Gen
SCN1B
sodium voltage-gated channel beta subunit 1
- HGNC 10586↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000105711↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6324↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 19q13.11
- Współrzędne
- Chromosom 19: 35 030 470–35 040 449 (GRCh38)
- Eksony
- 6 eksonów na odcinku 10 kb
- Białko
- 218 aminokwasów
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000262631.11NM_001037.5
- Typ locus
- Protein-coding
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/scn1b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj SCN1B oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu SCN1B
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,7 kb z 10 kb genu; 657 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie SCN1B
38
pozycje w genie SCN1B, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, w którym krótkie odczyty mają trudności.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 10 kb genu SCN1B, łącznie z intronami, a nie tylko 1,7 kb eksonów.
Warianty z podstroną (1)
Warianty SCN1B z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|
| c.449-2A>G | Intron 3 | 35 039 115 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Wspólne schorzenie: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SCN1B
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SCN1B. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Generalized myoclonic seizure
- Grand mal seizures
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized-onset seizure
- Global developmental delay
- Intellectual disability
Pokaż jeszcze 66 cech
- Loss of developmental milestones
- Progressive gait ataxia
- Seizure affecting one half of brain
- Anxiety
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Cognitive impairment
- Complex febrile seizure
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Epilepsia partialis continua
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal aware seizure
- Focal hemiclonic seizure
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized clonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Increased reflexes
- Interictal epileptiform activity
- Jerking
- Lethargy
- Multifocal epileptiform discharges
- Obsessive-compulsive trait
- Parkinsonism
- Photosensitive myoclonic seizure
- Photosensitive tonic-clonic seizure
- Slow movements
- Action tremor
- Ataxia
- Atypical absence status epilepticus
- Choreoathetosis
- Cortical dysplasia
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- Dysgenesis of the hippocampus
- EEG with focal epileptiform discharges
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized brain degeneration
- Generalized cerebral degeneration/underdevelopment
- Generalized tonic seizure
- Impulsivity
- Incoordination
- Infantile spasms
- More active than typical
- Poor fine motor coordination
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Status epilepticus without prominent motor symptoms
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Dystonia
- Repeated seizures without recovery between them
- Abnormal pyramidal sign
- Developmental stagnation
- Limb ataxia
Abnormality of the cardiovascular system
- Paroxysmal atrial fibrillation
- Abnormal heart rate
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Complete right bundle branch block
- Fainting spell
- Heart block
- Heart stops beating
Pokaż jeszcze 15 cech
- Left atrial enlargement
- Narrowing of aortic valve
- Palpitations
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- ST segment elevation
- Elevated heart rate
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Sick sinus syndrome
- Supraventricular tachycardia
- Ventricular fibrillation
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Trifascicular block
- Ventricular arrhythmia
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SCN1B: sodium voltage-gated channel beta subunit 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/scn1b
Dante Labs. Gen SCN1B: sodium voltage-gated channel beta subunit 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/scn1b
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni