Geen
BCOR
BCL6 corepressor
- HGNC 20893↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000183337↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 54880↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- Xp11.4
- Koordinaadid
- Kromosoom X: 40 051 251–40 097 958 (GRCh38)
- Eksonid
- 15 eksonit, ulatus 46,7 kb
- Valk
- 1755 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ20285, KIAA1575
- MANE Select transkript
- ENST00000378444.9NM_001123385.2
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/bcor.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe BCOR ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Mikroftalmia, anoftalmia ja kolobooma
- Sündroomne mikroftalmia
Mikroftalmia, mis esineb koos silmaväliste tunnustega ning mida põhjustavad muutused geenides nagu SOX2, OTX2, BCOR, STRA6 ja BMP4.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 5 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Geneetiline diagnoos suunab kontrolli seotud tunnuste suhtes, näiteks hüpofüüsi hormoonitalitluse häired SOX2 või OTX2 korral, ning aitab hinnata kordumise riski.
Kuidas BCOR on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 6,9 kb kogupikkusega 46,7 kb; neist 5268 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: BCOR
73
BCOR positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu BCOR geeni 46,7 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 6,9 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- BMP4bone morphogenetic protein 4Jagab 1 haigust
- COX7Bcytochrome c oxidase subunit 7BJagab 1 haigust
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitJagab 1 haigust
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitJagab 1 haigust
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseJagab 1 haigust
- FAT1FAT atypical cadherin 1Jagab 1 haigust
- HCCSholocytochrome c synthaseJagab 1 haigust
- HMX1H6 family homeobox 1Jagab 1 haigust
- MAB21L2mab-21 like 2Jagab 1 haigust
- NDUFB11NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B11Jagab 1 haigust
- OTX2orthodenticle homeobox 2Jagab 1 haigust
- RAB18RAB18, member RAS oncogene familyJagab 1 haigust
Geeniga BCOR seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida BCOR võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of head or neck
- Delayed eruption of teeth
- Delayed loss of baby teeth
- High palate
- Long philtrum
- Abnormal dentition
- Cleft nasal tip
- Abnormal dental position
- Abnormality of dental shape
Näita veel 30 tunnust
- Abnormality of the palate
- Abnormally small head
- Bifid uvula
- Broad nasal tip
- Cleft of the mouth
- Cleft palate
- Failure of development of more than six teeth
- Fused teeth
- Narrow face
- Prominent nasal bridge
- Radiculomegaly
- Submucous cleft hard palate
- Adhesion of eyelids
- Dandy-Walker malformation
- Gum enlargement
- Highly arched eyebrow
- Inflammation of the mouth
- Only one upper front tooth
- Skin tag in front of the ear
- Webbed neck
- Absence of upper lateral incisor
- Bad bite
- Cleft upper lip
- Dental crowding
- Extra teeth
- High, narrow palate
- Laterally curved eyebrow
- Long face
- Narrow opening between the eyelids
- Thick eyebrow
Abnormality of limbs
- Contracture of the proximal interphalangeal joint of the 2nd toe
- Contracture of the proximal interphalangeal joint of the 3rd toe
- Curvature of digit
- Prominent fingertip pads
- Webbed fingers or toes
- Broad big toe
- Broad palm
- Complete duplication of thumb bones
Näita veel 18 tunnust
- Curvature of little finger
- Finger syndactyly
- Flexion contracture of the 2nd toe
- Flexion contracture of the 4th toe
- Fused forearm bones
- Gap between 1st and 2nd toes
- Hammertoe
- Permanent flexion of the finger
- Webbed 2nd and 3rd toes
- Webbed skin of 2nd-3rd toes
- Club feet
- Hand clenching
- Knock knees
- Outward turned elbows
- Short thumb
- Abnormal palmar dermatoglyphics
- Joint contracture of the hand
- Radial deviation of finger
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal cardiac septum morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Double outlet right ventricle
- Heart tip and four chambers point towards right side of body
- Mitral valve prolapse
- Narrowing of peripheral lung artery
Abnormality of the ear
- Abnormally shaped ears
- Dizziness
- Ears rotated toward back of head
- Cupped ear
- Hearing impairment
- Sensorineural hearing impairment
- Anteverted ears
- Asymmetric ears
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of the digestive system
- Anorexia
- Abdominal pain
- Feeding difficulties in infancy
- Intestinal malrotation
- Umbilical hernia
- Absent anus
- Enlarged colon lacking nerve cells
- Pyloric stenosis
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). BCOR geen: BCL6 corepressor. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/bcor
Dante Labs. BCOR geen: BCL6 corepressor [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/bcor
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast