Gen
CACNA1A
calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A
- HGNC 1388↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000141837↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 773↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 19p13.13
- Koordinater
- Kromosom 19: 13 206 442–13 506 479 (GRCh38)
- Eksoner
- 47 eksoner over 300 kb
- Protein
- 2 506 aminosyrer
- Også kjent som
- Cav2.1, EA2, APCA, HPCA, FHM
- Tidligere symboler
- CACNL1A4, SCA6, MHP1, MHP
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000360228.11NM_001127222.2
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cacna1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes CACNA1A og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Autosomale dominante cerebellare ataksier (SCA og DRPLA)
- Autosomal dominant cerebellar ataksiAutosomal dominant
En gruppe dominant arvelige ataksier, inkludert SCA1, SCA2, SCA3 (Machado-Joseph sykdom), SCA6, SCA7, SCA17, SCA27B og DRPLA, forårsaket av repeterte ekspansjoner eller punktvarianter i gener som ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, ATXN7, TBP, ATN1 og FGF14.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Genetisk veiledning og presymptomatisk testing for slektninger, fysioterapi og symptombehandling; enkelte former, som SCA27B, kan respondere på spesifikk medisinering.
Kompleks nevroutviklingsforstyrrelse med bevegelsessymptomer
Forårsaket av endringer i ett av flere gener som er involvert i hjernens utvikling og nervesignalering. Endringer i én kopi av KMT2B eller EMC1, ofte nye hos barnet, gir dominante former; endringer i begge kopier av ELP2, EMC1 eller PSMF1 gir recessive former.
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Behandlingen tilpasses genet og symptomene, med nevrologi, fysioterapi og utviklingsstøtte. Dyp hjernestimulering hjelper ofte ved KMT2B-relatert dystoni. Genetisk veiledning styrer testing i familien: foreldretesting ved dominante former og bærertesting ved recessive former.
Familiær hemiplegisk migrene
- Migrene, familiær hemiplegisk, 1Autosomal dominant
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Autosomal dominant
En migrenelidelse som kjennetegnes av individuell og familiehistorie med aura som inkluderer motorisk svakhet.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- Familiær eller sporadisk hemiplegisk migreneAutosomal dominant
Hemiplegisk migrene (HM) er en sjelden variant av migrene med aura, som kjennetegnes av motorisk svakhet under auraen. Hemiplegisk migrene har to hovedformer, avhengig av familiehistorien: pasienter med minst én førstegrads- eller andregrads slektning som har aura med motorisk svakhet, har familiær hemiplegisk migrene (FHM); pasienter uten en slik familiehistorie har sporadisk hemiplegisk migrene (SHM).
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Arvelige episodiske ataksier
- Arvelig episodisk ataksiAutosomal dominant
En gruppe dominant arvelige ataksier med anfall av balanseforstyrrelser, inkludert EA1 (KCNA1), EA2 (CACNA1A) og EA6 (SLC1A3).
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Episodisk ataksi type 2 responderer ofte på acetazolamid eller 4-aminopyridin, og unngåelse av kjente utløsere kan redusere antall anfall.
Bredere grupperinger
Epilepsi (fullstendig panel)
- Epilepsi
Ett av 171 gener knyttet til den
En hjernesykdom preget av episoder med unormalt økt nevronal aktivitet som gir forbigående sanse- eller bevegelsesforstyrrelser eller psykiske forstyrrelser. Disse episodene kan være forbundet med bevissthetstap eller kramper, eller ikke.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Arvelige nevrodegenerative sykdommer
- KIF5A-relatert nevrodegenerativ sykdomAutosomal dominant
Ett av 372 gener knyttet til den
Forårsaket av endringer i én kopi av KIF5A, som koder for et motorprotein med en halevedel som binder last. Ulike typer endringer fører til ulike tilstander: hereditær spastisk paraplegi type 10, en aksonal form av Charcot-Marie-Tooths sykdom og amyotrofisk lateralsklerose (ALS).
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Behandlingen er symptomatisk og avhenger av sykdomsbildet, og omfatter fysioterapi, legemidler mot spastisitet og tverrfaglig ALS-oppfølging. Hvert barn av en berørt person har 1 av 2 sjanse for å arve endringen; genetisk veiledning hjelper familier å forstå dette.
Slik er CACNA1A bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 8,6 kb av genets 300 kb, og 7 521 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av CACNA1A
368
posisjoner i CACNA1A der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.
En helgenomsekvensering dekker alle 300 kb av CACNA1A, inkludert introner, ikke bare de 8,6 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (402)
The CACNA1A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 227
- Patogen/sannsynligvis patogen 24
- Sannsynligvis patogen 151
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.5393C>T (p.Ser1798Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.5123T>C (p.Ile1708Thr) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4996C>T (p.Arg1666Trp) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4988G>A (p.Arg1663Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 4 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4987C>T (p.Arg1663Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4979G>A (p.Arg1660His) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4633C>T (p.Arg1545Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 4 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4519G>A (p.Ala1507Thr) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4064C>T (p.Thr1355Ile) (opens in a new tab) | migraine, familial hemiplegic, 1 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4052G>A (p.Arg1351Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4051C>T (p.Arg1351Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4043G>A (p.Arg1348Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4034G>A (p.Arg1345Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.4033C>T (p.Arg1345Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.3822+1G>A (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.3787G>A (p.Glu1263Lys) (opens in a new tab) | CACNA1A-related complex neurodevelopmental disorder and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.2980G>T (p.Glu994Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.2311A>T (p.Lys771Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.2137G>A (p.Val713Met) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.2131A>G (p.Ile711Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.2039_2040del (p.Gln680fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.2039del (p.Gln680fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.1994C>T (p.Thr665Met) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.1843A>C (p.Ser615Arg) (opens in a new tab) | migraine, familial hemiplegic, 1 and 1 other | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_001127222.2(CACNA1A):c.1745G>A (p.Arg582Gln) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 42 and 3 others | Patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
See all 402 with every other CACNA1A variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Deler 3 tilstander
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Deler 3 tilstander
- PUM1pumilio RNA binding family member 1Deler 3 tilstander
- SCN1Asodium voltage-gated channel alpha subunit 1Deler 3 tilstander
- ZFHX3zinc finger homeobox 3Deler 3 tilstander
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deler 2 tilstander
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Deler 2 tilstander
- ATN1atrophin 1Deler 2 tilstander
- ATXN1ataxin 1Deler 2 tilstander
- ATXN10ataxin 10Deler 2 tilstander
- ATXN2ataxin 2Deler 2 tilstander
- ATXN3ataxin 3Deler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til CACNA1A
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene CACNA1A kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Degeneration of cerebellum
- Epileptic encephalopathy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Migraine
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormal speech pattern
- Ataxia
Vis 110 egenskaper til
- Balance impairment
- Convulsive status epilepticus
- EEG abnormality
- EEG with focal sharp slow waves
- Encephalopathy
- Episodic hemiplegia
- Focal motor seizure
- Focal sensory seizure
- Inability to coordinate movements when walking
- Incoordination
- Intention tremor
- Migraine with aura
- Slurred speech
- Unsteady walk
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Abnormal head movements
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormality of coordination
- Aggressive behavior
- Atypical absence seizure
- Autism spectrum disorder
- Babinski sign
- Behavioral abnormality
- Choking episodes
- Complex febrile seizure
- Confusion
- CSF lymphocytic pleiocytosis
- CSF pleocytosis
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dissociated sensory loss
- Drowsiness
- Dystonia
- EEG with multifocal slow activity
- Epilepsy
- Falls
- Focal manual automatism seizure
- Focal pedal automatism seizure
- Generalized tonic seizure
- Grand mal seizures
- Increased reflexes
- Involuntary movements
- Irritability
- Jerking
- Lack of feeling, emotion, interest
- Loss of developmental milestones
- Mental deterioration
- Migraine without aura
- More active than typical
- Myoclonic seizure
- Neurodevelopmental delay
- Paralysis on one side of body
- Personality disorder
- Pins and needles feeling
- Progressive gait ataxia
- Sudden loss of muscle tone
- Tetraparesis
- Tremor
- Weakness of one side of body
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Abnormal pyramidal sign
- Absent reflexes
- Alien limb phenomenon
- Attention deficit
- Autism
- Brain degeneration
- Bulbar signs
- Can't control feelings
- Cerebellar vermis atrophy
- Chorea
- Choreoathetosis
- Coma
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Decreased vigilance
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty finding words
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with generalized sharp slow waves
- Focal impaired awareness seizure
- Focal tonic seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Headache
- Hypsarrhythmia
- Impaired temperature sensation
- Impulsivity
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Lack of coordination of movement
- Language impairment
- Loss of ability to walk
- Paroxysmal dyskinesia
- Psychosis
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Spontaneous pain sensation
- Tonic seizure
- Worsening neurological symptoms
- EEG with focal sharp waves
- Agitation
- Anxiety
- Brain imaging abnormality
- Damage to nerves that sense feeling
- Difficulty making arithmetical calculations
- Episodic ataxia
- Hallucinations of sound
- Visual hallucinations
Abnormality of the eye
- Difficulty seeing moving objects
- Gaze-evoked horizontal nystagmus
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal involuntary eye movements
- Abnormality of vision
- Blind spot
- Dilated pupil
- Double vision
Vis 18 egenskaper til
- Inward turning cross eyed
- Metamorphopsia
- Outward facing eye ball
- Photopsia
- Vertical nystagmus
- Cross-eyed
- Drooping upper eyelid
- Ocular flutter
- Oculomotor apraxia
- Seesaw nystagmus
- Amaurosis fugax
- Optic atrophy
- Retina degeneration
- Downbeat nystagmus
- Gaze-evoked nystagmus
- Impaired smooth pursuit
- Saccadic smooth pursuit interruptions
- Transient unilateral blurring of vision
Abnormality of the digestive system
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Gastrointestinal dysmotility
- Abdominal bloating
- Anorexia
- Constipation
- Diarrhea
- Nausea and vomiting
- Oral-pharyngeal dysphagia
Vis 4 egenskaper til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-18: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.18-8b139e39.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). CACNA1A-genet: calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/cacna1a
Dante Labs. CACNA1A-genet: calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/cacna1a
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker