Geen
RYR1
ryanodine receptor 1
- HGNC 10483↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000196218↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 6261↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 19q13.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 19: 38 433 691–38 587 564 (GRCh38)
- Eksonid
- 106 eksonit, ulatus 153,9 kb
- Valk
- 5038 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Tuntud ka kui
- RYR, PPP1R137
- Varasemad tähised
- MHS, MHS1, CCO
- MANE Select transkript
- ENST00000359596.8NM_000540.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe RYR1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Kaasasündinud müopaatiad
- RYR1-ga seotud müopaatia
RYR1 variantide põhjustatud lihashaigused, sealhulgas tsentraalse südamiku ja multi-minicore haigus, mis ulatuvad kergest nõrkusest raske kaasasündinud müopaatiani.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
RYR1 variantide kandjatel võib olla pahaloomulise hüpertermia risk, seega tuleb enne igat operatsiooni sellest teavitada anesteesiaarsti.
Maligne hüpertermia eelsoodumus
- Autosoomne dominantne
Pärilik lihashaigus, mida põhjustavad peamiselt muutused geenides RYR1 või CACNA1S. Haigusega seoses võivad lenduvad anesteesiagaasid või suksametoonium käivitada kehatemperatuuri kiire tõusu, lihaste jäikuse ja lihaskoe lagunemise.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 5 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Kui teavitate anestesioloogi, saab kasutada anesteesiat, mis ei käivita reaktsiooni, ning see väldib reaktsioonid suures osas. Ohus võivad olla ka teie lähisugulased.
Müofibrillaarsed müopaatiad
- Müofibrillaarne müopaatia
Lihashaiguste rühm, mille puhul lihaskiudude kontraktiilne struktuur laguneb. Põhjustavad geenid nagu DES, CRYAB, MYOT, LDB3, FLNC ja BAG3.
- 2 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Kuna süda on sageli kaasatud, soovitatakse ka sümptomite puudumisel regulaarseid südameuuringuid (nagu EKG ja ehhokardiograafia).
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas RYR1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 15,4 kb kogupikkusega 153,9 kb; neist 15 117 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse RYR1
359
kohad geenis RYR1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni RYR1 153,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (15,4 kb).
Variandid, millel on leht (141)
Siin on RYR1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A152D | c.455C>A | Ekson 6 | 38 444 179 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A2200V | c.6599C>T | Ekson 40 | 38 496 265 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A2350T | c.7048G>A | Ekson 44 | 38 499 655 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A2428T | c.7282G>A | Ekson 45 | 38 499 975 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A2437V | c.7310C>T | Ekson 45 | 38 500 003 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A4338Gfs*238 | c.13013_13032del | Ekson 91 | 38 565 341 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| c.742G>C | Ekson 9 | 38 446 710 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.958-2_958del | Intron 10 | 38 448 646 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1021G>C | Ekson 11 | 38 448 712 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1925+1G>C | Intron 17 | 38 457 631 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
Samade haigustega seotud geenid
- BAG3BAG cochaperone 3Jagab 1 haigust
- CACNA1Scalcium voltage-gated channel subunit alpha1 SJagab 1 haigust
- CRYABcrystallin alpha BJagab 1 haigust
- DESdesminJagab 1 haigust
- FLNCfilamin CJagab 1 haigust
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 8Jagab 1 haigust
- KYkyphoscoliosis peptidaseJagab 1 haigust
- LDB3LIM domain binding 3Jagab 1 haigust
- MYOTmyotilinJagab 1 haigust
- PYROXD1pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1Jagab 1 haigust
- SVILsupervillinJagab 1 haigust
- TTNtitinJagab 1 haigust
Geeniga RYR1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida RYR1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Central core regions in muscle fibers
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Generalized muscle weakness
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Kyphoscoliosis
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Minicore myopathy
- Muscle degeneration
Näita veel 45 tunnust
- Muscle fiber degeneration
- Muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Thoracic kyphosis
- Excessive inward curvature of lower spine
- Fatigable weakness
- Generalized decreased muscle tone
- Low muscle tone
- Abnormally shaped muscle
- Axial muscle weakness
- Difficulty running
- Difficulty walking up stairs
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Double-Jointed
- EMG: myopathic abnormalities
- Gowers sign
- Hypertrophied muscle fibers
- Increased connective tissue
- Intermittent painful muscle spasms
- Internally nucleated skeletal muscle fibers
- Low muscle tone in trunk
- Multiple joint contractures
- Muscle stiffness
- Muscle tissue disease
- Muscular dystrophy
- Progressive muscle weakness
- Thin ribs
- Tired easily
- Type 1 muscle fiber atrophy
- Type 1 muscle fiber predominance
- Acute rhabdomyolysis
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Exercise-induced muscle cramps
- Exercise-induced rhabdomyolysis
- Flexed joint that cannot be straightened
- Frog-leg posture
- Necrotizing myopathy
- Prominent swayback
- Sternocleidomastoid amyotrophy
- Tibialis anterior muscle atrophy
- Breakdown of skeletal muscle
- Rigidity
- Type 1 and type 2 muscle fiber minicore regions
Abnormality of head or neck
- Broad nasal tip
- Deep philtrum
- High palate
- Low hanging columella
- Midface retrusion
- Myopathic facies
- Scaphocephaly
- Weakness of facial musculature
Näita veel 19 tunnust
- Eye folds
- Narrow forehead
- Bell's palsy
- Big head present at birth
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Receding chin
- Short neck
- Webbed neck
- Abnormal facial shape
- Abnormality of masseter muscle
- Bifid uvula
- Facial diplegia
- Long face
- Long, narrow head
- Narrow face
- Narrow mouth
- Prominent forehead
- Tented mouth
- Wide nasal bridge
Abnormality of limbs
- Abnormal foot muscles
- Ankle flexion contracture
- Club feet
- Dislocated hip since birth
- Distal upper limb muscle weakness
- Dropped arches
- Hyporeflexia of upper limbs
- Intrinsic hand muscle atrophy
Näita veel 14 tunnust
- Pelvic girdle muscle weakness
- Proximal lower limb muscle weakness
- Proximal upper limb muscle weakness
- Winged shoulder blade
- Areflexia of lower limbs
- High-arched foot
- Hip contracture
- Increased size of calf muscles
- Knee dislocation
- Long fingers
- Rectus femoris muscle atrophy
- Recurrent patellar dislocation
- Talipes
- Weak shoulder muscles
Abnormality of the respiratory system
- Respiratory function loss
- Functional respiratory abnormality
- High blood carbon dioxide level
- Increased respiratory rate or depth of breathing
- Crackles
- Neonatal asphyxia
- Reduced carbon dioxide in the blood
- Respiratory failure
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). RYR1 geen: ryanodine receptor 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ryr1
Dante Labs. RYR1 geen: ryanodine receptor 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ryr1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast