Gen
SCN5A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 5
- HGNC 10593↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000183873↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6331↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 3p22.2
- Współrzędne
- Chromosom 3: 38 548 062–38 649 687 (GRCh38)
- Eksony
- 28 eksonów na odcinku 101,6 kb
- Białko
- 2015 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Znany również jako
- Nav1.5, LQT3, HB1, HBBD, PFHB1, IVF, HB2, HH1, SSS1, CDCD2, CMPD2, ICCD
- Poprzednie symbole
- CMD1E
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000423572.7NM_000335.5
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Odczytaj SCN5A oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Zespół Brugady
Genetycznie heterogenna choroba charakteryzująca się całkowitym lub niecałkowitym blokiem prawej odnogi pęczka Hisa, któremu towarzyszy uniesienie odcinka ST w odprowadzeniach V1–V3. Występuje wysoka częstość komorowych zaburzeń rytmu, które mogą prowadzić do nagłego zgonu.
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Wszczepienie kardiowertera-defibrylatora (ICD), postępowanie w gorączce, poradnictwo genetyczne, unikanie leków mogących wywołać objawy
Postępująca choroba przewodzenia serca i zespół chorego węzła zatokowego
- Zaburzenie rytmu serca związane z SCN5AAutosomalne dominujące
Grupa schorzeń rytmu serca spowodowanych zmianami w genie SCN5A, obejmujących chorobę przewodzenia, zespół chorego węzła zatokowego, zespół Brugady, zespół długiego QT typu 3 oraz migotanie przedsionków, zwykle przy prawidłowej budowie serca.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Świadomość tego stanu sprzyja monitorowaniu EKG, unikaniu niektórych leków oraz badaniom przesiewowym EKG u krewnych.
- Rodzinny postępujący blok sercaAutosomalne dominujące
Dziedziczne zaburzenie przewodzenia, spowodowane zmianami w genach takich jak SCN5A i TRPM4, które może prowadzić do całkowitego bloku serca, powodując zawroty głowy, omdlenia lub, rzadko, nagły zgon.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Świadomość tego stanu sprzyja regularnym kontrolom EKG i terminowemu wszczepieniu stymulatora serca.
- Rodzinny zespół chorego węzła zatokowego
Dziedzicza dysfunkcja naturalnego stymulatora serca, spowodowana zmianami w genach takich jak HCN4, SCN5A i MYH6, prowadząca do wolnego lub nieregularnego rytmu serca.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Świadomość tego stanu sprzyja monitorowaniu wolnego rytmu serca oraz wszczepieniu stymulatora, jeśli pojawią się objawy.
Kardiomiopatia rozstrzeniowa
Powiększenie i osłabienie lewej komory serca, którego nie tłumaczy choroba tętnic wieńcowych ani wad zastawek; postacie dziedziczne są związane z genami TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN i wieloma innymi, i obejmują zespół Barth'a oraz dystrofie mięśniowe Emery'ego-Dreifussa.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Znajomość genetycznej przyczyny ułatwia wcześniejsze monitorowanie pracy serca i badania przesiewowe w rodzinie, a w przypadku genów wiążących się z wysokim ryzykiem arytmii, takich jak LMNA, FLNC i RBM20, pomaga podejmować decyzje dotyczące monitorowania rytmu serca i wszczepialnych defibrylatorów.
Zespół długiego QT
Zaburzenie repolaryzacji serca, które charakteryzuje się wydłużonym odstępem QT i ryzykiem groźnych zaburzeń rytmu komór, takich jak torsade de pointes.
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Beta-blokery, wszczepienie ICD, ograniczenie aktywności fizycznej, poradnictwo genetyczne
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
Budowa genu SCN5A
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 8,5 kb z 101,6 kb genu; 6048 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SCN5A
245
pozycje w SCN5A, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
1 z nich (0,4%) przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (1 miejsce)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 101,6 kb genu SCN5A, łącznie z intronami, a nie tylko 8,5 kb eksonów.
Warianty z podstroną (47)
Warianty SCN5A z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A997S | c.2989G>T | Ekson 17 | 38 581 170 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| A1427S | c.4279G>T | Ekson 24 | 38 557 248 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.611+1G>A | Intron 5 | 38 620 842 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.935-3C>G | Intron 7 | 38 608 217 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.1140+1G>A | Intron 9 | 38 606 668 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.1890G>A | Ekson 12 | 38 603 712 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.4242+1G>C | Intron 23 | 38 560 146 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| c.4434+5G>A | Intron 25 | 38 556 436 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| D356N | c.1066G>A | Ekson 9 | 38 606 743 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| D1274N | c.3820G>A | Ekson 21 | 38 566 426 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ABCC9ATP binding cassette subfamily C member 9Wspólne schorzenie: 1
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Wspólne schorzenie: 1
- BAG3BAG cochaperone 3Wspólne schorzenie: 1
- BAG5BAG cochaperone 5Wspólne schorzenie: 1
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CWspólne schorzenie: 1
- CALM1calmodulin 1Wspólne schorzenie: 1
- CALM2calmodulin 2Wspólne schorzenie: 1
- CALM3calmodulin 3Wspólne schorzenie: 1
- DESdesminWspólne schorzenie: 1
- DMDdystrophinWspólne schorzenie: 1
- DOLKdolichol kinaseWspólne schorzenie: 1
- EMDemerinWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SCN5A
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SCN5A. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the cardiovascular system
- Prolonged QTc interval
- Torsade de pointes
- Tricuspid regurgitation
- Ventricular flutter
- Ventricular tachycardia
- Abnormal P wave
- Atrial standstill
- Cardiac conduction abnormality
Pokaż jeszcze 51 cech
- Left ventricular systolic dysfunction
- Palpitations
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Slow heartbeats
- Stretched and thinned heart muscle
- Ventricular escape rhythm
- Abnormal heart rate
- Abnormality of the heart
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Complete right bundle branch block
- Fainting spell
- Heart block
- Heart stops beating
- Increased circulating troponin T concentration
- Left atrial enlargement
- Left ventricular noncompaction
- Paroxysmal atrial fibrillation
- Permanent atrial fibrillation
- Prolonged PR interval
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right ventricular dilatation
- Sick sinus syndrome
- ST segment elevation
- Stroke
- Sudden cardiac death
- Ventricular fibrillation
- Atrial flutter
- Disease of the heart muscle
- Elevated heart rate
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Ischemic stroke
- Left anterior fascicular block
- Left posterior fascicular block
- Left ventricular hypertrophy
- Mobitz I atrioventricular block
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia with an accessory connection mediated pathway
- Extra heart beat
- Left bundle branch block
- Trifascicular block
- Ventricular arrhythmia
- Absent P wave
- Complete heart block with broad QRS complexes
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Premature atrial contractions
- Prolonged QT interval
- Reduced systolic function
- Sinus bradycardia
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SCN5A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/scn5a
Dante Labs. Gen SCN5A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/scn5a
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni