Gén
SMC1A
structural maintenance of chromosomes 1A
- HGNC 11111↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000072501↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 8243↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- Xp11.22
- Koordináták
- X. kromoszóma: 53 374 149–53 422 654 (GRCh38)
- Exonok
- 25 exon, összesen 48,5 kb
- Fehérje
- 1233 aminosav
- Más néven ismert
- DXS423E, KIAA0178, SB1.8, Smcb
- Korábbi jelölések
- SMC1L1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000322213.9NM_006306.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/smc1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a SMC1A-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Cornelia de Lange Syndrome
A developmental disorder caused by variants in NIPBL, SMC1A, SMC3, RAD21, HDAC8 or BRD4, with a wide range of severity.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Beavatkozhatóság
Diagnosis guides monitoring for associated problems such as reflux, heart defects, hearing and vision issues.
Epilepsy (Full Panel)
- X-Linked Complex Neurodevelopmental Disorder
A complex neurodevelopmental disorder that is transmitted via X-linked inheritance, and is characterized by intellectual disability, autism and epilepsy.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Epilepsy
A 171 hozzá kapcsolódó gén egyike
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A SMC1A felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 48,5 kb-jából 9,7 kb-ot tesznek ki; ezek közül 3702 bázis kódolja a fehérjét.
SMC1A szekvenálása
155
SMC1A-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem olyan régióba esik, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
A teljes genomszekvenálás a SMC1A gén mind a 48,5 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 9,7 kb-át.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 92 betegséget oszt meg
- ARXaristaless related homeobox2 betegséget oszt meg
- PCDH19protocadherin 192 betegséget oszt meg
- SLC35A2solute carrier family 35 member A22 betegséget oszt meg
- SYN1synapsin I2 betegséget oszt meg
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferase1 betegséget oszt meg
- ACTL6Bactin like 6B1 betegséget oszt meg
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 221 betegséget oszt meg
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A11 betegséget oszt meg
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit1 betegséget oszt meg
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 21 betegséget oszt meg
A(z) SMC1A génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SMC1A gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- EEG abnormality
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Hypsarrhythmia
Még 70 tulajdonság megjelenítése
- Infantile spasms
- Multifocal seizures
- Poor eye contact
- Repetitive movements
- Seizure affecting one half of brain
- Severe global developmental delay
- Abnormal gait
- Abnormality of movement
- Abnormally low-pitched voice
- Agitation
- Autism spectrum disorder
- Difficulty sleeping
- Intellectual disability
- Intellectual disability, severe
- Involuntary movements
- Loss of developmental milestones
- Loss of speech
- Stereotypical hand wringing
- Abnormal central motor function
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of the autonomic nervous system
- Anxiety
- Aplasia of the falx cerebri
- Apraxia
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Dystonia
- Hand apraxia
- Inability to coordinate movements when walking
- Inability to speak
- Inability to walk
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Lethargy
- Limb dystonia
- Limb myoclonus
- Loss of ability to walk
- Neonatal seizure
- Neural tube defect
- Obsessive compulsive behavior
- Oromotor apraxia
- Poor social interactions
- Restrictive behavior
- Sleep-wake cycle disturbance
- Specific learning disability
- Tongue thrusting
- Absent/small cerebellum
- Agenesis of corpus callosum
- Autism
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed motor skills
- Developmental stagnation
- Generalized myoclonic seizure
- Impaired pain sensation
- Inappropriate crying
- Inappropriate laughter
- Intellectual disability, mild
- Panic attack
- Peripheral neuropathy
- Pill-rolling tremor
- Poor speech
- Semilobar holoprosencephaly
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Cognitive impairment
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Dental crowding
- Highly arched eyebrow
- Midface retrusion
- Monobrow
- Narrow nose
- Receding chin
- Round face
Még 38 tulajdonság megjelenítése
- Short nose
- Triangular face
- Broad head shape
- Curly eyelashes
- Decreased volume of lip
- Delayed eruption of teeth
- Depressed nasal bridge
- Downturned corners of mouth
- High palate
- Little lower jaw
- Long eyelashes
- Long philtrum
- Low frontal hairline
- Low hairline at back of neck
- Nasal tip, upturned
- Short neck
- Thick eyebrow
- Widely spaced teeth
- Bifid uvula
- Central cleft upper lip
- Cleft palate
- Development of small head that was not present at birth
- Flat nose
- Inflammation of eyelids
- Smooth philtrum
- Big calvaria
- Blockage of the rear opening of the nasal cavity
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Facial asymmetry
- Increased nuchal translucency
- Mono nostril
- Narrow forehead
- Only one upper front tooth
- Proboscis
- Short philtrum
- Thin red part of the upper lip
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Prominent nasal bridge
Abnormality of limbs
- Curvature of digit
- Short foot
- Small hand
- Attachment of thumb close to wrist
- Fused toes
- Shortened 1st long bone of hand
- Smaller or shorter than typical limbs
- Bilateral single transverse palmar creases
Még 14 tulajdonság megjelenítése
- Curvature of little finger
- Elbow dislocation
- Fused forearm bones
- Abnormal morphology of ulna
- Abnormality of limbs
- Broad big toe
- Contracture of the proximal interphalangeal joint of the 3rd finger
- Hip dislocation
- Oligodactyly
- Talipes
- Tapered finger
- Webbed first and second toes
- Limited elbow movement
- Short fingers or toes
Abnormality of the musculoskeletal system
- Congenital diaphragmatic hernia
- Generalized decreased muscle tone
- Low muscle tone in trunk
- Permanent flexion of the finger or toe
- Scoliosis
- Spastic tetraparesis
- Spasticity and rigidity of muscles
- Delayed bone maturation
Még 12 tulajdonság megjelenítése
- Functional motor deficit
- Abnormal muscle tone
- Decreased muscle tone in infant
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Joint stiffness
- Low muscle tone
- Abnormal formation of the hip
- Abnormality of the skeletal system
- Flexed joint that cannot be straightened
- Funnel chest
- Hunched back
- Low muscle tone, in neonatal onset
Abnormality of the digestive system
- Acid reflux
- Feeding difficulties
- Poor suck
- Constipation
- Feeding difficulties in infancy
- Functional abnormality of the gastrointestinal tract
- Poor swallowing
- Vomiting
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the genitourinary system
- Hypospadias
- Multicystic kidney dysplasia
- Small labia majora
- Underdeveloped penis
- Undescended testes
- Vesicoureteral reflux
- Abnormality of the genitourinary system
- Abnormality of the uterus
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the cardiovascular system
- An opening in the wall separating the top two chambers of the heart
- Cutis marmorata
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Abnormal heart rate variability
- Abnormality of the heart
- Enlarged and thickened heart muscle
- Hole in heart wall separating two lower heart chambers
- Partial anomalous pulmonary venous return
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SMC1A gén: structural maintenance of chromosomes 1A. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/smc1a
Dante Labs. SMC1A gén: structural maintenance of chromosomes 1A [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/smc1a
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt