Gen
SDHD
succinate dehydrogenase complex subunit D
- HGNC 10683↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000204370↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6392↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 11q23.1
- Współrzędne
- Chromosom 11: 112 086 873–112 095 794 (GRCh38)
- Eksony
- 4 eksonów na odcinku 8,9 kb
- Białko
- 159 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Znany również jako
- cybS
- Poprzednie symbole
- PGL, PGL1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000375549.8NM_003002.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj SDHD oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Dziedziczne feochromocytoma i paragangliomy
- Zespół Carney’a-StratakisaAutosomalne dominujące
Połączenie paragangliomy i guza podścieliska przewodu pokarmowego (GIST), wywoływane przez warianty w genach SDH.
- 2 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Nadzór obejmuje zarówno paragangliomy, jak i guzy podścieliska przewodu pokarmowego.
- Dziedziczne feochromocytomaAutosomalne dominujące
Dziedziczna skłonność do guzów produkujących katecholaminy, występujących w rdzeniu nadnerczy.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Badania przesiewowe biochemiczne i obrazowe pozwalają wykryć guzy i usunąć je we wczesnym stadium.
- Dziedziczne feochromocytoma-paragangliomaAutosomalne dominujące
Grupa zespołów (PPGL typów 1–7, związanych z TMEM127 i MAX), w których warianty w genach SDHB, SDHD, SDHC, SDHA, SDHAF2, MAX lub TMEM127 zwiększają ryzyko wystąpienia guza chromochłonnego nadnercza i przyzwojaka.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Regularne badania metanefryn we krwi lub moczu oraz okresowe badanie MRI całego ciała pomagają wykryć guzy we wczesnym stadium, zanim spowodują nagłe skoki ciśnienia tętniczego; krewnym można zaproponować badanie genetyczne.
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
Budowa genu SDHD
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 1,3 kb z 8,9 kb genu; 480 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SDHD
114
pozycje w SDHD, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
50 z nich (44%) przypada na regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (50 miejsc)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 8,9 kb genu SDHD, łącznie z intronami, a nie tylko 1,3 kb eksonów.
Warianty z podstroną (12)
Warianty SDHD z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A33Ifs*35 | c.94_95del | Ekson 2 | 112 087 895 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| c.314+3A>C | Intron 3 | 112 089 014 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów | |
| C11X | c.33C>A | Ekson 1 | 112 086 940 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| D113Mfs*21 | c.337_340del | Ekson 4 | 112 094 823 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| G106V | c.317G>T | Ekson 4 | 112 094 807 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| L20Cfs*66 | c.57del | Ekson 2 | 112 087 860 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| L107R | c.320T>G | Ekson 4 | 112 094 810 | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| P81L | c.242C>T | Ekson 3 | 112 088 939 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| R38X | c.112C>T | Ekson 2 | 112 087 916 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| S32X | c.95C>A | Ekson 2 | 112 087 899 | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BWspólnych schorzeń: 3
- MAXMYC associated transcriptional regulator XWspólnych schorzeń: 2
- SDHCsuccinate dehydrogenase complex subunit CWspólnych schorzeń: 2
- TMEM127transmembrane protein 127Wspólnych schorzeń: 2
- RETret proto-oncogeneWspólne schorzenie: 1
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AWspólne schorzenie: 1
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Wspólne schorzenie: 1
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SDHD
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SDHD. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the cardiovascular system
- Left ventricular hypertrophy
- Left ventricular noncompaction
- Left ventricular systolic dysfunction
- Mitral regurgitation
- Patent foramen ovale
- Stretched and thinned heart muscle
- Tricuspid regurgitation
- Abnormal left ventricular function
Pokaż jeszcze 23 cech
- Abnormality of the cardiovascular system
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Enlarged and thickened heart muscle
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
- Hypertensive retinopathy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
- Sinus tachycardia
- Abnormal atrioventricular conduction
- Arachnoid hemangiomatosis
- Cardiac failure
- Carotid paraganglioma
- Chronic noninfectious lymphadenopathy
- Disease of the heart muscle
- Facial telangiectasia
- Heart murmur
- Hypertensive crisis
- Inflammation of heart muscle
- Noncompaction cardiomyopathy
- Right ventricular failure
- Elevated heart rate
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Dystonia
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- Reduced brain N-acetyl aspartate level by MRS
- Babinski sign
Pokaż jeszcze 20 cech
- Brisk knee jerk
- Cranial nerve paralysis
- Episodic paroxysmal anxiety
- Generalized myoclonic seizure
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Motor delay
- Progressive degeneration of movement
- Progressive psychomotor deterioration
- Recurrent paroxysmal headache
- Upper limb hyperreflexia
- Communication delay
- Cranial nerve compression
- Focal myoclonic seizure
- Inability to move vocal cords
- Irritability
- Moderate global developmental delay
- Panic attack
- Tremor
- Dementia
- Loss of ability to walk
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SDHD: succinate dehydrogenase complex subunit D. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/sdhd
Dante Labs. Gen SDHD: succinate dehydrogenase complex subunit D [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/sdhd
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni