Gen
RPGRIP1
RPGR interacting protein 1
- HGNC 13436↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000092200↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 57096↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 14q11.2
- Souřadnice
- Chromozom 14: 21 280 083–21 351 301 (GRCh38)
- Exony
- 25 exonů na 71,2 kb
- Protein
- 1 286 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- RGI1, LCA6, CORD13
- Předchozí symboly
- RPGRIP
- Transkript MANE Select
- ENST00000400017.7NM_020366.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si RPGRIP1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Leber Congenital Amaurosis & RPE65-Related Retinopathy
- Leber Congenital AmaurosisAutozomálně recesivní
A group of inherited retinal dystrophies, caused by changes in genes such as CEP290, GUCY2D, CRB1, RPE65 and AIPL1, that cause severe vision loss, nystagmus and poor pupil responses in infancy.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Confirming the gene can determine eligibility for gene-specific treatments and clinical trials, and informs family counselling.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je RPGRIP1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,1 kb z 71,2 kb genu; 3 861 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte RPGRIP1
144
pozic v genu RPGRIP1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 71,2 kb genu RPGRIP1, včetně intronů, nikoli jen 4,1 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AIPL1AIP like 1 HSP90 co-chaperoneSdílí 1 onemocnění
- CCT2chaperonin containing TCP1 subunit 2Sdílí 1 onemocnění
- CEP290centrosomal protein 290Sdílí 1 onemocnění
- CRB1crumbs cell polarity complex component 1Sdílí 1 onemocnění
- CRXcone-rod homeoboxSdílí 1 onemocnění
- GUCY2Dguanylate cyclase 2D, retinalSdílí 1 onemocnění
- IMPDH1inosine monophosphate dehydrogenase 1Sdílí 1 onemocnění
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Sdílí 1 onemocnění
- LCA5lebercilin LCA5Sdílí 1 onemocnění
- LRATlecithin retinol acyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- NMNAT1nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1Sdílí 1 onemocnění
- PRPH2peripherin 2Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s RPGRIP1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit RPGRIP1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the eye
- Abnormal color vision
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal fundus pigmentation
- Close sighted
- Decreased clarity of vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Farsightedness
- Flat cornea
Zobrazit ještě 52 rysů
- Foveal atrophy
- Limited peripheral vision
- Macular degeneration
- Marked vision impairment
- Moderate visual impairment
- Progressive loss of vision
- Retinal flecks
- Slow pupillary light response
- Visual acuity no light perception
- Abnormal optic disc morphology
- Abnormal retinal pigmentation
- Chorioretinal atrophy
- Cross-eyed
- Difficulties with night vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Retina degeneration
- Very low visual acuity
- Abnormal chorioretinal morphology
- Abnormal full-field electroretinogram
- Abnormally small eyeball
- Absent foveal reflex
- Absent/small iris
- Blind spot located at fixation point
- Bulging cornea
- Clouding of the lens of the eye
- Color blindness
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Hardening of skin and connective tissue
- Macular atrophy
- Optic atrophy
- Optic disc pallor
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Retinal thinning
- Spicular pigmentation of the retina
- Wide-set eyes
- Abnormal vitreous humor morphology
- Absence of eyeballs
- Asteroid hyalosis
- Bull's eye maculopathy
- Metamorphopsia
- Mildly reduced visual acuity
- Optic disc drusen
- Outward facing eye ball
- Peripheral retinal atrophy
- Visual impairment
- Cone/cone-rod dystrophy
- Pendular nystagmus
- Severe farsightedness
- Undetectable electroretinogram
- Undetectable light- and dark-adapted electroretinogram
Abnormality of head or neck
- Focal retinal arteriolar constriction
- Abnormally small head
- Encephalocele
- Cleft palate
- Flat nose
- Full cheeks
- Little lower jaw
- Sloping forehead
Zobrazit ještě 3 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen RPGRIP1: RPGR interacting protein 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/rpgrip1
Dante Labs. Gen RPGRIP1: RPGR interacting protein 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/rpgrip1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů