Gen
NIPBL
NIPBL cohesin loading factor
- HGNC 28862↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000164190↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 25836↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 5p13.2
- Souřadnice
- Chromozom 5: 36 876 769–37 066 413 (GRCh38)
- Exony
- 47 exonů na 189,6 kb
- Protein
- 2 804 aminokyselin
- Další názvy
- IDN3, DKFZp434L1319, FLJ11203, FLJ12597, FLJ13354, FLJ13648, Scc2
- Transkript MANE Select
- ENST00000282516.13NM_133433.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si NIPBL i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Cornelia de Lange Syndrome
A developmental disorder caused by variants in NIPBL, SMC1A, SMC3, RAD21, HDAC8 or BRD4, with a wide range of severity.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Diagnosis guides monitoring for associated problems such as reflux, heart defects, hearing and vision issues.
Jak je NIPBL uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 10,4 kb z 189,6 kb genu; 8 415 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte NIPBL
450
pozic v genu NIPBL, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 2 (0,4 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Segmental duplications (2 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 189,6 kb genu NIPBL, včetně intronů, nikoli jen 10,4 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s NIPBL
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit NIPBL. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Thick eyebrow
- Abnormally small head
- Boxer's nasal deformity
- Broad head shape
- Broad nasal tip
- Curly eyelashes
- Decreased volume of lip
- Delayed eruption of teeth
Zobrazit ještě 23 rysů
- Depressed nasal bridge
- Downturned corners of mouth
- High palate
- Highly arched eyebrow
- Little lower jaw
- Long eyelashes
- Long philtrum
- Low frontal hairline
- Low hairline at back of neck
- Monobrow
- Nasal tip, upturned
- Short neck
- Short nose
- Thin red part of the upper lip
- Widely spaced teeth
- Inflammation of eyelids
- Narrowing of the tear duct
- Smooth philtrum
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Cleft palate
- Increased nuchal translucency
- Narrow forehead
- Cleft upper lip
Abnormality of limbs
- Short foot
- Attachment of thumb close to wrist
- Fused toes
- Shortened 1st long bone of hand
- Small hand
- Smaller or shorter than typical limbs
- Bilateral single transverse palmar creases
- Curvature of little finger
Zobrazit ještě 19 rysů
- Elbow dislocation
- Fused forearm bones
- Limited elbow extension
- Single transverse palmar crease
- Webbed fingers or toes
- Abnormal morphology of ulna
- Curvature of digit
- Duplication of big toe bone
- Hip dislocation
- Oligodactyly
- Short fingers or toes
- Talipes
- Phocomelia
- Absent fingers
- Dislocated radial head
- Elbow flexion contracture
- Hypoplastic radial head
- Underdeveloped outer large forearm bone
- Webbed 2nd and 3rd toes
Abnormality of the nervous system
- Delayed CNS myelination
- Motor delay
- Repetitive movements
- Abnormally low-pitched voice
- Attention deficit
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
Zobrazit ještě 14 rysů
- Intellectual disability, severe
- Abnormal speech pattern
- Aggressive behavior
- Anxiety
- Autism spectrum disorder
- Difficulty sleeping
- Epilepsy
- Obsessive compulsive behavior
- Self-injurious behavior
- Absent/small cerebellum
- Autism
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Peripheral neuropathy
- Ventriculomegaly
Abnormality of the digestive system
- Poor suck
- Acid reflux
- Absent anus
- Feeding difficulties
- Feeding difficulties in infancy
- Anteriorly placed anus
- Inguinal hernia
- Intestinal malrotation
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of the eye
- Close sighted
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Drooping upper eyelid
- Phthisis bulbi
- Clouding of the lens of the eye
- Cross-eyed
- Glaucoma
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
Zobrazit ještě 4 rysů
Abnormality of the musculoskeletal system
- Spasticity and rigidity of muscles
- Delayed bone maturation
- Joint stiffness
- Abnormal formation of the hip
- Congenital diaphragmatic hernia
- Funnel chest
- Low muscle tone
- Permanent flexion of the finger or toe
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of the cardiovascular system
- Cutis marmorata
- Heart murmur
- Abnormal cardiovascular system morphology
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Enlarged heart
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Narrowing of pulmonic valve
- Patent foramen ovale
Zobrazit ještě 1 rys
Abnormality of the ear
- Absent ear canal
- Conductive deafness
- Ears rotated toward back of head
- Low-set ears
- Sensorineural hearing impairment
- Hearing impairment
- Large ears
- Abnormal incisura morphology
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen NIPBL: NIPBL cohesin loading factor. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/nipbl
Dante Labs. Gen NIPBL: NIPBL cohesin loading factor [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/nipbl
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů