Geen
SDHB
succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B
- HGNC 10681↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000117118↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6390↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1p36.13
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 17 018 722–17 054 032 (GRCh38)
- Eksonid
- 8 eksonit, ulatus 35,3 kb
- Valk
- 280 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Varasemad tähised
- SDH1, SDH
- MANE Select transkript
- ENST00000375499.8NM_003000.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Loe SDHB ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Pärilik feokromotsütoom ja paraganglioom
- Carney-Stratakise sündroomAutosoomne dominantne
Paraganglioomi ja seedetrakti stromaalse kasvaja kombinatsioon, mille põhjustavad variandid geenides SDH.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Jälgimine hõlmab nii paragangliome kui ka seedetrakti stromaalseid kasvajaid.
- Pärilik feokromotsütoomAutosoomne dominantne
Pärilik eelsoodumus neerupealise medulla katehhoolamiine tootvatele kasvajatele.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Biokeemiline sõeluuring ja pildidiagnostika võimaldavad kasvajad varakult avastada ja eemaldada.
- Pärilik feokromotsütoom-paraganglioomAutosoomne dominantne
Sündroomide rühm (PPGL tüübid 1–7, TMEM127- ja MAX-seotud), mille puhul geenide SDHB, SDHD, SDHC, SDHA, SDHAF2, MAX või TMEM127 variandid suurendavad feokromotsütoomi ja paragangliooma riski.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Regulaarne metanefriinide analüüs veres või uriinis ning perioodiline kogu keha MRT aitavad kasvajad varakult avastada, enne kui need põhjustavad vererõhukriise. Lähisugulastele võib pakkuda testimist.
Neerukasvaja
Neeru primaarne või metastaatiline pahaloomuline kasvaja.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Malignantne endokriinne neoplaasia
- Paragangliomad 4Autosoomne dominantne
Iga paragangliom, mille haiguse põhjuseks on SDHB geeni mutatsioon.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Kuseteede ja neerude kasvaja
- Kuseteede süsteemi neoplasm
Kuseteede süsteemi haarav healoomuline või pahaloomuline, esmane või metastaatiline neoplasm.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas SDHB on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1 kb kogupikkusega 35,3 kb; neist 843 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse SDHB
235
kohad geenis SDHB, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni SDHB 35,3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1 kb).
Variandid, millel on leht (87)
Siin on SDHB variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A15Hfs*4 | c.42_43insCACTCTCCTTGAGGCGCCGGTTGCCG | Ekson 1 | 17 053 977 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A15Sfs*3 | c.19_41dup | Ekson 1 | 17 053 978 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| A25Gfs*38 | c.71dup | Ekson 1 | 17 053 948 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| c.1A>G | Ekson 1 | 17 054 019 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.3G>A | Ekson 1 | 17 054 017 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.72+1G>T | Intron 1 | 17 053 947 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.73-2A>C | Intron 1 | 17 044 890 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.73-2A>T | Intron 1 | 17 044 890 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.200+1G>A | Intron 2 | 17 044 760 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.201-2A>C | Intron 2 | 17 033 147 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
- SDHDsuccinate dehydrogenase complex subunit DJagab 3 haigust
- VHLvon Hippel-Lindau tumor suppressorJagab 3 haigust
- BAP1BRCA1 associated deubiquitinase 1Jagab 2 haigust
- ELP4elongator acetyltransferase complex subunit 4Jagab 2 haigust
- FLCNfolliculinJagab 2 haigust
- MAXMYC associated transcriptional regulator XJagab 2 haigust
- METMET proto-oncogene, receptor tyrosine kinaseJagab 2 haigust
- PAX6paired box 6Jagab 2 haigust
- RETret proto-oncogeneJagab 2 haigust
- SDHAsuccinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit AJagab 2 haigust
- SDHAF2succinate dehydrogenase complex assembly factor 2Jagab 2 haigust
- SDHCsuccinate dehydrogenase complex subunit CJagab 2 haigust
Geeniga SDHB seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SDHB võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Delayed ability to stand
- Delayed ability to walk
- Elevated brain lactate level by MRS
- Falls
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Increased reflexes
- Irritability
- Leukodystrophy
Näita veel 29 tunnust
- Loss of developmental milestones
- Ataxia
- Babinski sign
- Brisk knee jerk
- Cranial nerve paralysis
- Dystonia
- Episodic paroxysmal anxiety
- Generalized myoclonic seizure
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Motor delay
- Progressive degeneration of movement
- Progressive psychomotor deterioration
- Recurrent paroxysmal headache
- Upper limb hyperreflexia
- Cancer of early nerve cells
- Communication delay
- Cranial nerve compression
- Delayed ability to sit
- Delayed speech and language development
- Epilepsy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Focal myoclonic seizure
- Headache
- Inability to move vocal cords
- Moderate global developmental delay
- Panic attack
- Tremor
- Dementia
- Loss of ability to walk
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormal left ventricular function
- Abnormality of the cardiovascular system
- Decrease in blood pressure upon standing up
- Elevated heart rate
- Enlarged and thickened heart muscle
- Fainting spell
- High blood pressure
- Hypertension associated with pheochromocytoma
Näita veel 16 tunnust
- Hypertensive retinopathy
- Left ventricular hypertrophy
- Palpitations
- Positive regitine blocking test
- Sinus tachycardia
- Swollen lymph nodes in center of chest
- Abnormal atrioventricular conduction
- Abnormal heart rate
- Arachnoid hemangiomatosis
- Cardiac failure
- Disease of the heart muscle
- Hypertensive crisis
- Inflammation of heart muscle
- Noncompaction cardiomyopathy
- Swollen lymph nodes
- Hives
Laboratory abnormality
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Increased circulating pyruvate concentration
- Increased urine alpha-ketoglutarate concentration
- Elevated urinary dopamine
- Elevated urinary epinephrine level
- Elevated urinary norepinephrine level
- High blood calcium levels
- High urine protein levels
Näita veel 4 tunnust
Abnormality of the endocrine system
- Adrenal pheochromocytoma
- Extraadrenal pheochromocytoma
- Paraganglioma
- Pheochromocytoma
- Adrenal overactivity
- Adrenocortical adenoma
- Paraganglioma of head and neck
- Chemodectoma
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SDHB geen: succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/sdhb
Dante Labs. SDHB geen: succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/sdhb
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast