Geen
ERCC1
ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit
- HGNC 3433↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000012061↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 2067↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 19q13.32
- Koordinaadid
- Kromosoom 19: 45 407 334–45 423 917 (GRCh38)
- Eksonid
- 10 eksonit, ulatus 16,6 kb
- Valk
- 297 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- RAD10
- MANE Select transkript
- ENST00000300853.8NM_001983.4
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe ERCC1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
DNA-reparatsiooni haigus
- Autosoomne retsessiivne
Haigus, mille aluseks on DNA-reparatsiooni häired.
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mikroftalmia, anoftalmia ja kolobooma
- Sündroomne mikroftalmia
Mikroftalmia, mis esineb koos silmaväliste tunnustega ning mida põhjustavad muutused geenides nagu SOX2, OTX2, BCOR, STRA6 ja BMP4.
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Geneetiline diagnoos suunab kontrolli seotud tunnuste suhtes, näiteks hüpofüüsi hormoonitalitluse häired SOX2 või OTX2 korral, ning aitab hinnata kordumise riski.
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas ERCC1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,4 kb kogupikkusega 16,6 kb; neist 894 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse ERCC1
5
kohad geenis ERCC1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ERCC1 16,6 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,4 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitJagab 2 haigust
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseJagab 2 haigust
- APTXaprataxinJagab 1 haigust
- BCORBCL6 corepressorJagab 1 haigust
- BMP4bone morphogenetic protein 4Jagab 1 haigust
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedJagab 1 haigust
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Jagab 1 haigust
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Jagab 1 haigust
- COX7Bcytochrome c oxidase subunit 7BJagab 1 haigust
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CJagab 1 haigust
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Jagab 1 haigust
Geeniga ERCC1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida ERCC1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Brisk reflexes
- EEG abnormality
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- More grooves in brain
- Simplified gyral pattern
- Small cerebellum
- Absent/small cerebellum
Näita veel 11 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). ERCC1 geen: ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ercc1
Dante Labs. ERCC1 geen: ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ercc1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast