Gen
SETBP1
SET binding protein 1
- HGNC 15573↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000152217↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 26040↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 18q12.3
- Coordenadas
- Cromosoma 18: 44.680.888–45.068.510 (GRCh38)
- Exones
- 6 exones en 387,6 kb
- Proteína
- 1596 aminoácidos
- También conocido como
- SEB, KIAA0437
- Transcrito MANE Select
- ENST00000649279.2NM_015559.3
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Genoma de referenciaGRCh38hg38
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Discapacidad intelectual
Uno de 233 genes relacionados con ello
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 5 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Estructura de SETBP1
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 9,9 kb de los 387,6 kb del gen; 4791 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen SETBP1
54
posiciones en SETBP1 donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
Un genoma completo cubre los 387,6 kb de SETBP1, incluidos los intrones, y no solo los 9,9 kb de exones.
Genes vinculados a las mismas afecciones
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Comparte 1 afección
- ADKadenosine kinaseComparte 1 afección
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxComparte 1 afección
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Comparte 1 afección
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Comparte 1 afección
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseComparte 1 afección
- ANK3ankyrin 3Comparte 1 afección
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Comparte 1 afección
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Comparte 1 afección
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Comparte 1 afección
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Comparte 1 afección
- ARID1AAT-rich interaction domain 1AComparte 1 afección
Rasgos asociados a SETBP1
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que SETBP1 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of head or neck
- Broad forehead
- Broad nasal tip
- Frontal bossing
- Midface retrusion
- Short nose
- Abnormally large tongue
- Decreased depth of eye sockets
- Facial hemangioma
Mostrar 39 rasgos más
- High palate
- Long philtrum
- Monobrow
- Narrow forehead
- Short neck
- Wide mouth
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Abnormality of the gums
- Broad head shape
- Delayed eruption of teeth
- Dense bone of skull base
- Dental crowding
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Extra bones within cranial sutures
- Full lips
- Little lower jaw
- Long face
- Narrow mouth
- Narrowing of the rear opening of the nasal cavity
- Open mouth
- Pointed chin
- Receding chin
- Short opening between the eyelids
- Thin red part of the upper lip
- Tongue tied
- Wide gum ridges
- Wide nose
- Coarse facial features
- Short philtrum
- Abnormal nasopharynx morphology
- Depressed nasal bridge
- High forehead
- Metopic suture patent to nasal root
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
- Prominent forehead
- Sloping forehead
- Widely patent fontanelles and sutures
- Zygomatic flattening
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Profound global developmental delay
- Absent speech development
- Epilepsy
- Intellectual disability
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Mostrar 22 rasgos más
- Ventriculomegaly
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Attention deficit
- Autism spectrum disorder
- Chiari type I malformation
- Choroid plexus cyst
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Frequent temper tantrums
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- More active than typical
- Neural tube defect
- Self-injurious behavior
- Ependymoma
- Epileptic spasm
- Hypsarrhythmia
- Inability to move vocal cords
- Degeneration of cerebrum
Abnormality of the musculoskeletal system
- Broad ribs
- Low muscle tone
- Abnormal collarbone
- Abnormal formation of the hip
- Abnormality of the chest
- Excessive inward curvature of lower spine
- Hypoplastic pubic bone
- Kyphoscoliosis
Mostrar 13 rasgos más
- Prominent swayback
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Permanent flexion of the finger or toe
- Scoliosis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Stiff elbow
- Absent/small pubic bones
- Increased density of long bones
- Long collarbone
- Opisthotonus
- Short sternum
- Small first rib
- Thickened cortex of long bones
Abnormality of the eye
- Bulging eye
- Drooping upper eyelid
- Farsightedness
- Visual impairment
- Wide-set eyes
- Absence of tears in the eyes
- Astigmatism
- Close sighted
Mostrar 2 rasgos más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen SETBP1: SET binding protein 1. Consultado el 16 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/setbp1
Dante Labs. Gen SETBP1: SET binding protein 1 [Internet]. [citado 16 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/setbp1
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