deler 1 tilstand
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainDeler 1 tilstand
- DSPdesmoplakinDeler 1 tilstand
- DSTdystoninDeler 1 tilstand
- EXPH5exophilin 5Deler 1 tilstand
- FERMT1FERM domain containing kindlin 1Deler 1 tilstand
- ITGA3integrin subunit alpha 3Deler 1 tilstand
- ITGA6integrin subunit alpha 6Deler 1 tilstand
- ITGB4integrin subunit beta 4Deler 1 tilstand
- JUPjunction plakoglobinDeler 1 tilstand
- KLHL24kelch like family member 24Deler 1 tilstand
- KRT14keratin 14Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til COL7A1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene COL7A1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the integument
- Abnormal blistering of the skin
- Itching
- Poor nail formation
- Sub-lamina densa cleavage
- Sunken or indented skin due to damage
- Atypical scarring of skin
- Brittle nails
- Fragile skin
Vis 47 egenskaper til
- Generalized abnormality of skin
- Localized skin lesion
- Milk spot
- Pretibial blistering
- Thick nail
- Abnormal fingernails
- Abnormal subungual morphology
- Abnormality of the toenail
- Absent nails
- Acral blistering
- Chronic cutaneous wound
- Erythematous plaque
- Genital blistering
- Irregular hyperpigmentation
- Keloids
- Lichenification
- Overgrowth and curving of fingernail
- Overgrowth and curving of toenails
- Photosensitive skin
- Poikiloderma
- Poor fingernail formation
- Poor toenail formation
- Skin degeneration
- Skin erosion
- Skin plaque
- Squamous cell carcinoma
- Thin skin
- Absence of part of skin at birth
- Absent fingernail
- Absent toenail
- Atypical nail growth
- Cutaneous melanoma
- Erythematous papule
- Firm lump under the skin
- Hyperkeratosis
- Hyperkeratotic papule
- Lamina lucida cleavage
- Mole
- Papule
- Recurrent loss of toenails and fingernails
- Skin vesicle
- Small nail
- Abnormal skin pigmentation
- Abnormal skin structure
- Basal cell carcinoma
- Congenital localized absence of skin
- Hair loss
Abnormality of limbs
- Mitten deformity
- Abnormality of the elbow
- Abnormality of the lower limb
- Abnormality of the wrist
- Palmoplantar blistering
- Thickening of the outer layer of the skin of the palms and soles
- Abnormality of the forearm
- Abnormality of the knee
Vis 2 egenskaper til
Abnormality of head or neck
- Oral mucosal blisters
- Dental cavities
- Abnormality of the scalp
- Erosion of oral mucosa
- Abnormality of head or neck
- Narrow mouth
- Tongue tied
- Pink eye
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). COL7A1-genet: collagen type VII alpha 1 chain. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/col7a1
Dante Labs. COL7A1-genet: collagen type VII alpha 1 chain [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/col7a1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker