Geen
BRIP1
BRCA1 interacting DNA helicase 1
- HGNC 20473↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000136492↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 83990↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 17q23.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 17: 61 679 139–61 863 528 (GRCh38)
- Eksonid
- 20 eksonit, ulatus 184,4 kb
- Valk
- 1249 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- OF, BACH1, FANCJ
- MANE Select transkript
- ENST00000259008.7NM_032043.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe BRIP1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
DNA-reparatsiooni haigus
- Autosoomne retsessiivne
Haigus, mille aluseks on DNA-reparatsiooni häired.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Fanconi'i anemia
- Autosoomne retsessiivne
Fanconi'i anemia (FA) on pärilik DNA parandusmehhanismi häire, mida iseloomustab progresseeruv pantsütopeenia koos luuüdi talitlushäirega, varieeruvad kaasasündinud väärarengud ja eelsoodumus hematoloogiliste või solidsete kasvajate tekkeks.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Hematopoeetiliste tüvirakkude siirdamine FA-spetsiifilise vähendatud intensiivsusega konditsioneerimise abil; androgeenid (oksümetoloon) sillateraapiana; vähi jälgimine pea- ja kaelapiirkonna ning günekoloogiliste pahaloomuliste kasvajate suhtes; geeniteraapia kliinilistes uuringutes
Vähivärsked geenid peale BRCA1/2 rinna- ja munasarjavähi korral
- Perekondlik munasarjavähkAutosoomne dominantne
Pärilik eelsoodumus munasarjavähile, sealhulgas BRIP1 variantidega seotud eelsoodumus.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Võidakse kaaluda riski vähendamiseks mõeldud munasarjade ja munajuhade eemaldamist.
- Pärilik rinnavähkAutosoomne dominantne
Pärilik eelsoodumus rinnavähile, mis on põhjustatud ühe mitmest geenist variantidest.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Sõltuvalt geenist võidakse soovitada varasemat ja intensiivsemat rinnanäärme sõeluuringut, sealhulgas MRT-uuringut.
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas BRIP1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 8,2 kb kogupikkusega 184,4 kb; neist 3750 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse BRIP1
605
kohad geenis BRIP1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni BRIP1 184,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (8,2 kb).
Variandid, millel on leht (317)
Siin on BRIP1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A27Cfs*42 | c.78dup | Ekson 2 | 61 861 461 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A349P | c.1045G>C | Ekson 8 | 61 801 348 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A402Sfs*19 | c.1203_1204del | Ekson 9 | 61 799 235 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A402Vfs*21 | c.1201_1204dup | Ekson 9 | 61 799 235 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A551Kfs*41 | c.1645_1649dup | Ekson 12 | 61 780 984 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A759Sfs*6 | c.2273dup | Ekson 16 | 61 743 118 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| c.66C>A | Ekson 2 | 61 861 474 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.73_93+14del | Intron 2 | 61 861 432 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.93+1G>A | Intron 2 | 61 861 446 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.93+1G>C | Intron 2 | 61 861 446 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
- PALB2partner and localizer of BRCA2Jagab 3 haigust
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedJagab 2 haigust
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedJagab 2 haigust
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitJagab 2 haigust
- FANCAFA complementation group AJagab 2 haigust
- FANCBFA complementation group BJagab 2 haigust
- FANCCFA complementation group CJagab 2 haigust
- FANCD2FA complementation group D2Jagab 2 haigust
- FANCEFA complementation group EJagab 2 haigust
- FANCFFA complementation group FJagab 2 haigust
- FANCGFA complementation group GJagab 2 haigust
- FANCIFA complementation group IJagab 2 haigust
Geeniga BRIP1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida BRIP1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- Abnormal aortic morphology
- Abnormal aortic valve morphology
- Abnormal carotid artery morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Arteriovenous malformation
- Enlarged and thickened heart muscle
- Patent ductus arteriosus
Näita veel 1 tunnus
Abnormality of the digestive system
- Primary peritoneal carcinoma
- Abnormal connection between trachea and esophagus
- Abnormality of the liver
- Absent anus
- Cancer of the pancreas
- Duodenal stenosis
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Meckel diverticulum
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). BRIP1 geen: BRCA1 interacting DNA helicase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/brip1
Dante Labs. BRIP1 geen: BRCA1 interacting DNA helicase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/brip1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast