Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

LGALS4

galectin 4

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
19q13.2
Koordinaadid
Kromosoom 19: 38 801 674–38 812 945 (GRCh38)
Eksonid
10 eksonit, ulatus 11,3 kb
Valk
323 aminohapet
Tuntud ka kui
GAL4
MANE Select transkript
ENST00000307751.9NM_006149.4
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni LGALS4 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas LGALS4 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 19, millel on sulg kohal, kus asub LGALS4. LGALS4 ja sellele lähedal asuvad 36 geeni kromosoomil 19, vahemikus 38 307 310 kuni 39 307 309.Kromosoom 1919q13.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4338,4 Mb38,6 Mb38,8 Mb39 Mb39,2 MbYIF1B: 38 303 558–38 317 273, pöördne ahelYIF1BKCNK6: 38 319 813–38 333 553, otsene ahelKCNK6CATSPERG: 38 335 775–38 370 943, otsene ahelPSMD8: 38 374 563–38 383 850, otsene ahelGGN: 38 384 267–38 388 274, pöördne ahelGGNSPRED3: 38 388 421–38 399 588, otsene ahelSPRED3TSLIG3C: 38 403 093–38 409 088, otsene ahelTSLIG3CRASGRP4: 38 409 051–38 426 305, pöördne ahelRASGRP4RYR1: 38 433 691–38 595 273, otsene ahelRYR1MAP4K1: 38 587 641–38 619 161, pöördne ahelMAP4K1EIF3K: 38 619 055–38 636 959, otsene ahelEIF3KACTN4: 38 647 515–38 731 589, otsene ahelACTN4CAPN12: 38 730 187–38 769 904, pöördne ahelCAPN12LGALS7: 38 770 968–38 773 542, pöördne ahelLGALS7LGALS7B: 38 789 191–38 791 754, otsene ahelLGALS7BLGALS4: 38 801 674–38 812 945, pöördne ahelLGALS4ECH1: 38 815 415–38 831 874, pöördne ahelECH1: 38 817 471–38 840 178, pöördne ahelHNRNPL: 38 836 370–38 852 347, pöördne ahelRINL: 38 867 830–38 878 275, pöördne ahelRINLSIRT2: 38 878 555–38 900 501, pöördne ahelSIRT2NFKBIB: 38 899 700–38 908 893, otsene ahelNFKBIBCCER2: 38 908 980–38 912 252, pöördne ahelCCER2SARS2: 38 915 265–38 930 779, pöördne ahelSARS2: 38 915 404–38 949 855, pöördne ahelMRPS12: 38 930 917–38 937 406, otsene ahelFBXO17: 38 941 401–38 976 773, pöördne ahelFBXO27: 38 990 714–39 033 773, pöördne ahelFBXO27ACP7: 39 083 913–39 111 497, otsene ahelACP7PAK4: 39 125 728–39 182 816, otsene ahelPAK4NCCRP1: 39 196 917–39 201 884, otsene ahelNCCRP1SYCN: 39 202 825–39 204 283, pöördne ahelSYCNIFNL3: 39 243 455–39 245 250, pöördne ahelIFNL3IFNL4: 39 246 314–39 248 856, pöördne ahelIFNL4IFNL2: 39 268 396–39 270 188, otsene ahelIFNL2IFNL1: 39 296 407–39 298 673, otsene ahelIFNL1LRFN1: 39 306 566–39 320 966, pöördne ahelLRFN1LGALS4 skeem: 10 eksonit kromosoomi 19 pöördne ahelalEkson 10: 38 801 674–38 801 910, 237 alustEkson 9: 38 801 992–38 802 157, 166 alustEkson 8: 38 802 316–38 802 404, 89 alustEkson 7: 38 803 522–38 803 551, 30 alustEkson 6: 38 803 742–38 803 780, 39 alustEkson 5: 38 803 869–38 803 895, 27 alustEkson 4: 38 806 461–38 806 595, 135 alustEkson 3: 38 808 744–38 808 948, 205 alustEkson 2: 38 812 431–38 812 519, 89 alustEkson 1: 38 812 842–38 812 945, 104 alust10864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,1 kb kogupikkusega 11,3 kb; neist 972 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: LGALS4

2Lihtne

Kui raske on geeni LGALS4 lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Peaaegu kõik geeni LGALS4 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni LGALS4 eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Ühine chrY-ga0%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused0%
  • GC-sisaldus12%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). LGALS4 geen: galectin 4. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/lgals4

Vancouver

Dante Labs. LGALS4 geen: galectin 4 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/lgals4

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test