Gen
CDKL5
cyclin dependent kinase like 5
- HGNC 11411↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000008086↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6792↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- Xp22.13
- Souřadnice
- Chromozom X: 18 425 608–18 640 196 (GRCh38)
- Exony
- 18 exonů na 214,6 kb
- Protein
- 960 aminokyselin
- Dědičnost
- X-vázaně dominantní
- Další názvy
- EIEE2, CFAP247
- Předchozí symboly
- STK9
- Transkript MANE Select
- ENST00000623535.2NM_001323289.2
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si CDKL5 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Epilepsy (Full Panel)
- CDKL5 Deficiency DisorderX-vázaně dominantní
A developmental and epileptic encephalopathy caused by CDKL5 variants, with seizures beginning in the first months of life and severe developmental delay.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Ganaxolone is FDA-approved for seizures associated with CDKL5 deficiency disorder.
- Atypical Rett Syndrome
A neurodevelopmental disorder that is diagnosed when a child presents with a Rett-like syndrome but does not fulfill all the diagnostic criteria for typical Rett syndrome (classic/typical RTT).
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Epilepsy
Jeden z 171 genů spojených s touto vazbou
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Dědičnost
- X-vázaně dominantní
- Změna je na chromozomu X a stačí jedna kopie. Matka, která ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma; otec ji předá všem svým dcerám a žádnému synovi.
Jak je CDKL5 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 14,6 kb z 214,6 kb genu; 2 883 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte CDKL5
397
pozic v genu CDKL5, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 214,6 kb genu CDKL5, včetně intronů, nikoli jen 14,6 kb exonů.
Varianty se stránkou (33)
Varianty genu CDKL5 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A40V | c.119C>T | Exon 4 | 18 564 496 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A157P | c.469G>C | Exon 8 | 18 584 268 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A157V | c.470C>T | Exon 8 | 18 584 269 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.146-1G>A | Intron 4 | 18 575 353 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.2151A>G | Exon 14 | 18 609 569 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| C30Y | c.89G>A | Exon 3 | 18 510 844 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| C152R | c.454T>C | Exon 7 | 18 581 941 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| D193G | c.578A>G | Exon 9 | 18 587 977 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| D193V | c.578A>T | Exon 9 | 18 587 977 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| E74X | c.220G>T | Exon 5 | 18 575 428 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseSdílí 1 onemocnění
- ACTL6Bactin like 6BSdílí 1 onemocnění
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Sdílí 1 onemocnění
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Sdílí 1 onemocnění
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitSdílí 1 onemocnění
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorSdílí 1 onemocnění
- ARXaristaless related homeoboxSdílí 1 onemocnění
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Sdílí 1 onemocnění
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s CDKL5
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CDKL5. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- EEG with generalized slow activity
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Abnormal gait
- Abnormality of movement
- Agitation
- Autism spectrum disorder
- Difficulty sleeping
Zobrazit ještě 73 rysů
- EEG abnormality
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Generalized tonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- Involuntary movements
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Poor eye contact
- Stereotypical hand wringing
- Abnormality of the nervous system
- Apraxia
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Dystonia
- EEG with burst suppression
- Focal tonic seizure
- Generalized-onset seizure
- Grand mal seizures
- Hand apraxia
- Impaired pain sensation
- Inability to coordinate movements when walking
- Inability to speak
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Lethargy
- Limb myoclonus
- Loss of ability to walk
- Moderate global developmental delay
- Multifocal epileptiform discharges
- Myoclonic seizure
- Neonatal seizure
- Poor social interactions
- Repetitive movements
- Restrictive behavior
- Seizure affecting one half of brain
- Severe global developmental delay
- Sleep-wake cycle disturbance
- Tactile hypersensitivity
- Teeth grinding
- Tongue thrusting
- Brief seizures with staring spells
- Chorea
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
- Delayed myelination
- Developmental stagnation
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Fewer and broader ridges in brain
- Generalized clonic seizure
- Inappropriate crying
- Inappropriate laughter
- Intellectual disability, mild
- More active than typical
- Panic attack
- Paroxysmal bursts of laughter
- Pill-rolling tremor
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- IQ less than 20
- Multifocal seizures
Abnormality of the musculoskeletal system
- Functional motor deficit
- Scoliosis
- Abnormal muscle tone
- Decreased muscle tone in infant
- Generalized decreased muscle tone
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone
- Poor head control
Zobrazit ještě 2 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CDKL5: cyclin dependent kinase like 5. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/cdkl5
Dante Labs. Gen CDKL5: cyclin dependent kinase like 5 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/cdkl5
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů