Geen
ERCC2
ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunit
- HGNC 3434↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000104884↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 2068↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 19q13.32
- Koordinaadid
- Kromosoom 19: 45 349 837–45 370 573 (GRCh38)
- Eksonid
- 23 eksonit, ulatus 20,7 kb
- Valk
- 760 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- MAG, EM9, MGC102762, MGC126218, MGC126219
- Varasemad tähised
- XPD
- MANE Select transkript
- ENST00000391945.10NM_000400.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe ERCC2 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
DNA-reparatsiooni haigus
- Autosoomne retsessiivne
Haigus, mille aluseks on DNA-reparatsiooni häired.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 7 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mikroftalmia, anoftalmia ja kolobooma
- Sündroomne mikroftalmia
Mikroftalmia, mis esineb koos silmaväliste tunnustega ning mida põhjustavad muutused geenides nagu SOX2, OTX2, BCOR, STRA6 ja BMP4.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Geneetiline diagnoos suunab kontrolli seotud tunnuste suhtes, näiteks hüpofüüsi hormoonitalitluse häired SOX2 või OTX2 korral, ning aitab hinnata kordumise riski.
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas ERCC2 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 4,1 kb kogupikkusega 20,7 kb; neist 2283 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse ERCC2
151
kohad geenis ERCC2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ERCC2 20,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,1 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitJagab 2 haigust
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseJagab 2 haigust
- APTXaprataxinJagab 1 haigust
- BCORBCL6 corepressorJagab 1 haigust
- BMP4bone morphogenetic protein 4Jagab 1 haigust
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Jagab 1 haigust
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Jagab 1 haigust
- COX7Bcytochrome c oxidase subunit 7BJagab 1 haigust
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CJagab 1 haigust
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Jagab 1 haigust
Geeniga ERCC2 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ERCC2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the integument
- Flattened and twisted hair
- Photosensitive skin
- Sparse hair
- Trichorrhexis nodosa
- Trichoschisis
- Dry skin
- Freckling
- Numerous pigmented freckles
Näita veel 29 tunnust
- Poikiloderma
- Prematurely aged appearance
- Skin degeneration
- Thickened skin
- Thin skin
- Basal cell carcinoma
- Flat, discolored area of skin
- Hyperkeratosis
- Hyperpigmented skin patches
- Papilloma
- Patchy loss of skin color
- Squamous cell carcinoma of the skin
- Absent/small nails
- Beauty mark
- Brittle hair
- Brittle nails
- Grooved nails
- Hair loss
- Ichthyosis
- Longitudinal splitting of nail
- Poor fingernail formation
- Pterygium
- Spoon-shaped nails
- Squamous cell carcinoma
- Tiger tail banding
- Congenital nonbullous ichthyosiform erythroderma
- Fine hair
- Poor nail formation
- Small nail
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Absent/small cerebellum
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- EEG abnormality
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
Näita veel 25 tunnust
- Severe global developmental delay
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Confusion
- Demyelinating peripheral neuropathy
- Difficulty articulating speech
- Diminished deep tendon reflex
- Epilepsy
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Cerebral dysmyelination
- Decreased reflex response
- Diffuse cerebellar atrophy
- Generalized hyperreflexia
- Generalized-onset seizure
- Inability to coordinate movements when walking
- Intention tremor
- Paraplegia/paraparesis
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Peripheral neuropathy
- Periventricular leukomalacia
- Poor social interactions
- Ventriculomegaly
- Choreoathetosis
- Delayed speech and language development
- Mental deterioration
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Beaked nose
- Little lower jaw
- Prominent nose
- Receding chin
- Abnormal dentition
- Abnormal of nasal shape
- Drooping lower lip
Näita veel 24 tunnust
- Prominent metopic ridge
- Small dilated blood vessels near membrane covering front of eye and eyelids
- Wide nasal bridge
- Short neck
- Absence of scalp hair
- Adhesion of eyelids
- Bird-like facial appearance
- Coarse facial features
- Deformity of the skull
- Dental cavities
- Dry eye syndrome
- Enlargement of craniofacial bones
- Everted eyelid
- Eye folds
- Eyelid folded in
- Flat nasal alae
- High, narrow palate
- Hypoplasia of mandible relative to maxilla
- Inflammation of eyelids
- Pink eye
- Sparse scalp hair
- Thin dental enamel
- Short nose
- Triangular mouth
Abnormality of the eye
- Abnormally small eyeball
- Clouding of the lens of the eye
- Clouding of the lens of the eye at birth
- Deeply set eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Noninflammatory retina disease
- Optic atrophy
- Corneal inflammation
Näita veel 17 tunnust
- Cross-eyed
- Double vision
- Visual impairment
- Abnormal retinal pigmentation
- Abnormally close eyes
- Abnormally small eyeball on both sides
- Astigmatism
- Close sighted
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Eye tumor
- Inward turning cross eyed
- Macular degeneration
- New blood vessel formation in cornea
- Opacification of the corneal stroma
- Retina degeneration
- Wide-set eyes
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ERCC2 geen: ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunit. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ercc2
Dante Labs. ERCC2 geen: ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunit [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ercc2
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast