Gen
SCN5A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 5
- HGNC 10593↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000183873↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 6331↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 3p22.2
- Coordenadas
- Cromosoma 3: 38.548.062–38.649.687 (GRCh38)
- Exones
- 28 exones en 101,6 kb
- Proteína
- 2015 aminoácidos
- Herencia
- Autosómica dominante
- También conocido como
- Nav1.5, LQT3, HB1, HBBD, PFHB1, IVF, HB2, HH1, SSS1, CDCD2, CMPD2, ICCD
- Símbolos anteriores
- CMD1E
- Transcrito MANE Select
- ENST00000423572.7NM_000335.5
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
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Obtener mi Genome TestInformes revisados relevantes para este gen
Síndrome de Brugada
Una afección con heterogeneidad genética caracterizada por un bloqueo de rama derecha completo o incompleto acompañado de elevación del segmento ST en las derivaciones V1-V3. Presenta una incidencia elevada de arritmias ventriculares que pueden derivar en muerte súbita.
- 5 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
- En la lista de hallazgos secundarios del ACMG
Qué cambia al conocerlo
Implantación de DAI, control de la fiebre, asesoramiento genético, evitación de fármacos desencadenantes
Enfermedad cardíaca de conducción progresiva y síndrome del seno enfermo
- Trastorno del ritmo cardíaco relacionado con SCN5AAutosómica dominante
Un conjunto de trastornos del ritmo cardíaco causados por alteraciones en SCN5A, entre ellos la enfermedad de conducción, el síndrome del seno enfermo, el síndrome de Brugada, el síndrome de QT largo tipo 3 y la fibrilación auricular, normalmente en un corazón con estructura normal.
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 6 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
- En la lista de hallazgos secundarios del ACMG
Qué cambia al conocerlo
Conocerlo facilita el control con electrocardiograma, evitar determinados medicamentos y el cribado con electrocardiograma de los familiares.
- Bloqueo cardíaco familiar progresivoAutosómica dominante
Un trastorno hereditario de la conducción, causado por alteraciones en genes como SCN5A y TRPM4, que puede progresar hasta un bloqueo cardíaco completo, provocando mareos, desmayos o, en raras ocasiones, muerte súbita.
- 1 remitente de GenCC la califica como definitiva o fuerte
Qué cambia al conocerlo
Conocerlo facilita los controles periódicos con electrocardiograma y la implantación oportuna de un marcapasos.
- Síndrome del seno enfermo familiar
Una disfunción hereditaria del marcapasos natural del corazón, causada por alteraciones en genes como HCN4, SCN5A y MYH6, que provoca ritmos cardíacos lentos o irregulares.
- 1 remitente de GenCC la califica como definitiva o fuerte
Qué cambia al conocerlo
Conocerlo facilita el seguimiento de los ritmos cardíacos lentos y la colocación de un marcapasos si aparecen síntomas.
Miocardiopatía dilatada
Agrandamiento y debilitamiento del ventrículo izquierdo no explicados por una enfermedad de las arterias coronarias o de las válvulas; las formas hereditarias implican TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN y otros muchos genes, e incluyen el síndrome de Barth y las distrofias musculares de Emery-Dreifuss.
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 4 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
- En la lista de hallazgos secundarios del ACMG
Qué cambia al conocerlo
Conocer una causa genética favorece una monitorización cardíaca más temprana y el cribado familiar, y en genes con un alto riesgo de arritmia, como LMNA, FLNC y RBM20, orienta las decisiones sobre la monitorización del ritmo y los desfibriladores implantables.
Síndrome de QT largo
Un trastorno de la repolarización cardíaca caracterizado por un intervalo QT prolongado y el riesgo de sufrir arritmias ventriculares potencialmente mortales, como la torsade de pointes.
- 3 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
- En la lista de hallazgos secundarios del ACMG
Qué cambia al conocerlo
Betabloqueantes, implantación de DAI, restricción de la actividad física, asesoramiento genético
Herencia
- Autosómica dominante
- Basta con una copia alterada, procedente de cualquiera de los progenitores. Un progenitor que la tenga la transmite a cada hijo con una probabilidad de uno entre dos.
Estructura de SCN5A
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
- Variantes con una página
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 8,5 kb de los 101,6 kb del gen; 6048 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen SCN5A
245
posiciones en SCN5A donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
1 de ellas (0,4 %) cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
- Low mappability (1 sitio)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Un genoma completo cubre los 101,6 kb de SCN5A, incluidos los intrones, y no solo los 8,5 kb de exones.
Variantes con una página (47)
Las variantes de SCN5A con una página aquí, primero las de más estrellas de revisión. Cada página describe el registro público de ClinVar sobre la variante, nunca un resultado.
| Variante | HGVS c. | Exón o intrón | Posición (GRCh38) | Clasificación en ClinVar | Estado de revisión |
|---|---|---|---|---|---|
| A997S | c.2989G>T | Exón 17 | 38.581.170 | Probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| A1427S | c.4279G>T | Exón 24 | 38.557.248 | Probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| c.611+1G>A | Intrón 5 | 38.620.842 | Patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos | |
| c.935-3C>G | Intrón 7 | 38.608.217 | Probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos | |
| c.1140+1G>A | Intrón 9 | 38.606.668 | Patogénica/probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos | |
| c.1890G>A | Exón 12 | 38.603.712 | Patogénica/probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos | |
| c.4242+1G>C | Intrón 23 | 38.560.146 | Patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos | |
| c.4434+5G>A | Intrón 25 | 38.556.436 | Probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos | |
| D356N | c.1066G>A | Exón 9 | 38.606.743 | Patogénica/probablemente patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
| D1274N | c.3820G>A | Exón 21 | 38.566.426 | Patogénica | ★★★★2 estrellas de 4 criterios proporcionados, varios remitentes, sin conflictos |
Genes vinculados a las mismas afecciones
- ABCC9ATP binding cassette subfamily C member 9Comparte 1 afección
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Comparte 1 afección
- BAG3BAG cochaperone 3Comparte 1 afección
- BAG5BAG cochaperone 5Comparte 1 afección
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CComparte 1 afección
- CALM1calmodulin 1Comparte 1 afección
- CALM2calmodulin 2Comparte 1 afección
- CALM3calmodulin 3Comparte 1 afección
- DESdesminComparte 1 afección
- DMDdystrophinComparte 1 afección
- DOLKdolichol kinaseComparte 1 afección
- EMDemerinComparte 1 afección
Rasgos asociados a SCN5A
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que SCN5A puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of the cardiovascular system
- Prolonged QTc interval
- Torsade de pointes
- Tricuspid regurgitation
- Ventricular flutter
- Ventricular tachycardia
- Abnormal P wave
- Atrial standstill
- Cardiac conduction abnormality
Mostrar 51 rasgos más
- Left ventricular systolic dysfunction
- Palpitations
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Slow heartbeats
- Stretched and thinned heart muscle
- Ventricular escape rhythm
- Abnormal heart rate
- Abnormality of the heart
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Complete right bundle branch block
- Fainting spell
- Heart block
- Heart stops beating
- Increased circulating troponin T concentration
- Left atrial enlargement
- Left ventricular noncompaction
- Paroxysmal atrial fibrillation
- Permanent atrial fibrillation
- Prolonged PR interval
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right ventricular dilatation
- Sick sinus syndrome
- ST segment elevation
- Stroke
- Sudden cardiac death
- Ventricular fibrillation
- Atrial flutter
- Disease of the heart muscle
- Elevated heart rate
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Ischemic stroke
- Left anterior fascicular block
- Left posterior fascicular block
- Left ventricular hypertrophy
- Mobitz I atrioventricular block
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia with an accessory connection mediated pathway
- Extra heart beat
- Left bundle branch block
- Trifascicular block
- Ventricular arrhythmia
- Absent P wave
- Complete heart block with broad QRS complexes
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Premature atrial contractions
- Prolonged QT interval
- Reduced systolic function
- Sinus bradycardia
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen SCN5A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/scn5a
Dante Labs. Gen SCN5A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/scn5a
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