Gen
SCN5A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 5
- HGNC 10593↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000183873↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6331↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 3p22.2
- Coördinaten
- Chromosoom 3: 38.548.062–38.649.687 (GRCh38)
- Exons
- 28 exons over 101,6 kb
- Eiwit
- 2.015 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- Nav1.5, LQT3, HB1, HBBD, PFHB1, IVF, HB2, HH1, SSS1, CDCD2, CMPD2, ICCD
- Eerdere symbolen
- CMD1E
- MANE Select-transcript
- ENST00000423572.7NM_000335.5
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees SCN5A en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Brugada-syndroom
Een genetisch heterogene aandoening die wordt gekenmerkt door een volledig of onvolledig rechter bundeltakblok, gepaard gaand met ST-elevatie in de afleidingen V1-V3. Ventriculaire ritmestoornissen komen vaak voor en kunnen tot plotselinge dood leiden.
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Wat weten verandert
Plaatsing van een ICD, behandeling van koorts, genetische counseling, vermijden van medicijnen die klachten kunnen uitlokken
Progressieve cardiale geleidingsstoornis en sick sinus-syndroom
- Hartritmestoornis door SCN5AAutosomaal dominant
Een reeks hartritmestoornissen veroorzaakt door veranderingen in SCN5A, waaronder geleidingsstoornis, sick sinus-syndroom, Brugada-syndroom, long QT-syndroom type 3 en atriumfibrilleren, meestal bij een structureel normaal hart.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Wat weten verandert
Door dit te weten kunt u ECG-controles, het vermijden van bepaalde geneesmiddelen en ECG-screening van familieleden beter ondersteunen.
- Progressief familiair hartblokAutosomaal dominant
Een erfelijke geleidingsstoornis, veroorzaakt door veranderingen in genen zoals SCN5A en TRPM4, die kan overgaan in compleet hartblok, met duizeligheid, flauwvallen of, zelden, plotselinge dood als gevolg.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Door dit te weten kunnen regelmatige ECG-controles en tijdige plaatsing van een pacemaker worden ondersteund.
- Familiair sick sinus-syndroom
Een erfelijke stoornis van de natuurlijke pacemaker van het hart, veroorzaakt door veranderingen in genen zoals HCN4, SCN5A en MYH6, die leidt tot trage of onregelmatige hartritmes.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Door dit te weten kunt u controle op trage hartritmes ondersteunen, en een pacemaker als er klachten ontstaan.
Dilaterende cardiomyopathie
Vergroting en verzwakking van de linkerventrikel die niet verklaard wordt door coronaire hartziekte of kleplijden; erfelijke vormen betreffen TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN en vele andere genen, en omvatten het syndroom van Barth en de spierdystrofieën van Emery-Dreifuss.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Wat weten verandert
Het kennen van een genetische oorzaak ondersteunt eerdere hartcontroles en screening van familieleden, en voor genen met een hoog aritmierisico, zoals LMNA, FLNC en RBM20, helpt het bij beslissingen over ritmebewaking en implanteerbare defibrillatoren.
Long-QT-syndroom
Een stoornis in de hartrepolarisatie, gekenmerkt door een verlengd QT-interval en een risico op gevaarlijke ventriculaire ritmestoornissen zoals torsades de pointes.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Wat weten verandert
Bètablokkers, plaatsing van een ICD, beperking van lichamelijke activiteit, erfelijkheidsadvies
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van SCN5A
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 8,5 kb van de 101,6 kb van het gen; 6.048 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest SCN5A leest
245
posities in SCN5A waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
1 daarvan (0,4%) valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
- Low mappability (1 positie)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een volledig genoom dekt alle 101,6 kb van SCN5A, inclusief introns, en niet alleen de 8,5 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (47)
De SCN5A-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A997S | c.2989G>T | Exon 17 | 38.581.170 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| A1427S | c.4279G>T | Exon 24 | 38.557.248 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| c.611+1G>A | Intron 5 | 38.620.842 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| c.935-3C>G | Intron 7 | 38.608.217 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| c.1140+1G>A | Intron 9 | 38.606.668 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| c.1890G>A | Exon 12 | 38.603.712 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| c.4242+1G>C | Intron 23 | 38.560.146 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| c.4434+5G>A | Intron 25 | 38.556.436 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| D356N | c.1066G>A | Exon 9 | 38.606.743 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| D1274N | c.3820G>A | Exon 21 | 38.566.426 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ABCC9ATP binding cassette subfamily C member 9Deelt 1 aandoening
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Deelt 1 aandoening
- BAG3BAG cochaperone 3Deelt 1 aandoening
- BAG5BAG cochaperone 5Deelt 1 aandoening
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CDeelt 1 aandoening
- CALM1calmodulin 1Deelt 1 aandoening
- CALM2calmodulin 2Deelt 1 aandoening
- CALM3calmodulin 3Deelt 1 aandoening
- DESdesminDeelt 1 aandoening
- DMDdystrophinDeelt 1 aandoening
- DOLKdolichol kinaseDeelt 1 aandoening
- EMDemerinDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SCN5A
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SCN5A kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the cardiovascular system
- Prolonged QTc interval
- Torsade de pointes
- Tricuspid regurgitation
- Ventricular flutter
- Ventricular tachycardia
- Abnormal P wave
- Atrial standstill
- Cardiac conduction abnormality
Toon 51 kenmerken meer
- Left ventricular systolic dysfunction
- Palpitations
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Slow heartbeats
- Stretched and thinned heart muscle
- Ventricular escape rhythm
- Abnormal heart rate
- Abnormality of the heart
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Complete right bundle branch block
- Fainting spell
- Heart block
- Heart stops beating
- Increased circulating troponin T concentration
- Left atrial enlargement
- Left ventricular noncompaction
- Paroxysmal atrial fibrillation
- Permanent atrial fibrillation
- Prolonged PR interval
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right ventricular dilatation
- Sick sinus syndrome
- ST segment elevation
- Stroke
- Sudden cardiac death
- Ventricular fibrillation
- Atrial flutter
- Disease of the heart muscle
- Elevated heart rate
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Ischemic stroke
- Left anterior fascicular block
- Left posterior fascicular block
- Left ventricular hypertrophy
- Mobitz I atrioventricular block
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia with an accessory connection mediated pathway
- Extra heart beat
- Left bundle branch block
- Trifascicular block
- Ventricular arrhythmia
- Absent P wave
- Complete heart block with broad QRS complexes
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Premature atrial contractions
- Prolonged QT interval
- Reduced systolic function
- Sinus bradycardia
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SCN5A-gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/scn5a
Dante Labs. SCN5A-gen: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/scn5a
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken