Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

CALR

calreticulin

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
19p13.13
Koordinater
Kromosom 19: 12 938 609–12 944 489 (GRCh38)
Eksoner
9 eksoner over 5,9 kb
Protein
417 aminosyrer
Også kjent som
RO, SSA, cC1qR, CRT, FLJ26680, CALR1
MANE Select-transkripsjon
ENST00000316448.10NM_004343.4
Lokustype
gene with protein product
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser CALR ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er CALR bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Kromosom 19, med en parentes der CALR står. CALR og 42 gener i nærheten på kromosom 19, fra 12 441 549 til 13 441 548.Kromosom 1919p13.13p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4312,6 Mb12,8 Mb13 Mb13,2 Mb13,4 Mb: 12 433 103–12 484 816, bakover-strengZNF709: 12 461 184–12 513 854, bakover-strengZNF709: 12 461 559–12 551 474, bakover-strengZNF564: 12 524 903–12 551 542, bakover-strengZNF564: 12 525 720–12 580 975, bakover-strengZNF490: 12 575 832–12 640 098, bakover-strengZNF490ZNF791: 12 610 916–12 633 840, fremover-strengZNF791MAN2B1: 12 643 831–12 666 762, bakover-streng: 12 643 831–12 648 397, bakover-streng: 12 664 828–12 669 397, bakover-strengWDR83: 12 666 802–12 675 832, fremover-strengWDR83OS: 12 668 065–12 669 467, bakover-streng: 12 668 071–12 681 834, bakover-strengDHPS: 12 673 411–12 681 901, bakover-strengDHPSFBXW9: 12 687 801–12 696 659, bakover-strengFBXW9GNG14: 12 687 998–12 688 422, fremover-strengGNG14TNPO2: 12 699 111–12 724 011, bakover-strengTNPO2TRIR: 12 730 640–12 734 747, bakover-strengTRIRGET3: 12 737 139–12 748 325, fremover-strengGET3BEST2: 12 751 673–12 758 458, fremover-strengBEST2HOOK2: 12 762 640–12 872 740, bakover-strengHOOK2JUNB: 12 791 486–12 793 315, fremover-strengPRDX2: 12 796 817–12 801 882, bakover-strengTHSD8: 12 802 031–12 813 581, fremover-strengRNASEH2A: 12 806 505–12 813 644, fremover-strengRNASEH2ARTBDN: 12 825 477–12 838 362, bakover-strengRTBDNMAST1: 12 833 860–12 874 952, fremover-strengMAST1DNASE2: 12 875 209–12 881 595, bakover-strengKLF1: 12 884 405–12 887 201, bakover-strengGCDH: 12 891 128–12 915 261, fremover-strengSYCE2: 12 898 786–12 919 306, bakover-strengFARSA: 12 921 138–12 934 037, bakover-strengFARSACALR: 12 938 609–12 944 489, fremover-strengCALRRAD23A: 12 945 716–12 953 646, fremover-strengRAD23AGADD45GIP1: 12 950 701–12 957 333, bakover-strengGADD45GIP1DAND5: 12 965 159–12 974 760, fremover-strengNFIX: 12 995 401–13 098 796, fremover-strengNFIXLYL1: 13 099 028–13 103 188, bakover-strengLYL1TRMT1: 13 104 899–13 117 567, bakover-strengTRMT1NACC1: 13 116 468–13 141 147, fremover-strengNACC1STX10: 13 144 058–13 150 383, bakover-strengSTX10IER2: 13 150 403–13 156 981, fremover-strengIER2CACNA1A: 13 206 442–13 624 489, bakover-strengCACNA1ADiagram av CALR: 9 eksoner på fremover-strengen til kromosom 19Ekson 9: 2 kjente sykdomsfremkallende posisjonerEkson 1: 12 938 609–12 938 770, 162 baserEkson 2: 12 939 134–12 939 235, 102 baserEkson 3: 12 939 428–12 939 631, 204 baserEkson 4: 12 940 053–12 940 147, 95 baserEkson 5: 12 940 243–12 940 452, 210 baserEkson 6: 12 940 541–12 940 654, 114 baserEkson 7: 12 940 744–12 940 887, 144 baserEkson 8: 12 943 537–12 943 629, 93 baserEkson 9: 12 943 713–12 944 489, 777 baser1234567895′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 1,9 kb av genets 5,9 kb, og 1 254 av disse basene koder for proteinet.

Slik leser en genetisk test CALR

2

posisjoner i CALR der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.

En helgenomsekvensering dekker alle 5,9 kb av CALR, inkludert introner, og ikke bare de 1,9 kb med eksoner.

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). CALR-genet: calreticulin. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/calr

Vancouver

Dante Labs. CALR-genet: calreticulin [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/calr

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test