Gen
SETBP1
SET binding protein 1
- HGNC 15573↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000152217↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 26040↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 18q12.3
- Koordinater
- Kromosom 18: 44 680 888–45 068 510 (GRCh38)
- Exoner
- 6 exoner på 387,6 kb
- Protein
- 1 596 aminosyror
- Även känd som
- SEB, KIAA0437
- MANE Select-transkript
- ENST00000649279.2NM_015559.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SETBP1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Intellektuell funktionsnedsättning
En av 233 gener kopplade till den
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Så är SETBP1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 9,9 kb av genens 387,6 kb, och 4 791 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SETBP1
54
positioner i SETBP1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 387,6 kb av SETBP1, med introner inräknade, inte bara de 9,9 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Delar 1 tillstånd
- ADKadenosine kinaseDelar 1 tillstånd
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDelar 1 tillstånd
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Delar 1 tillstånd
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Delar 1 tillstånd
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDelar 1 tillstånd
- ANK3ankyrin 3Delar 1 tillstånd
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Delar 1 tillstånd
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Delar 1 tillstånd
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Delar 1 tillstånd
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Delar 1 tillstånd
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SETBP1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SETBP1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Frontal bossing
- Midface retrusion
- Short nose
- Abnormally large tongue
- Decreased depth of eye sockets
- Facial hemangioma
Visa ytterligare 39 egenskaper
- High palate
- Long philtrum
- Monobrow
- Narrow forehead
- Short neck
- Wide mouth
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Abnormality of the gums
- Broad head shape
- Delayed eruption of teeth
- Dense bone of skull base
- Dental crowding
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Extra bones within cranial sutures
- Full lips
- Little lower jaw
- Long face
- Narrow mouth
- Narrowing of the rear opening of the nasal cavity
- Open mouth
- Pointed chin
- Receding chin
- Short opening between the eyelids
- Thin red part of the upper lip
- Tongue tied
- Wide gum ridges
- Wide nose
- Coarse facial features
- Short philtrum
- Abnormal nasopharynx morphology
- Depressed nasal bridge
- High forehead
- Metopic suture patent to nasal root
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Prominent forehead
- Sloping forehead
- Widely patent fontanelles and sutures
- Zygomatic flattening
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Profound global developmental delay
- Absent speech development
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Visa ytterligare 22 egenskaper
- Ventriculomegaly
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Autism spectrum disorder
- Chiari type I malformation
- Choroid plexus cyst
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Frequent temper tantrums
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- More active than typical
- Neural tube defect
- Self-injurious behavior
- Ependymoma
- Epileptic spasm
- Hypsarrhythmia
- Inability to move vocal cords
- Degeneration of cerebrum
Abnormality of the musculoskeletal system
- Broad ribs
- Low muscle tone
- Abnormal collarbone
- Abnormal formation of the hip
- Abnormality of the chest
- Excessive inward curvature of lower spine
- Hypoplastic pubic bone
- Kyphoscoliosis
Visa ytterligare 13 egenskaper
- Prominent swayback
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Permanent flexion of the finger or toe
- Scoliosis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Stiff elbow
- Absent/small pubic bones
- Increased density of long bones
- Long collarbone
- Opisthotonus
- Short sternum
- Small first rib
- Thickened cortex of long bones
Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Drooping upper eyelid
- Farsightedness
- Visual impairment
- Wide-set eyes
- Absence of tears in the eyes
- Astigmatism
- Close sighted
Visa ytterligare 2 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SETBP1-genen: SET binding protein 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/setbp1
Dante Labs. SETBP1-genen: SET binding protein 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/setbp1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor