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Gène

POGZ

pogo transposable element derived with ZNF domain

Résumé

Localisation cytogénétique
1q21.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 151 402 724–151 459 494 (GRCh38)
Exons
19 exons sur 56,8 kb
Protéine
1 410 acides aminés
Aussi appelé
KIAA0461, ZNF635, ZNF280E
Transcrit MANE Select
ENST00000271715.7NM_015100.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    • Déficience intellectuelle

      • L'un des 233 gènes qui lui sont liés

        • ClinGen classe ce lien comme définitif
        • 5 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort

    Structure de POGZ

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de POGZ. POGZ et 36 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 150 931 109 à 151 931 108.Chromosome 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44151 Mb151,2 Mb151,4 Mb151,6 Mb151,8 MbSETDB1 : 150 926 263–150 964 748, brin directSETDB1CERS2 : 150 959 099–150 977 396, brin inverseCERS2ANXA9 : 150 981 321–150 996 077, brin directANXA9MINDY1 : 150 995 125–151 008 376, brin inversePRUNE1 : 151 008 408–151 035 714, brin directBNIPL : 151 036 321–151 047 720, brin directC1orf56 : 151 047 746–151 051 986, brin directC1orf56CDC42SE1 : 151 050 242–151 070 325, brin inverseCDC42SE1MLLT11 : 151 054 177–151 069 544, brin directMLLT11GABPB2 : 151 070 514–151 130 109, brin directGABPB2SEMA6C : 151 131 685–151 147 813, brin inverseTIPE2 : 151 156 621–151 160 255, brin directSCNM1 : 151 156 664–151 179 006, brin directSCNM1LYSMD1 : 151 159 748–151 165 948, brin inverseTMOD4 : 151 169 984–151 176 284, brin inverseTMOD4VPS72 : 151 176 304–151 195 321, brin inverseVPS72PIP5K1A : 151 197 949–151 249 538, brin directPIP5K1APSMD4 : 151 254 709–151 279 502, brin directPSMD4ZNF687 : 151 281 502–151 292 180, brin directZNF687PI4KB : 151 291 792–151 328 394, brin inversePI4KBRFX5 : 151 340 640–151 347 339, brin inverseRFX5SELENBP1 : 151 364 157–151 372 716, brin inverseSELENBP1PSMB4 : 151 399 556–151 401 941, brin directPSMB4POGZ : 151 402 724–151 459 494, brin inversePOGZCGN : 151 510 139–151 538 692, brin directCGNTUFT1 : 151 540 305–151 583 583, brin directTUFT1SNX27 : 151 611 985–151 699 091, brin directSNX27CELF3 : 151 700 058–151 716 803, brin inverseCELF3RIIAD1 : 151 710 433–151 729 805, brin directRIIAD1MRPL9 : 151 759 643–151 763 522, brin inverseMRPL9OAZ3 : 151 762 899–151 771 334, brin directOAZ3TDRKH : 151 769 799–151 791 416, brin inverseTDRKHLINGO4 : 151 800 264–151 805 419, brin inverseLINGO4RORC : 151 806 021–151 831 845, brin inverseRORCC2CD4D : 151 837 818–151 840 557, brin inverseC2CD4DTHEM5 : 151 847 101–151 853 712, brin inverseTHEM5THEM4 : 151 870 866–151 909 879, brin inverseTHEM4Schéma de POGZ : 19 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 19 : 44 sites connus associés à une maladieExon 18 : 1 site connu associé à une maladieExon 17 : 4 sites connus associés à une maladieExon 16 : 2 sites connus associés à une maladieExon 15 : 5 sites connus associés à une maladieExon 14 : 6 sites connus associés à une maladieExon 13 : 5 sites connus associés à une maladieExon 12 : 3 sites connus associés à une maladieExon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 5 sites connus associés à une maladieExon 9 : 6 sites connus associés à une maladieExon 8 : 2 sites connus associés à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 4 sites connus associés à une maladieExon 5 : 2 sites connus associés à une maladieExon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 2 : 4 sites connus associés à une maladieExon 19 : 151 402 724–151 406 464, 3 741 basesExon 18 : 151 406 607–151 406 631, 25 basesExon 17 : 151 406 911–151 407 023, 113 basesExon 16 : 151 407 235–151 407 291, 57 basesExon 15 : 151 408 100–151 408 240, 141 basesExon 14 : 151 408 409–151 408 581, 173 basesExon 13 : 151 408 694–151 408 828, 135 basesExon 12 : 151 411 625–151 411 771, 147 basesExon 11 : 151 412 296–151 412 396, 101 basesExon 10 : 151 423 397–151 423 551, 155 basesExon 9 : 151 423 949–151 424 286, 338 basesExon 8 : 151 424 955–151 425 061, 107 basesExon 7 : 151 427 823–151 428 041, 219 basesExon 6 : 151 428 123–151 428 413, 291 basesExon 5 : 151 429 603–151 429 711, 109 basesExon 4 : 151 430 666–151 430 841, 176 basesExon 3 : 151 440 928–151 441 086, 159 basesExon 2 : 151 442 081–151 442 205, 125 basesExon 1 : 151 459 152–151 459 494, 343 bases191510515′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 6,7 kb sur les 56,8 kb du gène ; 4 233 de ces bases codent pour la protéine.

    Comment un test génomique lit POGZ

    110

    positions dans POGZ où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

    Un génome entier couvre les 56,8 kb de POGZ, introns compris, et pas seulement les 6,7 kb d'exons.

    D'où viennent ces informations

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène POGZ : pogo transposable element derived with ZNF domain. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pogz

    Vancouver

    Dante Labs. Gène POGZ : pogo transposable element derived with ZNF domain [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pogz

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