Gen
SCN1B
sodium voltage-gated channel beta subunit 1
- HGNC 10586↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000105711↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6324↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 19q13.11
- Souřadnice
- Chromozom 19: 35 030 470–35 040 449 (GRCh38)
- Exony
- 6 exonů na 10 kb
- Protein
- 218 aminokyselin
- Transkript MANE Select
- ENST00000262631.11NM_001037.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SCN1B i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
Jeden z 171 genů spojených s touto vazbou
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je SCN1B uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,7 kb z 10 kb genu; 657 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SCN1B
38
pozic v genu SCN1B, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 10 kb genu SCN1B, včetně intronů, nikoli jen 1,7 kb exonů.
Varianta se stránkou (1)
Varianty genu SCN1B se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|
| c.449-2A>G | Intron 3 | 35 039 115 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseSdílí 1 onemocnění
- ACTL6Bactin like 6BSdílí 1 onemocnění
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Sdílí 1 onemocnění
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Sdílí 1 onemocnění
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorSdílí 1 onemocnění
- ARXaristaless related homeoboxSdílí 1 onemocnění
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Sdílí 1 onemocnění
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SCN1B
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SCN1B. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- Intellectual disability
Zobrazit ještě 66 rysů
- Loss of developmental milestones
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Anxiety
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Cognitive impairment
- Complex febrile seizure
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Epilepsia partialis continua
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized clonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased reflexes
- Interictal epileptiform activity
- Jerking
- Lethargy
- Multifocal epileptiform discharges
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Slow movements
- Action tremor
- Ataxia
- Atypical absence status epilepticus
- Choreoathetosis
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized tonic seizure
- Impulsivity
- Incoordination
- Infantile spasms
- More active than typical
- Poor fine motor coordination
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Dystonia
- Repeated seizures without recovery between them
- Abnormal pyramidal sign
- Developmental stagnation
- Limb ataxia
Abnormality of the cardiovascular system
- Paroxysmal atrial fibrillation
- Abnormal heart rate
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Complete right bundle branch block
- Fainting spell
- Heart block
- Heart stops beating
Zobrazit ještě 15 rysů
- Left atrial enlargement
- Narrowing of aortic valve
- Palpitations
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- ST segment elevation
- Elevated heart rate
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Sick sinus syndrome
- Supraventricular tachycardia
- Ventricular fibrillation
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Trifascicular block
- Ventricular arrhythmia
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SCN1B: sodium voltage-gated channel beta subunit 1. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/scn1b
Dante Labs. Gen SCN1B: sodium voltage-gated channel beta subunit 1 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/scn1b
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů