Genă
ATP6V0A2
ATPase H+ transporting V0 subunit a2
- HGNC 18481↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000185344↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 23545↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 12q24.31
- Coordonate
- Cromozomul 12: 123.712.353–123.761.755 (GRCh38)
- Exoni
- 20 de exoni pe 49,4 kb
- Proteină
- 856 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- TJ6, a2, TJ6s, TJ6M, ATP6a2, J6B7, ATP6N1D, Vph1, Stv1, a2V, RTF
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000330342.8NM_012463.4
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp6v0a2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți ATP6V0A2 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRapoarte curatoriate relevante pentru această genă
Cutis Laxa
Cutis laxa (CL) este o tulburare a țesutului conjunctiv, ereditară sau dobândită, caracterizată printr-o piele cutată, redundantă și neelastică, care se lasă, asociată cu anomalii scheletice și de dezvoltare și, în unele cazuri, cu afectare sistemică severă. Au fost descrise mai multe forme diferite de CL ereditară, diferențiate în funcție de modul de transmitere și de gradul de afectare a organelor interne, de anomaliile asociate și de severitatea bolii.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Osteogenesis Imperfecta
Un grup de tulburări ereditare ale țesutului conjunctiv care cauzează oase fragile, ușor de fracturat, adesea cu sclere albastre, pierderea auzului și probleme dentare.
- 2 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Bisfosfonați intravenoși ciclici (pamidronat, zoledronat); fixare ortopedică a oaselor lungi cu tije intramedulare; kinetoterapie; denosumab (utilizat clinic în OI pediatrică); romosozumab (în dezvoltare); monitorizarea auzului; management stomatologic pentru dentinogeneza imperfectă
Grupări mai largi
Tulburări congenitale ale glicozilării
- Tulburări congenitale ale glicozilării (CDG)
Una dintre cele 98 gene legate de ea
Un grup mare de afecțiuni ereditare în care lanțurile de zahăr (glicani) nu sunt construite sau atașate corect la proteine și lipide, afectând adesea creierul, ficatul, coagularea sângelui, creșterea și multe alte sisteme ale organismului. Majoritatea sunt autozomal recesive, dar unele sunt legate de cromozomul X sau autozomal dominante.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 5 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
Structura genei ATP6V0A2
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 6,5 kb din cei 49,4 kb ai genei; 2.571 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențiere ATP6V0A2
4Ușor
Cât de greu este de secvențiat ATP6V0A2 cu citiri scurte, din 100
0 · Ușor100 · Greu
Aproape toți exonii lui ATP6V0A2 se află în zone în care citirile scurte se aliniază curat.
Ce adaugă: ponderea exonilor lui ATP6V0A2 din fiecare tip de regiune dificilă
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 pb nu pot fi plasate unic, astfel încât un apel de acolo poate lipsi sau fi greșit. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 100.0,5 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogi și pseudogene, cu identitate de 90% sau mai mare. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 60.0 %
- Comună cu chrYRegiunile pseudoautozomale și regiunea transpusă X, unde chrX și chrY conțin aceeași secvență sau una aproape identică, astfel încât o citire de pe unul poate fi plasată pe celălalt. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 60.0 %
- Acoperire de referințăGoluri din apropiere în asamblarea de referință, unde nu există secvență cu care citirile să se alinieze. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 50.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere integral. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 30.5,1 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Luată singură, o genă situată în întregime în acest tip de regiune ar primi scorul 20.8,4 %
Un scor Dante Labs din propriile noastre cercetări, construit pe hărțile regiunilor greu de secvențiat Genome in a Bottle ale NIST.Cum se calculează scorulFiecare bară reprezintă ponderea bazelor exonice ale lui ATP6V0A2 aflate în acel tip de regiune dificilă. Fiecare tip poate face singur o genă greu de analizat, iar fiecare tip suplimentar adaugă mai puțin: 0 când nicio bază nu se află în niciunul, 100 când fiecare bază se află acolo unde citirile nu pot fi plasate unic.
27
poziții în ATP6V0A2 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre ele nu se află într-o regiune în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
Un genom complet acoperă toți cei 49,4 kb ai ATP6V0A2, inclusiv intronii, nu doar cei 6,5 kb de exoni.
ClinVar pathogenic variants (27)
The ATP6V0A2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenă 11
- Probabil patogenă 16
| Variantă | Conditions | Clasificare ClinVar | Stare de revizuire |
|---|---|---|---|
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.78dup (p.Ser27fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 2 others | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.130del (p.Asn43_Val44insTer) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.187C>T (p.Arg63Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 2 others | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.390_397dup (p.Arg133delinsThrCysTer) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.535del (p.Gly178_Leu179insTer) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.598_599dup (p.Ile201fs) (opens in a new tab) | cutis laxa | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1002del (p.Leu335fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1514+1G>A (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1576C>T (p.Arg526Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1776_1777dup (p.Phe593fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.2113C>T (p.Gln705Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A | Patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.16_19del (p.Arg6fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.117+1del (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.124C>T (p.Gln42Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.197-1G>A (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.208C>T (p.Gln70Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.726T>A (p.Cys242Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1046del (p.Ser349fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1189G>C (p.Ala397Pro) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1214C>T (p.Pro405Leu) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1418C>G (p.Ser473Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1501_1514+15del (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1724+2T>C (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.1935+1G>C (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
| NM_012463.4(ATP6V0A2):c.2137C>T (p.Gln713Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive cutis laxa type 2A and 1 other | Probabil patogenă | ★★★★1 stea din 4 criterii furnizate, un singur depunător |
See all 27 with every other ATP6V0A2 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gene asociate acelorași afecțiuni
- GORABgolgin, RAB6 interactingAre 3 de afecțiuni în comun
- PYCR1pyrroline-5-carboxylate reductase 1Are 2 de afecțiuni în comun
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Are 1 afecțiune în comun
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Are 1 afecțiune în comun
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseAre 1 afecțiune în comun
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseAre 1 afecțiune în comun
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseAre 1 afecțiune în comun
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitAre 1 afecțiune în comun
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitAre 1 afecțiune în comun
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseAre 1 afecțiune în comun
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseAre 1 afecțiune în comun
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseAre 1 afecțiune în comun
Trăsături asociate cu ATP6V0A2
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca ATP6V0A2. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of head or neck
- Delayed closure of the soft spot on the skull
- Eye folds
- Long philtrum
- Scaphocephaly
- Small retruded chin
- Wider-than-typical soft spot of skull
- Abnormality of the cheek
- Broad nasal tip
Afișați încă 22 de trăsături
- Deep laugh lines
- Delayed eruption of teeth
- Dental cavities
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Extra bones within cranial sutures
- High palate
- Nasal tip, upturned
- Progressively abnormally small cranium
- Redundant neck skin
- Short nose
- Small, cone shaped teeth
- Smooth philtrum
- Zygomatic flattening
- Dandy-Walker malformation
- Abnormally small head
- Decreased size of tooth
- Delayed cranial suture closure
- Flat face
- Frontal bossing
- Midface retrusion
- Narrow mouth
- Wide nasal bridge
Abnormality of limbs
- Dislocated hip since birth
- Dropped arches
- Coxa vara
- Deep palm line
- Deep wrinkles in soles of feet
- Multiple palm lines
- Multiple plantar creases
- Slender long bones with narrow shaft
Afișați încă 3 de trăsături
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-19: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.19-9814e911.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena ATP6V0A2: ATPase H+ transporting V0 subunit a2. Accesat 20 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/atp6v0a2
Dante Labs. Gena ATP6V0A2: ATPase H+ transporting V0 subunit a2 [Internet]. [citat 20 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/atp6v0a2
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni