Geeni
SETBP1
SET binding protein 1
- HGNC 15573↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000152217↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 26040↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 18q12.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 18: 44 680 888–45 068 510 (GRCh38)
- Eksonit
- 6 eksonia 387,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 596 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- SEB, KIAA0437
- MANE Select -transkripti
- ENST00000649279.2NM_015559.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue SETBP1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Älyllinen kehitysvammaisuus
Yksi 233 siihen liittyvästä geenistä
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 5 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
SETBP1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 9,9 kb geenin 387,6 kb:stä; 4 791 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä SETBP1
54
SETBP1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 387,6 kb geenistä SETBP1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 9,9 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Yhteinen sairaus: 1
- ADKadenosine kinaseYhteinen sairaus: 1
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxYhteinen sairaus: 1
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Yhteinen sairaus: 1
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Yhteinen sairaus: 1
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseYhteinen sairaus: 1
- ANK3ankyrin 3Yhteinen sairaus: 1
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Yhteinen sairaus: 1
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Yhteinen sairaus: 1
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Yhteinen sairaus: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Yhteinen sairaus: 1
- ARID1AAT-rich interaction domain 1AYhteinen sairaus: 1
Geeniin SETBP1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita SETBP1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Frontal bossing
- Midface retrusion
- Short nose
- Abnormally large tongue
- Decreased depth of eye sockets
- Facial hemangioma
Näytä 39 piirrettä lisää
- High palate
- Long philtrum
- Monobrow
- Narrow forehead
- Short neck
- Wide mouth
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Abnormality of the gums
- Broad head shape
- Delayed eruption of teeth
- Dense bone of skull base
- Dental crowding
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Extra bones within cranial sutures
- Full lips
- Little lower jaw
- Long face
- Narrow mouth
- Narrowing of the rear opening of the nasal cavity
- Open mouth
- Pointed chin
- Receding chin
- Short opening between the eyelids
- Thin red part of the upper lip
- Tongue tied
- Wide gum ridges
- Wide nose
- Coarse facial features
- Short philtrum
- Abnormal nasopharynx morphology
- Depressed nasal bridge
- High forehead
- Metopic suture patent to nasal root
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Prominent forehead
- Sloping forehead
- Widely patent fontanelles and sutures
- Zygomatic flattening
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Profound global developmental delay
- Absent speech development
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Näytä 22 piirrettä lisää
- Ventriculomegaly
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Autism spectrum disorder
- Chiari type I malformation
- Choroid plexus cyst
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Frequent temper tantrums
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- More active than typical
- Neural tube defect
- Self-injurious behavior
- Ependymoma
- Epileptic spasm
- Hypsarrhythmia
- Inability to move vocal cords
- Degeneration of cerebrum
Abnormality of the musculoskeletal system
- Broad ribs
- Low muscle tone
- Abnormal collarbone
- Abnormal formation of the hip
- Abnormality of the chest
- Excessive inward curvature of lower spine
- Hypoplastic pubic bone
- Kyphoscoliosis
Näytä 13 piirrettä lisää
- Prominent swayback
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Permanent flexion of the finger or toe
- Scoliosis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Stiff elbow
- Absent/small pubic bones
- Increased density of long bones
- Long collarbone
- Opisthotonus
- Short sternum
- Small first rib
- Thickened cortex of long bones
Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Drooping upper eyelid
- Farsightedness
- Visual impairment
- Wide-set eyes
- Absence of tears in the eyes
- Astigmatism
- Close sighted
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). SETBP1-geeni: SET binding protein 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/setbp1
Dante Labs. SETBP1-geeni: SET binding protein 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/setbp1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa