Geen
CACNA1S
calcium voltage-gated channel subunit alpha1 S
- HGNC 1397↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000081248↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 779↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1q32.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 201 039 512–201 112 426 (GRCh38)
- Eksonid
- 44 eksonit, ulatus 72,9 kb
- Valk
- 1873 aminohapet
- Tuntud ka kui
- Cav1.1, hypoPP
- Varasemad tähised
- HOKPP, MHS5, CACNL1A3
- MANE Select transkript
- ENST00000362061.4NM_000069.3
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cacna1s.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe CACNA1S ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Perekondlik perioodiline halvatus
- Perioodiline halvatusAutosoomne dominantne
Toimetaja märkus: ORDO klassifitseerib selle geneetilisena, kuid siin käsitleme seda neutraalsena
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Maligne hüpertermia eelsoodumus
- Autosoomne dominantne
Pärilik lihashaigus, mida põhjustavad peamiselt muutused geenides RYR1 või CACNA1S. Haigusega seoses võivad lenduvad anesteesiagaasid või suksametoonium käivitada kehatemperatuuri kiire tõusu, lihaste jäikuse ja lihaskoe lagunemise.
- ClinGen hindab seost tasemel mõõdukas
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Kui teavitate anestesioloogi, saab kasutada anesteesiat, mis ei käivita reaktsiooni, ning see väldib reaktsioonid suures osas. Ohus võivad olla ka teie lähisugulased.
Kuidas CACNA1S on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 6 kb kogupikkusega 72,9 kb; neist 5622 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: CACNA1S
133
CACNA1S positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu CACNA1S geeni 72,9 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 6 kb eksoneid.
Variandid, millel on leht (25)
Siin on CACNA1S variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.258+2T>C | Intron 2 | 201 110 162 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.1233-1G>A | Intron 9 | 201 083 323 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.3414+3A>T | Intron 26 | 201 060 655 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.4113+1G>A | Intron 33 | 201 050 983 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.4113+1G>C | Intron 33 | 201 050 983 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.4543+2T>C | Intron 37 | 201 047 523 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| c.4798-2A>G | Intron 39 | 201 043 533 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole | |
| D1650Ifs*73 | c.4947del | Ekson 40 | 201 043 381 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| E1348Rfs*76 | c.4038del | Ekson 33 | 201 051 058 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
| L938Yfs*26 | c.2812del | Ekson 22 | 201 065 878 | Patogeenne/tõenäoliselt patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
Geeniga CACNA1S seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CACNA1S võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Axial muscle weakness
- Episodic flaccid weakness
- Low muscle tone
- Abnormal muscle fiber morphology
- EMG abnormality
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Breakdown of skeletal muscle
- Exercise-induced muscle fatigue
Näita veel 17 tunnust
- Increased endomysial connective tissue
- Intermittent painful muscle spasms
- Muscle spasm
- Muscle stiffness
- Scoliosis
- Acute rhabdomyolysis
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Exercise-induced rhabdomyolysis
- Fatty replacement of skeletal muscle
- Late-onset proximal muscle weakness
- Muscle tissue disease
- Necrotizing myopathy
- Fatigable weakness of respiratory muscles
- Respiratory paralysis
- Muscle weakness
- Myotonia
Abnormality of the nervous system
- Motor delay
- Periodic hypokalemic paresis
- Periodic paralysis
- Paralysis
- Paralysis of all four limbs
- Decreased reflex response
- Diminished deep tendon reflex
- Tremor
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CACNA1S geen: calcium voltage-gated channel subunit alpha1 S. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cacna1s
Dante Labs. CACNA1S geen: calcium voltage-gated channel subunit alpha1 S [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cacna1s
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast