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Gène

SETDB1

SET domain bifurcated histone lysine methyltransferase 1

Résumé

Localisation cytogénétique
1q21.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 150 926 363–150 964 737 (GRCh38)
Exons
22 exons sur 38,4 kb
Protéine
1 292 acides aminés
Aussi appelé
KG1T, KIAA0067, ESET, KMT1E, TDRD21
Transcrit MANE Select
ENST00000692827.1NM_001366418.1
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de SETDB1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de SETDB1. SETDB1 et 35 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 150 445 550 à 151 445 549.Chromosome 11q21.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44150,6 Mb150,8 Mb151 Mb151,2 Mb151,4 MbRPRD2 : 150 363 091–150 476 999, brin directRPRD2TARS2 : 150 487 325–150 507 614, brin directTARS2ECM1 : 150 507 989–150 515 000, brin directECM1ADAMTSL4 : 150 549 369–150 560 937, brin directADAMTSL4MCL1 : 150 560 895–150 579 738, brin inverseMCL1ENSA : 150 599 671–150 629 633, brin inverseENSAGOLPH3L : 150 638 727–150 697 222, brin inverseGOLPH3LHORMAD1 : 150 698 059–150 720 895, brin inverseHORMAD1CTSS : 150 730 079–150 765 957, brin inverseCTSSCTSK : 150 794 880–150 809 577, brin inverseCTSKARNT : 150 808 617–150 876 771, brin inverseARNTCTXND2 : 150 887 136–150 913 292, brin directCTXND2SETDB1 : 150 926 363–150 964 737, brin directSETDB1CERS2 : 150 959 099–150 977 396, brin inverseCERS2ANXA9 : 150 981 321–150 996 077, brin directANXA9MINDY1 : 150 995 125–151 008 376, brin inverseMINDY1PRUNE1 : 151 008 408–151 035 714, brin directPRUNE1BNIPL : 151 036 321–151 047 720, brin directBNIPLC1orf56 : 151 047 746–151 051 986, brin directC1orf56CDC42SE1 : 151 050 242–151 070 325, brin inverseMLLT11 : 151 054 177–151 069 544, brin directGABPB2 : 151 070 514–151 130 109, brin directSEMA6C : 151 131 685–151 147 813, brin inverseSEMA6CTIPE2 : 151 156 621–151 160 255, brin directTIPE2SCNM1 : 151 156 664–151 179 006, brin directSCNM1LYSMD1 : 151 159 748–151 165 948, brin inverseLYSMD1TMOD4 : 151 169 984–151 176 284, brin inverseVPS72 : 151 176 304–151 195 321, brin inversePIP5K1A : 151 197 949–151 249 538, brin directPIP5K1APSMD4 : 151 254 709–151 279 502, brin directPSMD4ZNF687 : 151 281 502–151 292 180, brin directZNF687PI4KB : 151 291 792–151 328 394, brin inversePI4KBRFX5 : 151 340 640–151 347 339, brin inverseRFX5SELENBP1 : 151 364 157–151 372 716, brin inverseSELENBP1PSMB4 : 151 399 556–151 401 941, brin directPSMB4POGZ : 151 402 724–151 459 511, brin inversePOGZSchéma de SETDB1 : 22 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 150 926 363–150 926 517, 155 basesExon 2 : 150 927 704–150 927 974, 271 basesExon 3 : 150 929 967–150 930 118, 152 basesExon 4 : 150 939 940–150 939 974, 35 basesExon 5 : 150 941 329–150 941 428, 100 basesExon 6 : 150 942 563–150 942 688, 126 basesExon 7 : 150 942 852–150 943 053, 202 basesExon 8 : 150 943 920–150 943 993, 74 basesExon 9 : 150 944 918–150 945 108, 191 basesExon 10 : 150 946 886–150 947 012, 127 basesExon 11 : 150 949 122–150 949 278, 157 basesExon 12 : 150 949 367–150 949 525, 159 basesExon 13 : 150 950 458–150 951 090, 633 basesExon 14 : 150 951 365–150 951 481, 117 basesExon 15 : 150 959 178–150 959 347, 170 basesExon 16 : 150 960 563–150 961 191, 629 basesExon 17 : 150 962 130–150 962 158, 29 basesExon 18 : 150 962 587–150 962 719, 133 basesExon 19 : 150 962 974–150 963 139, 166 basesExon 20 : 150 963 530–150 963 741, 212 basesExon 21 : 150 963 995–150 964 083, 89 basesExon 22 : 150 964 247–150 964 737, 491 bases1225′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 4,4 kb sur les 38,4 kb du gène ; 3 879 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène SETDB1 : SET domain bifurcated histone lysine methyltransferase 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/setdb1

Vancouver

Dante Labs. Gène SETDB1 : SET domain bifurcated histone lysine methyltransferase 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/setdb1

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