Gene
SCN5A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 5
- HGNC 10593↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000183873↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 6331↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 3p22.2
- Coordinate
- Cromosoma 3: 38.548.062–38.649.687 (GRCh38)
- Esoni
- 28 esoni su 101,6 kb
- Proteina
- 2015 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Noto anche come
- Nav1.5, LQT3, HB1, HBBD, PFHB1, IVF, HB2, HH1, SSS1, CDCD2, CMPD2, ICCD
- Simboli precedenti
- CMD1E
- Trascritto MANE Select
- ENST00000423572.7NM_000335.5
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.
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Sindrome di Brugada
Una condizione geneticamente eterogenea caratterizzata da blocco di branca destra completo o incompleto accompagnato da sopraslivellamento del tratto ST nelle derivazioni V1-V3. Si riscontra un'elevata incidenza di aritmie ventricolari che possono causare morte improvvisa.
- 5 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Nella lista ACMG dei risultati secondari
Cosa cambia sapendolo
Impianto di ICD, gestione della febbre, consulenza genetica, esclusione di farmaci scatenanti
Malattia cardiaca di conduzione progressiva e sindrome del nodo del seno malato
- Disturbo del ritmo cardiaco correlato a SCN5AAutosomica dominante
Un insieme di disturbi del ritmo cardiaco causati da alterazioni di SCN5A, tra cui malattia di conduzione, sindrome del nodo del seno malato, sindrome di Brugada, sindrome del QT lungo di tipo 3 e fibrillazione atriale, di solito in un cuore strutturalmente normale.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 6 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Nella lista ACMG dei risultati secondari
Cosa cambia sapendolo
Conoscerlo facilita il monitoraggio con ECG, l'evitare determinati farmaci e lo screening ECG dei familiari.
- Blocco cardiaco familiare progressivoAutosomica dominante
Un disturbo ereditario della conduzione, causato da alterazioni di geni come SCN5A e TRPM4, che può progredire fino al blocco cardiaco completo, provocando capogiri, svenimenti o, raramente, morte improvvisa.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscerlo facilita i controlli periodici con ECG e il tempestivo impianto di un pacemaker.
- Sindrome del nodo del seno malato familiare
Una disfunzione ereditaria del pacemaker naturale del cuore, causata da alterazioni di geni come HCN4, SCN5A e MYH6, che provoca ritmi cardiaci lenti o irregolari.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscerlo facilita il monitoraggio dei ritmi cardiaci lenti e l'impianto di un pacemaker in caso di comparsa di sintomi.
Cardiomiopatia dilatativa
Ingrandimento e indebolimento del ventricolo sinistro non spiegati da malattia delle arterie coronarie o delle valvole; le forme ereditarie coinvolgono TTN, LMNA, RBM20, FLNC, BAG3, DSP, MYH7, TNNT2, DES, PLN e molti altri geni, e includono la sindrome di Barth e le distrofie muscolari di Emery-Dreifuss.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Nella lista ACMG dei risultati secondari
Cosa cambia sapendolo
Conoscere una causa genetica favorisce un monitoraggio cardiaco precoce e lo screening dei familiari; per i geni associati a un elevato rischio di aritmie, come LMNA, FLNC e RBM20, orienta le decisioni sul monitoraggio del ritmo e sull'eventuale impianto di defibrillatori.
Sindrome del QT lungo
Un disturbo della ripolarizzazione cardiaca caratterizzato da un intervallo QT prolungato e dal rischio di aritmie ventricolari pericolose, come le torsioni di punta (torsades de pointes).
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
- Nella lista ACMG dei risultati secondari
Cosa cambia sapendolo
Beta-bloccanti, impianto di ICD, limitazione dell'attività fisica, consulenza genetica
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
Struttura di SCN5A
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
- Varianti con una pagina
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 8,5 kb dei 101,6 kb del gene; 6048 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SCN5A
245
posizioni in SCN5A in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
1 di esse (0,4%) si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
- Low mappability (1 sito)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Un genoma intero copre tutti i 101,6 kb di SCN5A, introni inclusi, non solo i 8,5 kb di esoni.
Varianti con una pagina (47)
Le varianti SCN5A con una pagina qui, prima quelle con più stelle di revisione. Ogni pagina descrive il registro pubblico di ClinVar sulla variante, mai un risultato.
| Variante | HGVS c. | Esone o introne | Posizione (GRCh38) | Classificazione ClinVar | Stato di revisione |
|---|---|---|---|---|---|
| A997S | c.2989G>T | Esone 17 | 38.581.170 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| A1427S | c.4279G>T | Esone 24 | 38.557.248 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| c.611+1G>A | Introne 5 | 38.620.842 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.935-3C>G | Introne 7 | 38.608.217 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.1140+1G>A | Introne 9 | 38.606.668 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.1890G>A | Esone 12 | 38.603.712 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.4242+1G>C | Introne 23 | 38.560.146 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| c.4434+5G>A | Introne 25 | 38.556.436 | Probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto | |
| D356N | c.1066G>A | Esone 9 | 38.606.743 | Patogena/probabilmente patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
| D1274N | c.3820G>A | Esone 21 | 38.566.426 | Patogena | ★★★★2 stelle su 4 criteri forniti, più sottomittenti, nessun conflitto |
Geni associati alle stesse condizioni
- ABCC9ATP binding cassette subfamily C member 9Condivide 1 condizione
- ACTC1actin alpha cardiac muscle 1Condivide 1 condizione
- BAG3BAG cochaperone 3Condivide 1 condizione
- BAG5BAG cochaperone 5Condivide 1 condizione
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CCondivide 1 condizione
- CALM1calmodulin 1Condivide 1 condizione
- CALM2calmodulin 2Condivide 1 condizione
- CALM3calmodulin 3Condivide 1 condizione
- DESdesminCondivide 1 condizione
- DMDdystrophinCondivide 1 condizione
- DOLKdolichol kinaseCondivide 1 condizione
- EMDemerinCondivide 1 condizione
Tratti collegati a SCN5A
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SCN5A può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the cardiovascular system
- Prolonged QTc interval
- Torsade de pointes
- Tricuspid regurgitation
- Ventricular flutter
- Ventricular tachycardia
- Abnormal P wave
- Atrial standstill
- Cardiac conduction abnormality
Mostra altri 51 tratti
- Left ventricular systolic dysfunction
- Palpitations
- Reduced left ventricular ejection fraction
- Slow heartbeats
- Stretched and thinned heart muscle
- Ventricular escape rhythm
- Abnormal heart rate
- Abnormality of the heart
- Bundle branch block
- Cardiac failure
- Complete right bundle branch block
- Fainting spell
- Heart block
- Heart stops beating
- Increased circulating troponin T concentration
- Left atrial enlargement
- Left ventricular noncompaction
- Paroxysmal atrial fibrillation
- Permanent atrial fibrillation
- Prolonged PR interval
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Right ventricular dilatation
- Sick sinus syndrome
- ST segment elevation
- Stroke
- Sudden cardiac death
- Ventricular fibrillation
- Atrial flutter
- Disease of the heart muscle
- Elevated heart rate
- First degree atrioventricular block
- Heart attack
- Ischemic stroke
- Left anterior fascicular block
- Left posterior fascicular block
- Left ventricular hypertrophy
- Mobitz I atrioventricular block
- Paroxysmal ventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia
- Supraventricular tachycardia with an accessory connection mediated pathway
- Extra heart beat
- Left bundle branch block
- Trifascicular block
- Ventricular arrhythmia
- Absent P wave
- Complete heart block with broad QRS complexes
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Premature atrial contractions
- Prolonged QT interval
- Reduced systolic function
- Sinus bradycardia
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SCN5A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/scn5a
Dante Labs. Gene SCN5A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/scn5a
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