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Gène

SCNM1

sodium channel modifier 1

Résumé

Localisation cytogénétique
1q21.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 151 166 144–151 170 296 (GRCh38)
Exons
7 exons sur 4,2 kb
Protéine
230 acides aminés
Aussi appelé
MGC3180
Transcrit MANE Select
ENST00000368905.9NM_024041.4
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SCNM1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SCNM1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de SCNM1. SCNM1 et 32 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 150 668 220 à 151 668 219.Chromosome 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44150,8 Mb151 Mb151,2 Mb151,4 Mb151,6 MbGOLPH3L : 150 638 727–150 697 222, brin inverseGOLPH3LHORMAD1 : 150 698 059–150 720 895, brin inverseHORMAD1CTSS : 150 730 079–150 765 957, brin inverseCTSSCTSK : 150 794 880–150 809 577, brin inverseCTSKARNT : 150 808 617–150 876 771, brin inverseARNTCTXND2 : 150 887 136–150 913 292, brin directCTXND2SETDB1 : 150 926 263–150 964 748, brin directSETDB1CERS2 : 150 959 099–150 977 396, brin inverseCERS2ANXA9 : 150 981 321–150 996 077, brin directANXA9MINDY1 : 150 995 125–151 008 376, brin inversePRUNE1 : 151 008 408–151 035 714, brin directBNIPL : 151 036 321–151 047 720, brin directC1orf56 : 151 047 746–151 051 986, brin directC1orf56CDC42SE1 : 151 050 242–151 070 325, brin inverseCDC42SE1MLLT11 : 151 054 177–151 069 544, brin directMLLT11GABPB2 : 151 070 514–151 130 109, brin directGABPB2SEMA6C : 151 131 685–151 147 813, brin inverseTIPE2 : 151 156 621–151 160 255, brin directTIPE2LYSMD1 : 151 159 748–151 165 948, brin inverseLYSMD1SCNM1 : 151 166 144–151 170 296, brin directSCNM1TMOD4 : 151 169 984–151 176 284, brin inverseTMOD4VPS72 : 151 176 304–151 195 321, brin inversePIP5K1A : 151 197 949–151 249 538, brin directPSMD4 : 151 254 709–151 279 502, brin directPSMD4ZNF687 : 151 281 502–151 292 180, brin directZNF687PI4KB : 151 291 792–151 328 394, brin inversePI4KBRFX5 : 151 340 640–151 347 339, brin inverseRFX5SELENBP1 : 151 364 157–151 372 716, brin inverseSELENBP1PSMB4 : 151 399 556–151 401 941, brin directPSMB4POGZ : 151 402 724–151 459 511, brin inversePOGZCGN : 151 510 139–151 538 692, brin directCGNTUFT1 : 151 540 305–151 583 583, brin directTUFT1SNX27 : 151 611 985–151 699 091, brin directSNX27Schéma de SCNM1 : 7 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 4 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 151 166 144–151 166 203, 60 basesExon 2 : 151 166 471–151 166 541, 71 basesExon 3 : 151 166 934–151 167 022, 89 basesExon 4 : 151 167 121–151 167 218, 98 basesExon 5 : 151 167 326–151 167 414, 89 basesExon 6 : 151 168 144–151 168 338, 195 basesExon 7 : 151 168 986–151 170 296, 1 311 bases12345675′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,9 kb sur les 4,2 kb du gène ; 693 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SCNM1

1

position de SCNM1 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 4,2 kb de SCNM1, introns compris, et pas seulement les 1,9 kb d'exons.

Traits associés à SCNM1

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SCNM1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SCNM1 : sodium channel modifier 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/scnm1

Vancouver

Dante Labs. Gène SCNM1 : sodium channel modifier 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/scnm1

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