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Gène

ALKBH8

alkB homolog 8, tRNA methyltransferase

Résumé

Localisation cytogénétique
11q22.3
Coordonnées
Chromosome 11 : 107 502 727–107 565 735 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 63 kb
Protéine
664 acides aminés
Aussi appelé
MGC10235, TRM9, TRMT9A
Transcrit MANE Select
ENST00000428149.7NM_138775.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

    Structure de ALKBH8

    • Séquence codante
    • Région non traduite
    • Intron
    • Sens de la transcription
    • Sites connus associés à une maladie
    • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
    Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de ALKBH8. ALKBH8 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 107 034 231 à 108 034 230.Chromosome 1111q22.3p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25107,2 Mb107,4 Mb107,6 Mb107,8 Mb108 MbCWF19L2 : 107 320 142–107 457 843, brin inverseCWF19L2ALKBH8 : 107 502 727–107 565 735, brin inverseALKBH8ELMOD1 : 107 591 079–107 666 971, brin directELMOD1SLN : 107 706 978–107 719 703, brin inverseSLNSLC35F2 : 107 790 455–107 928 293, brin inverseSLC35F2RAB39A : 107 928 448–107 968 143, brin directRAB39ACUL5 : 108 008 821–108 107 781, brin directCUL5Schéma de ALKBH8 : 12 exons sur le brin inverse du chromosome 11Exon 12 : 3 sites connus associés à une maladieExon 11 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 1 site connu associé à une maladieExon 12 : 107 502 727–107 505 215, 2 489 basesExon 11 : 107 510 887–107 511 036, 150 basesExon 10 : 107 522 299–107 522 555, 257 basesExon 9 : 107 525 441–107 525 592, 152 basesExon 8 : 107 532 300–107 532 406, 107 basesExon 7 : 107 549 753–107 549 823, 71 basesExon 6 : 107 551 808–107 551 912, 105 basesExon 5 : 107 553 108–107 553 203, 96 basesExon 4 : 107 553 847–107 553 978, 132 basesExon 3 : 107 556 766–107 557 003, 238 basesExon 2 : 107 560 765–107 560 899, 135 basesExon 1 : 107 565 601–107 565 735, 135 bases1210864215′3′

    Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

    Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

    Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

    Les exons représentent 4,1 kb sur les 63 kb du gène ; 1 995 de ces bases codent pour la protéine.

    Séquençage de ALKBH8

    0Faible

    Difficulté de séquençage de ALKBH8 avec des lectures courtes, sur 100

    • Cartographiabilité0 %
    • Homologie0 %
    • Répétitions1,5 %
    • Teneur en GC1,6 %
    • Couverture de référence0 %

    6

    positions dans ALKBH8 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène

    Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à couvrir.

    Un génome complet couvre les 63 kb de ALKBH8, introns compris, et pas seulement les 4,1 kb d'exons.

    Gènes liés aux mêmes affections

    Traits associés à ALKBH8

    L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que ALKBH8 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

    Liens externes

    D'où proviennent ces données

    • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
    • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
    • GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-17 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
    • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
    • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
    • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
    • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
    • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

    Citer cette page

    APA

    Dante Labs. (s.d.). Gène ALKBH8 : alkB homolog 8, tRNA methyltransferase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/alkbh8

    Vancouver

    Dante Labs. Gène ALKBH8 : alkB homolog 8, tRNA methyltransferase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/alkbh8

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