Gen
SDHD
succinate dehydrogenase complex subunit D
- HGNC 10683↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000204370↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 6392↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11q23.1
- Koordinater
- Kromosom 11: 112 086 873–112 095 794 (GRCh38)
- Exoner
- 4 exoner på 8,9 kb
- Protein
- 159 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt dominant
- Även känd som
- cybS
- Tidigare symboler
- PGL, PGL1
- MANE Select-transkript
- ENST00000375549.8NM_003002.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs SDHD, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Ärftligt feokromocytom och paragangliom
- Carney-Stratakis syndromAutosomalt dominant
En kombination av paragangliom och gastrointestinal stromal tumör orsakad av varianter i SDH-generna.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Uppföljningen omfattar både paragangliom och gastrointestinala stromala tumörer.
- Ärftligt feokromocytomAutosomalt dominant
Ärftlig benägenhet för katekolaminproducerande tumörer i binjuremärgen.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Vad kunskapen förändrar
Biokemisk screening och bildundersökningar gör det möjligt att upptäcka och operera bort tumörer tidigt.
- Ärftligt feokromocytom–paragangliomAutosomalt dominant
En grupp syndrom (PPGL typ 1–7, TMEM127- och MAX-relaterade) där varianter i SDHB, SDHD, SDHC, SDHA, SDHAF2, MAX eller TMEM127 ökar risken för feokromocytom och paragangliom.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Vad kunskapen förändrar
Regelbundna blod- eller urinprov för metanefriner och periodisk MR av hela kroppen hjälper till att hitta tumörer tidigt, innan de orsakar blodtryckskriser. Släktingar kan erbjudas testning.
Nedärvning
- Autosomalt dominant
- En förändrad kopia, från någon av föräldrarna, räcker. En förälder som har en sådan för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
Så är SDHD uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,3 kb av genens 8,9 kb, och 480 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest SDHD
114
positioner i SDHD där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
50 av dem (44 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (50 ställen)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalys täcker alla 8,9 kb av SDHD, med introner inräknade, inte bara de 1,3 kb exoner.
Varianter med egen sida (12)
De SDHD-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A33Ifs*35 | c.94_95del | Exon 2 | 112 087 895 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| c.314+3A>C | Intron 3 | 112 089 014 | Sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter | |
| C11X | c.33C>A | Exon 1 | 112 086 940 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| D113Mfs*21 | c.337_340del | Exon 4 | 112 094 823 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| G106V | c.317G>T | Exon 4 | 112 094 807 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| L20Cfs*66 | c.57del | Exon 2 | 112 087 860 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| L107R | c.320T>G | Exon 4 | 112 094 810 | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| P81L | c.242C>T | Exon 3 | 112 088 939 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| R38X | c.112C>T | Exon 2 | 112 087 916 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| S32X | c.95C>A | Exon 2 | 112 087 899 | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
Gener kopplade till samma tillstånd
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BDelar 3 tillstånd
- MAXMYC associated transcriptional regulator XDelar 2 tillstånd
- SDHCsuccinate dehydrogenase complex subunit CDelar 2 tillstånd
- TMEM127transmembrane protein 127Delar 2 tillstånd
- RETret proto-oncogeneDelar 1 tillstånd
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit ADelar 1 tillstånd
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Delar 1 tillstånd
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till SDHD
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SDHD kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the cardiovascular system
- Left ventricular hypertrophy
- Left ventricular noncompaction
- Left ventricular systolic dysfunction
- Mitral regurgitation
- Patent foramen ovale
- Stretched and thinned heart muscle
- Tricuspid regurgitation
- Abnormal left ventricular function
Visa ytterligare 23 egenskaper
- Abnormality of the cardiovascular system
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Enlarged and thickened heart muscle
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
- Hypertensive retinopathy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
- Sinus tachycardia
- Abnormal atrioventricular conduction
- Arachnoid hemangiomatosis
- Cardiac failure
- Carotid paraganglioma
- Chronic noninfectious lymphadenopathy
- Disease of the heart muscle
- Facial telangiectasia
- Heart murmur
- Hypertensive crisis
- Inflammation of heart muscle
- Noncompaction cardiomyopathy
- Right ventricular failure
- Elevated heart rate
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Dystonia
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- Reduced brain N-acetyl aspartate level by MRS
- Babinski sign
Visa ytterligare 20 egenskaper
- Brisk knee jerk
- Cranial nerve paralysis
- Episodic paroxysmal anxiety
- Generalized myoclonic seizure
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Motor delay
- Progressive degeneration of movement
- Progressive psychomotor deterioration
- Recurrent paroxysmal headache
- Upper limb hyperreflexia
- Communication delay
- Cranial nerve compression
- Focal myoclonic seizure
- Inability to move vocal cords
- Irritability
- Moderate global developmental delay
- Panic attack
- Tremor
- Dementia
- Loss of ability to walk
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SDHD-genen: succinate dehydrogenase complex subunit D. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/sdhd
Dante Labs. SDHD-genen: succinate dehydrogenase complex subunit D [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/sdhd
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor