Gen
SDHD
succinate dehydrogenase complex subunit D
- HGNC 10683↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000204370↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 6392↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 11q23.1
- Coördinaten
- Chromosoom 11: 112.086.873–112.095.794 (GRCh38)
- Exons
- 4 exons over 8,9 kb
- Eiwit
- 159 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant
- Ook bekend als
- cybS
- Eerdere symbolen
- PGL, PGL1
- MANE Select-transcript
- ENST00000375549.8NM_003002.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees SDHD en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke feochromocytoom en paraganglioom
- Carney-Stratakis-syndroomAutosomaal dominant
Een combinatie van paraganglioom en gastro-intestinale stromale tumor, veroorzaakt door varianten in de SDH-genen.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Controle omvat zowel paragangliomen als gastro-intestinale stromale tumoren.
- Erfelijk feochromocytoomAutosomaal dominant
Erfelijke aanleg voor catecholamine-producerende tumoren van het bijniermerg.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Wat weten verandert
Biochemische screening en beeldvorming maken het mogelijk tumoren vroeg op te sporen en te verwijderen.
- Erfelijk feochromocytoom-paraganglioomAutosomaal dominant
Een groep syndromen (PPGL-types 1-7, gerelateerd aan TMEM127 en MAX) waarbij varianten in SDHB, SDHD, SDHC, SDHA, SDHAF2, MAX of TMEM127 het risico op feochromocytoom en paraganglioom verhogen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Wat weten verandert
Regelmatig onderzoek van metanefrines in bloed of urine en periodieke MRI van het hele lichaam helpen tumoren vroeg op te sporen, voordat ze tot bloeddrukcrises leiden. Familieleden kunnen worden aangeboden zich te laten testen.
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
Opbouw van SDHD
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,3 kb van de 8,9 kb van het gen; 480 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest SDHD leest
114
posities in SDHD waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
50 daarvan (44%) vallen in gebieden die korte reads moeilijk vinden.
- Low mappability (50 posities)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een volledig genoom dekt alle 8,9 kb van SDHD, inclusief introns, en niet alleen de 1,3 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (12)
De SDHD-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A33Ifs*35 | c.94_95del | Exon 2 | 112.087.895 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| c.314+3A>C | Intron 3 | 112.089.014 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten | |
| C11X | c.33C>A | Exon 1 | 112.086.940 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| D113Mfs*21 | c.337_340del | Exon 4 | 112.094.823 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| G106V | c.317G>T | Exon 4 | 112.094.807 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| L20Cfs*66 | c.57del | Exon 2 | 112.087.860 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| L107R | c.320T>G | Exon 4 | 112.094.810 | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| P81L | c.242C>T | Exon 3 | 112.088.939 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| R38X | c.112C>T | Exon 2 | 112.087.916 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| S32X | c.95C>A | Exon 2 | 112.087.899 | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- SDHBsuccinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit BDeelt 3 aandoeningen
- MAXMYC associated transcriptional regulator XDeelt 2 aandoeningen
- SDHCsuccinate dehydrogenase complex subunit CDeelt 2 aandoeningen
- TMEM127transmembrane protein 127Deelt 2 aandoeningen
- RETret proto-oncogeneDeelt 1 aandoening
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit ADeelt 1 aandoening
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Deelt 1 aandoening
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SDHD
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SDHD kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the cardiovascular system
- Left ventricular hypertrophy
- Left ventricular noncompaction
- Left ventricular systolic dysfunction
- Mitral regurgitation
- Patent foramen ovale
- Stretched and thinned heart muscle
- Tricuspid regurgitation
- Abnormal left ventricular function
Toon 23 kenmerken meer
- Abnormality of the cardiovascular system
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Enlarged and thickened heart muscle
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
- Hypertensive retinopathy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
- Sinus tachycardia
- Abnormal atrioventricular conduction
- Arachnoid hemangiomatosis
- Cardiac failure
- Carotid paraganglioma
- Chronic noninfectious lymphadenopathy
- Disease of the heart muscle
- Facial telangiectasia
- Heart murmur
- Hypertensive crisis
- Inflammation of heart muscle
- Noncompaction cardiomyopathy
- Right ventricular failure
- Elevated heart rate
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Dystonia
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- Reduced brain N-acetyl aspartate level by MRS
- Babinski sign
Toon 20 kenmerken meer
- Brisk knee jerk
- Cranial nerve paralysis
- Episodic paroxysmal anxiety
- Generalized myoclonic seizure
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Motor delay
- Progressive degeneration of movement
- Progressive psychomotor deterioration
- Recurrent paroxysmal headache
- Upper limb hyperreflexia
- Communication delay
- Cranial nerve compression
- Focal myoclonic seizure
- Inability to move vocal cords
- Irritability
- Moderate global developmental delay
- Panic attack
- Tremor
- Dementia
- Loss of ability to walk
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SDHD-gen: succinate dehydrogenase complex subunit D. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/sdhd
Dante Labs. SDHD-gen: succinate dehydrogenase complex subunit D [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/sdhd
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken