Geeni
CDH23
cadherin related 23
- HGNC 13733↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000107736↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 64072↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 10q22.1
- Koordinaatit
- Kromosomi 10: 71 396 920–71 815 947 (GRCh38)
- Eksonit
- 70 eksonia 419 kb:n alueella
- Proteiini
- 3 354 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tunnetaan myös nimellä
- CDHR23
- Aiemmat symbolit
- DFNB12, USH1D
- MANE Select -transkripti
- ENST00000224721.12NM_022124.6
- Lokustyyppi
- gene with protein product
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue CDH23 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Usherin oireyhtymä
- Autosomaalinen resessiivinen
Ryhmä resessiivisiä sairauksia (tyypit 1–4), jotka aiheuttavat sensorineuraalisen kuulonalenemän, etenevän retinitis pigmentosan ja joissakin tyypeissä tasapainohäiriöitä. Niihin liittyvät geenit ovat esimerkiksi USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 ja ARSG.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Varhainen diagnoysi auttaa päättämään kokleaarisen implantin ajoituksesta, silmätarkastusten seurannasta ja soveltuvuudesta verkkokalvohoitoa koskeviin tutkimuksiin, ja sillä on merkitystä kantajaseulonnassa.
Laajemmat ryhmät
Kuulonalenema ja kuurous
- Oireeton geneettinen kuulonalenema
Yksi 97 siihen liittyvästä geenistä
Perinnöllinen kuulonalenema ilman muita lääketieteellisiä oireita. Siihen kuuluvat yleiset resessiiviset muodot, joita aiheuttavat GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ja monet muut geenit, sekä dominantit, X-kromosomiin liittyvät ja mitokondriaaliset muodot.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Geneettisen syyn tunteminen voi ohjata kuulotukea ja sisäkorvaistutteen valintaa, auttaa arvioimaan osallistumismahdollisuutta geenihoitokokeisiin (esimerkiksi OTOF) ja tukea perheneuvontaa.
Periytyminen
- Autosomaalinen resessiivinen
- Tarvitaan muuttunut kopio kummaltakin vanhemmalta. Yhdellä olet kantaja ja yleensä oireeton. Kun molemmat vanhemmat ovat kantajia, kullakin lapsella on yksi neljästä mahdollisuudesta periä kaksi muuttunutta kopiota.
CDH23-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 11,1 kb geenin 419 kb:stä; 10 065 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä CDH23
449
CDH23-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 419 kb geenistä CDH23, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 11,1 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (3)
Tässä ovat CDH23-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| D127G | c.380A>G | Eksoni 6 | 71 511 163 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| P240L | c.719C>T | Eksoni 8 | 71 570 884 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| R2029W | c.6085C>T | Eksoni 47 | 71 791 167 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- MYO7Amyosin VIIAYhteisiä sairauksia: 2
- PCDH15protocadherin related 15Yhteisiä sairauksia: 2
- USH1CUSH1 protein network component harmoninYhteisiä sairauksia: 2
- WHRNwhirlinYhteisiä sairauksia: 2
- ACTG1actin gamma 1Yhteinen sairaus: 1
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Yhteinen sairaus: 1
- AFG2BAAA ATPase AFG2BYhteinen sairaus: 1
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Yhteinen sairaus: 1
- ARSGarylsulfatase GYhteinen sairaus: 1
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AYhteinen sairaus: 1
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Yhteinen sairaus: 1
- CABP2calcium binding protein 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin CDH23 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CDH23 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the endocrine system
- Abnormal pituitary gland morphology
- Decreased activity of gonads
- Decreased function of male gonad
- Elevated circulating thyroid-stimulating hormone concentration
- Enlarged pituitary gland
- Enlarged thyroid gland in neck
- Female hypogonadism
- Hypogonadotropic hypogonadism
Näytä 20 piirrettä lisää
- Increased circulating cortisol level
- Overactive thyroid
- Paradoxical increased cortisol secretion on dexamethasone suppression test
- Pituitary corticotropic cell adenoma
- Adrenocorticotropic hormone deficiency
- Adrenocorticotropin deficient adrenal insufficiency
- Central adrenal insufficiency
- Decreased circulating ACTH concentration
- Enlarged adrenal glands
- Increased circulating ACTH level
- Low thyroid gland function due to abnormal pituitary gland
- Secondary growth hormone deficiency
- Thyroid crisis
- Anterior hypopituitarism
- Delayed puberty
- Euthyroid hyperthyroxinemia
- Growth hormone excess
- Increased circulating gonadotropin level
- Increased circulating prolactin concentration
- Noncancerous tumor in pituitary gland
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormality of the cardiovascular system
- Capillary fragility
- High blood pressure
- Low blood pressure
- Palpitations
- Cardiac failure
- Fluid around heart
- Heart attack
Näytä 4 piirrettä lisää
Abnormality of the integument
- Abnormal hair quantity
- Buffalo hump
- Excessive hairiness
- Excessive sweating
- Paleness
- Patchy darkened skin
- Plethora
- Poor wound healing
Näytä 4 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CDH23-geeni: cadherin related 23. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cdh23
Dante Labs. CDH23-geeni: cadherin related 23 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cdh23
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa