Gen
ATP1A2
ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2
- HGNC 800↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000018625↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 477↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1q23.2
- Koordinater
- Kromosom 1: 160 115 759–160 143 591 (GRCh38)
- Eksoner
- 23 eksoner over 27,8 kb
- Protein
- 1 020 aminosyrer
- Også kjent som
- FHM2
- Tidligere symboler
- MHP2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000361216.8NM_000702.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/atp1a2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes ATP1A2 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Familiær hemiplegisk migrene
- Spekteret hemiplegisk migrene–utviklingsrelatert og epileptisk encefalopati
Et spekter der personer kan ha fenotyper som strekker seg fra hemiplegisk migrene uten epilepsi til utviklingsrelatert og epileptisk encefalopati, med eller uten episodisk hemiplegi eller andre former for parese. Symptomer og alvorlighetsgrad kan variere innen familier.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
- Migrene, familiær hemiplegisk, 2Autosomal dominant
Enhver familiær eller sporadisk hemiplegisk migrene der sykdommens årsak er en mutasjon i genet ATP1A2.
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Autosomal dominant
En migrenelidelse som kjennetegnes av individuell og familiehistorie med aura som inkluderer motorisk svakhet.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Familiær eller sporadisk hemiplegisk migreneAutosomal dominant
Hemiplegisk migrene (HM) er en sjelden variant av migrene med aura, som kjennetegnes av motorisk svakhet under auraen. Hemiplegisk migrene har to hovedformer, avhengig av familiehistorien: pasienter med minst én førstegrads- eller andregrads slektning som har aura med motorisk svakhet, har familiær hemiplegisk migrene (FHM); pasienter uten en slik familiehistorie har sporadisk hemiplegisk migrene (SHM).
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 6 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Bredere grupperinger
Epilepsi (fullstendig panel)
- Epilepsi
Ett av 171 gener knyttet til den
En hjernesykdom preget av episoder med unormalt økt nevronal aktivitet som gir forbigående sanse- eller bevegelsesforstyrrelser eller psykiske forstyrrelser. Disse episodene kan være forbundet med bevissthetstap eller kramper, eller ikke.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Slik er ATP1A2 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 5,4 kb av genets 27,8 kb, og 3 063 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av ATP1A2
121
posisjoner i ATP1A2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
6 av dem (5 %) ligger i regioner som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (6 steder)
En helgenomsekvensering dekker alle 27,8 kb av ATP1A2, inkludert introner, ikke bare de 5,4 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ADeler 3 tilstander
- SCN1Asodium voltage-gated channel alpha subunit 1Deler 3 tilstander
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deler 1 tilstand
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseDeler 1 tilstand
- ACTL6Bactin like 6BDeler 1 tilstand
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Deler 1 tilstand
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Deler 1 tilstand
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeler 1 tilstand
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Deler 1 tilstand
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 tilstand
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorDeler 1 tilstand
- ARXaristaless related homeoboxDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til ATP1A2
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene ATP1A2 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal cortical gyration
- Aplasia/Hypoplasia of the pyramidal tract
- Difficulty finding words
- Episodic hemiplegia
- Episodic quadriplegia
- Migraine
- More grooves in brain
- Weakness of one side of body
Vis 87 egenskaper til
- Abnormal speech pattern
- Confusion
- EEG abnormality
- Encephalopathy
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Intellectual disability
- Migraine with aura
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormality of coordination
- Ataxia
- Balance impairment
- Behavioral abnormality
- Coma
- Complex febrile seizure
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- Epilepsy
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Involuntary movements
- Loss of developmental milestones
- Neurodevelopmental delay
- Pins and needles feeling
- Progressive gait ataxia
- Refractory status epilepticus
- Seizure affecting one half of brain
- Tetraparesis
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Abnormal pyramidal sign
- Absent reflexes
- Absent speech development
- Aggressive behavior
- Alien limb phenomenon
- Attention deficit
- Autism
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Brain degeneration
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Chorea
- Choreoathetosis
- Clonic seizure
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with burst suppression
- EEG with generalized sharp slow waves
- Headache
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Inability to coordinate movements when walking
- Increased reflexes
- Jerking
- Lack of coordination of movement
- Language impairment
- Mental deterioration
- Paralysis on one side of body
- Paroxysmal dyskinesia
- Pauses in breathing while sleeping
- Perisylvian polymicrogyria
- Poor eye contact
- Repeated seizures without recovery between them
- Spontaneous pain sensation
- Thick corpus callosum
- Thin corpus callosum
- Tremor
- Unsteady walk
- Worsening neurological symptoms
- EEG with focal sharp waves
- Apraxia
- Brain imaging abnormality
- Drowsiness
- Episodic ataxia
Abnormality of the digestive system
- Nausea
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Inguinal hernia
Vis 5 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). ATP1A2-genet: ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/atp1a2
Dante Labs. ATP1A2-genet: ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/atp1a2
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker