Geen
BRCA1
BRCA1 DNA repair associated
- HGNC 1100↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000012048↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 672↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 17q21.31
- Koordinaadid
- Kromosoom 17: 43 044 295–43 125 364 (GRCh38)
- Eksonid
- 23 eksonit, ulatus 81,1 kb
- Valk
- 1863 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- RNF53, BRCC1, PPP1R53, FANCS
- MANE Select transkript
- ENST00000357654.9NM_007294.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe BRCA1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
DNA-reparatsiooni haigus
- Autosoomne retsessiivne
Haigus, mille aluseks on DNA-reparatsiooni häired.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Fanconi'i anemia
- Autosoomne retsessiivne
Fanconi'i anemia (FA) on pärilik DNA parandusmehhanismi häire, mida iseloomustab progresseeruv pantsütopeenia koos luuüdi talitlushäirega, varieeruvad kaasasündinud väärarengud ja eelsoodumus hematoloogiliste või solidsete kasvajate tekkeks.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Hematopoeetiliste tüvirakkude siirdamine FA-spetsiifilise vähendatud intensiivsusega konditsioneerimise abil; androgeenid (oksümetoloon) sillateraapiana; vähi jälgimine pea- ja kaelapiirkonna ning günekoloogiliste pahaloomuliste kasvajate suhtes; geeniteraapia kliinilistes uuringutes
Pärilik rinna- ja munasarjavähk (BRCA1/2)
- BRCA1-ga seotud vähiriski eelsoodumusAutosoomne dominantne
BRCA1 variandid, mis suurendavad eluaegset riski haigestuda rinna-, munasarja- ja muudesse vähkidesse.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Tõhustatud rinnanäärme skriining, sh MRT-uuring, riski vähendava operatsiooni kaalumine ja lähisugulaste testimine.
- Pärilik rinna- ja munasarjavähi sündroomAutosoomne dominantne
Vähieelsoodumuse sündroom, mis on kõige sagedamini tingitud BRCA1 või BRCA2 variantidest ja millega kaasnevad kõrged rinna- ja munasarjavähi riskid kogu elu jooksul.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Geneetiline nõustamine, täiendav sõeluuring, riski vähendav kirurgia
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas BRCA1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 7,1 kb kogupikkusega 81,1 kb; neist 5592 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse BRCA1
2680
kohad geenis BRCA1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 52 (1,9%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Segmental duplications (52 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni BRCA1 81,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (7,1 kb).
Variandid, millel on leht (2450)
Siin on BRCA1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A92Ffs*4 | c.273_274del | Ekson 5 | 43 104 894 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A134Qfs*7 | c.399_400del | Ekson 6 | 43 104 162 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A302Cfs*2 | c.903_904insT | Ekson 10 | 43 094 627 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A302Lfs*12 | c.904del | Ekson 10 | 43 094 626 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A322Kfs*2 | c.964_968del | Ekson 10 | 43 094 562 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A322Lfs*19 | c.964del | Ekson 10 | 43 094 566 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A407Sfs*5 | c.1218_1219insA | Ekson 10 | 43 094 312 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A433Pfs*8 | c.1297del | Ekson 10 | 43 094 233 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A469Qfs*6 | c.1405del | Ekson 10 | 43 094 125 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A521X | c.1561_1564delinsTAAA | Ekson 10 | 43 093 967 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedJagab 3 haigust
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Jagab 2 haigust
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitJagab 2 haigust
- FANCAFA complementation group AJagab 2 haigust
- FANCBFA complementation group BJagab 2 haigust
- FANCCFA complementation group CJagab 2 haigust
- FANCD2FA complementation group D2Jagab 2 haigust
- FANCEFA complementation group EJagab 2 haigust
- FANCFFA complementation group FJagab 2 haigust
- FANCGFA complementation group GJagab 2 haigust
- FANCIFA complementation group IJagab 2 haigust
- FANCLFA complementation group LJagab 2 haigust
Geeniga BRCA1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida BRCA1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the digestive system
- Pancreatic adenocarcinoma
- Abdominal bloating
- Abdominal pain
- Anorexia
- Biliary tract neoplasm
- Constipation
- Inability to properly digest food due to lack of pancreatic digestive enzymes
- Jaundice
Näita veel 19 tunnust
- Nausea and vomiting
- Peritonitis
- Poor appetite
- Primary peritoneal carcinoma
- Extrahepatic cholestasis
- Functional intestinal obstruction
- Intestinal pseudo-obstruction
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Colon cancer
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Intermittent diarrhea
- Liver cancer
- Meckel diverticulum
- Peritoneal abscess
- Umbilical hernia
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Coarse facial features
- Low frontal hairline
- Prominent nasal bridge
- Underdeveloped tissue around nostril
- Almond shaped eyes
- Short opening between the eyelids
- Abnormality of the eyelid
Näita veel 18 tunnust
- Aplasia/Hypoplasia of the uvula
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Cleft palate
- Eye folds
- Facial asymmetry
- Frontal bossing
- High palate
- Little lower jaw
- Long, narrow head
- Sloping forehead
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Bad bite
- Full upper lip
- Increased size of tooth
- Long eyelashes
- Narrow opening between the eyelids
- Narrow palate
- Nasal tip, upturned
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Swollen lymph nodes
- Abnormal aortic morphology
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal carotid artery morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arteriovenous malformation
- Enlarged and thickened heart muscle
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Abnormal shape of nervous system
- Cranial nerve paralysis
- Increased reflexes
- Split spine
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). BRCA1 geen: BRCA1 DNA repair associated. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/brca1
Dante Labs. BRCA1 geen: BRCA1 DNA repair associated [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/brca1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast