Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

TNXB

tenascin XB

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
6p21.33-p21.32
Koordinater
Kromosom 6: 32 041 153–32 109 338 (GRCh38)
Eksoner
44 eksoner over 68,2 kb
Protein
4 244 aminosyrer
Også kjent som
TNXBS, XBS, XB, HXBL, TN-X, TNX
Tidligere symboler
TNXB1, TNXB2
MANE Select-transkripsjon
ENST00000644971.2NM_001365276.2
Lokustype
gene with protein product

Kuratert rapport som er relevant for dette genet

Slik er TNXB bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 6, med en parentes der TNXB står. TNXB og 64 gener i nærheten på kromosom 6, fra 31 575 246 til 32 575 245.Kromosom 66p21.33-p21.32p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13q14.1q14.2q14.3q15q16.1q16.2q16.3q21q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26q2731,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 Mb32,4 MbTNF: 31 575 558–31 578 336, fremover-strengLTB: 31 580 525–31 582 522, bakover-strengLST1: 31 581 065–31 588 911, fremover-strengLST1NCR3: 31 588 895–31 593 217, bakover-strengNCR3AIF1: 31 615 214–31 617 025, fremover-strengAIF1PRRC2A: 31 620 675–31 637 771, fremover-strengPRRC2A: 31 622 774–31 622 860, fremover-streng: 31 623 874–31 625 499, fremover-strengBAG6: 31 638 543–31 652 747, bakover-strengAPOM: 31 652 416–31 658 214, fremover-strengC6orf47: 31 658 298–31 660 778, bakover-strengGPANK1: 31 661 228–31 666 283, bakover-strengCSNK2B: 31 665 227–31 670 343, fremover-streng: 31 666 102–31 673 546, fremover-strengLY6G5B: 31 669 976–31 673 776, fremover-strengLY6G5C: 31 676 684–31 684 040, bakover-strengLY6G5CABHD16A: 31 686 954–31 703 391, bakover-strengLY6G6F: 31 706 863–31 710 801, fremover-strengLY6G6F-LY6G6D: 31 706 904–31 717 918, fremover-strengLY6G6D: 31 715 285–31 717 919, fremover-strengLY6G6DMPIG6B: 31 718 594–31 726 714, fremover-strengLY6G6C: 31 718 648–31 721 746, bakover-strengDDAH2: 31 726 586–31 730 617, bakover-strengCLIC1: 31 730 579–31 740 558, bakover-strengMSH5: 31 739 677–31 762 678, fremover-strengMSH5MSH5-SAPCD1: 31 740 020–31 764 851, fremover-strengSAPCD1: 31 762 656–31 764 851, fremover-strengVWA7: 31 765 590–31 777 328, bakover-strengVWA7VARS1: 31 777 518–31 795 975, bakover-strengLSM2: 31 797 019–31 806 992, bakover-strengLSM2HSPA1L: 31 809 619–31 815 788, bakover-strengHSPA1A: 31 815 543–31 817 994, fremover-strengHSPA1AHSPA1B: 31 827 738–31 830 254, fremover-strengHSPA1BNEU1: 31 857 063–31 862 905, bakover-strengNEU1SLC44A4: 31 863 173–31 879 198, bakover-strengSLC44A4EHMT2: 31 879 758–31 897 723, bakover-strengEHMT2C2: 31 897 785–31 945 677, fremover-strengC2ZBTB12: 31 899 065–31 902 103, bakover-strengZBTB12: 31 927 698–31 952 048, fremover-strengCFB: 31 945 650–31 952 086, fremover-strengNELFE: 31 952 087–31 959 079, bakover-strengSKIC2: 31 959 025–31 969 852, fremover-strengSKIC2DXO: 31 969 810–31 972 517, bakover-strengDXOWHR1: 31 971 091–31 982 821, fremover-strengWHR1C4A: 31 981 991–32 005 247, fremover-strengC4AC4B: 32 014 725–32 035 975, fremover-strengC4BCYP21A2: 32 038 297–32 042 321, fremover-strengCYP21A2TNXB: 32 041 153–32 109 338, bakover-strengTNXBATF6B: 32 115 264–32 128 255, bakover-strengATF6BFKBPL: 32 128 697–32 131 070, bakover-strengFKBPLPPT2: 32 146 580–32 163 679, fremover-strengPRRT1: 32 147 292–32 153 083, bakover-strengPRRT1: 32 150 495–32 154 373, bakover-strengPPT2-EGFL8: 32 153 845–32 171 978, fremover-strengEGFL8: 32 163 918–32 171 980, fremover-strengAGPAT1: 32 167 118–32 178 112, bakover-strengRNF5: 32 178 391–32 184 769, fremover-strengAGER: 32 180 963–32 184 365, bakover-strengPBX2: 32 184 733–32 190 278, bakover-strengGPSM3: 32 190 766–32 195 523, bakover-strengNOTCH4: 32 194 843–32 224 111, bakover-strengNOTCH4TSBP1: 32 288 526–32 371 907, bakover-strengTSBP1BTNL2: 32 391 481–32 407 181, bakover-strengBTNL2HLA-DRA: 32 439 870–32 445 181, fremover-strengHLA-DRAHLA-DRB5: 32 516 622–32 530 369, bakover-strengHLA-DRB5Diagram av TNXB: 44 eksoner på bakover-strengen til kromosom 6Ekson 43: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 42: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 41: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 40: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 36: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 35: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 33: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 32: 3 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 31: 11 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 30: 6 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 29: 10 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 28: 9 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 27: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 26: 9 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 25: 6 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 24: 11 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 23: 12 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 22: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 21: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 20: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 19: 6 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 18: 8 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 17: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 16: 6 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 15: 5 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 14: 5 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 13: 10 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 12: 4 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 11: 8 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 10: 11 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 9: 6 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 8: 11 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 7: 8 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 6: 5 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 5: 7 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 4: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 3: 50 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 2: 6 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 44: 32 041 153–32 041 450, 298 baserEkson 43: 32 041 771–32 041 934, 164 baserEkson 42: 32 042 012–32 042 173, 162 baserEkson 41: 32 042 266–32 042 362, 97 baserEkson 40: 32 042 455–32 042 606, 152 baserEkson 39: 32 042 699–32 042 831, 133 baserEkson 38: 32 042 951–32 043 081, 131 baserEkson 37: 32 043 175–32 043 318, 144 baserEkson 36: 32 043 437–32 043 556, 120 baserEkson 35: 32 043 749–32 043 892, 144 baserEkson 34: 32 044 007–32 044 129, 123 baserEkson 33: 32 044 381–32 044 716, 336 baserEkson 32: 32 045 006–32 045 326, 321 baserEkson 31: 32 046 175–32 046 456, 282 baserEkson 30: 32 047 734–32 048 012, 279 baserEkson 29: 32 048 363–32 048 650, 288 baserEkson 28: 32 049 270–32 049 587, 318 baserEkson 27: 32 049 998–32 050 321, 324 baserEkson 26: 32 052 670–32 052 993, 324 baserEkson 25: 32 053 388–32 053 711, 324 baserEkson 24: 32 055 851–32 056 174, 324 baserEkson 23: 32 056 586–32 056 903, 318 baserEkson 22: 32 058 058–32 058 390, 333 baserEkson 21: 32 061 397–32 061 720, 324 baserEkson 20: 32 062 157–32 062 483, 327 baserEkson 19: 32 064 821–32 065 117, 297 baserEkson 18: 32 067 661–32 067 984, 324 baserEkson 17: 32 068 390–32 068 707, 318 baserEkson 16: 32 068 822–32 069 136, 315 baserEkson 15: 32 069 553–32 069 861, 309 baserEkson 14: 32 070 127–32 070 414, 288 baserEkson 13: 32 071 990–32 072 298, 309 baserEkson 12: 32 073 647–32 073 952, 306 baserEkson 11: 32 079 033–32 079 365, 333 baserEkson 10: 32 081 368–32 081 673, 306 baserEkson 9: 32 082 036–32 082 326, 291 baserEkson 8: 32 084 413–32 084 709, 297 baserEkson 7: 32 085 750–32 086 118, 369 baserEkson 6: 32 088 785–32 089 048, 264 baserEkson 5: 32 089 223–32 089 379, 157 baserEkson 4: 32 095 076–32 095 191, 116 baserEkson 3: 32 095 611–32 097 449, 1 839 baserEkson 2: 32 097 796–32 098 206, 411 baserEkson 1: 32 109 181–32 109 338, 158 baser442515′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 13,1 kb av genets 68,2 kb, og 12 735 av disse basene koder for proteinet.

Slik leser en genetisk test TNXB

273

posisjoner i TNXB der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

273 av dem (100 %) faller i områder som korte avlesninger sliter med.

  • Low mappability (51 posisjoner)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • MHC (273 posisjoner)The major histocompatibility complex (HLA genes), highly polymorphic and poorly represented by a single reference.
  • Segmental duplications (71 posisjoner)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

En helgenomsekvensering dekker alle 68,2 kb av TNXB, inkludert introner, og ikke bare de 13,1 kb med eksoner.

Gener knyttet til de samme tilstandene

Egenskaper knyttet til TNXB

The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene TNXB kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.

Eksterne lenker

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
  • ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). TNXB-genet: tenascin XB. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/tnxb

Vancouver

Dante Labs. TNXB-genet: tenascin XB [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/tnxb

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test