Gen
SETBP1
SET binding protein 1
- HGNC 15573↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000152217↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 26040↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 18q12.3
- Souřadnice
- Chromozom 18: 44 680 888–45 068 510 (GRCh38)
- Exony
- 6 exonů na 387,6 kb
- Protein
- 1 596 aminokyselin
- Další názvy
- SEB, KIAA0437
- Transkript MANE Select
- ENST00000649279.2NM_015559.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SETBP1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je SETBP1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 9,9 kb z 387,6 kb genu; 4 791 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SETBP1
54
pozic v genu SETBP1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 387,6 kb genu SETBP1, včetně intronů, nikoli jen 9,9 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Sdílí 1 onemocnění
- ADKadenosine kinaseSdílí 1 onemocnění
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxSdílí 1 onemocnění
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Sdílí 1 onemocnění
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Sdílí 1 onemocnění
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ANK3ankyrin 3Sdílí 1 onemocnění
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Sdílí 1 onemocnění
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Sdílí 1 onemocnění
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ASdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SETBP1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SETBP1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Frontal bossing
- Midface retrusion
- Short nose
- Abnormally large tongue
- Decreased depth of eye sockets
- Facial hemangioma
Zobrazit ještě 39 rysů
- High palate
- Long philtrum
- Monobrow
- Narrow forehead
- Short neck
- Wide mouth
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Abnormality of the gums
- Broad head shape
- Delayed eruption of teeth
- Dense bone of skull base
- Dental crowding
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Extra bones within cranial sutures
- Full lips
- Little lower jaw
- Long face
- Narrow mouth
- Narrowing of the rear opening of the nasal cavity
- Open mouth
- Pointed chin
- Receding chin
- Short opening between the eyelids
- Thin red part of the upper lip
- Tongue tied
- Wide gum ridges
- Wide nose
- Coarse facial features
- Short philtrum
- Abnormal nasopharynx morphology
- Depressed nasal bridge
- High forehead
- Metopic suture patent to nasal root
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Prominent forehead
- Sloping forehead
- Widely patent fontanelles and sutures
- Zygomatic flattening
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Profound global developmental delay
- Absent speech development
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Zobrazit ještě 22 rysů
- Ventriculomegaly
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Autism spectrum disorder
- Chiari type I malformation
- Choroid plexus cyst
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Frequent temper tantrums
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- More active than typical
- Neural tube defect
- Self-injurious behavior
- Ependymoma
- Epileptic spasm
- Hypsarrhythmia
- Inability to move vocal cords
- Degeneration of cerebrum
Abnormality of the musculoskeletal system
- Broad ribs
- Low muscle tone
- Abnormal collarbone
- Abnormal formation of the hip
- Abnormality of the chest
- Excessive inward curvature of lower spine
- Hypoplastic pubic bone
- Kyphoscoliosis
Zobrazit ještě 13 rysů
- Prominent swayback
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Permanent flexion of the finger or toe
- Scoliosis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Stiff elbow
- Absent/small pubic bones
- Increased density of long bones
- Long collarbone
- Opisthotonus
- Short sternum
- Small first rib
- Thickened cortex of long bones
Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Drooping upper eyelid
- Farsightedness
- Visual impairment
- Wide-set eyes
- Absence of tears in the eyes
- Astigmatism
- Close sighted
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SETBP1: SET binding protein 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/setbp1
Dante Labs. Gen SETBP1: SET binding protein 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/setbp1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů